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Sequenciamento de captura de DNA de ligação de metilo em tecidos de pacientes
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JoVE 杂志 遗传学
Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Sequenciamento de captura de DNA de ligação de metilo em tecidos de pacientes

DOI:
10.3791/54131-v

•

08:40 min

•

October 31, 2016

•

, , , , , , ,
1Department of Molecular Medicine,University of Texas Health Science Center at San Antonio, 2Greehey Children’s Cancer Research Institute,University of Texas Health Science Center at San Antonio

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:18Methyl-binding DNA Capture
  • 02:10Single Fraction Elution
  • 03:08Ethanol Precipitation
  • 04:29Sequencing
  • 05:58Results: Sequencing of Methyl-binding DNA Capture
  • 07:15Conclusion

Summary

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Aqui apresentamos um protocolo para investigar a metilação do DNA do genoma ampla em grande escala estudos de triagem de pacientes clínicos utilizando o Metil-Binding tecnologia de sequenciamento de DNA Captura (MBDCap-seq ou MBD-seq) eo gasoduto análise bioinformática subsequentes.

Tags

DNA MethylationEpigeneticsPatient CohortsBiomarkersMethyl-binding DNA CaptureSequencingGenome-wide AnalysisCost-effectiveSonicationFragment SizeElutionMagnetic Beads

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