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Los métodos para aumentar la sensibilidad de alta resolución de fusión polimorfismo de nucleótido único Genotipado de la Malaria
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Methods to Increase the Sensitivity of High Resolution Melting Single Nucleotide Polymorphism Genotyping in Malaria
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Los métodos para aumentar la sensibilidad de alta resolución de fusión polimorfismo de nucleótido único Genotipado de la Malaria

DOI:
10.3791/52839-v

•

10:27 min

•

November 10, 2015

•

, , , , , ,
1Department of Organismic and Evolutionary Biology,Harvard University, 2Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health, 3Faculty of Medicine and Pharmacy,Cheikh Anta Diop University, 4School of Nursing and Health Sciences,Simmons College, 5Institute of Infectious Diseases,Broad Institute

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:58Template Preparation
  • 03:46PCR Amplification
  • 05:37HRM Analysis
  • 08:26Results: Blocked-probe-based and MAAB Increases HRM Genotyping Sensitivity
  • 09:46Conclusion

Summary

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Si bien el análisis alta resolución de fusión ofrece la capacidad de diferenciar entre polimorfismos de nucleótido único en una población heterogénea, alelo mutante sesgo de amplificación puede aumentar su capacidad para detectar alelos presentes en porcentajes relativamente bajos dentro de una muestra. Este protocolo describe las mejoras que mejoran la sensibilidad del análisis de fusión de alta resolución.

Tags

MalariaPlasmodiumSingle-nucleotide Polymorphisms (SNPs)Drug ResistancePopulation SurveillanceHigh-resolution Melting (HRM) AnalysisPolygenomic InfectionsPCR AmplificationMinor AlleleGenotyping Sensitivity

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