Summary

Système d'efficacité et de dépistage des inhibiteurs Cytotoxicité ciblage intracellulaire<em> Mycobacterium tuberculosis</em

Published: April 05, 2017
doi:

Summary

Nous avons mis au point un système modulaire de criblage à haut débit pour la découverte de nouveaux composés contre la tuberculose Mycobacterium, ciblant les bactéries à croissance intracellulaire et en bouillon ainsi que cytotoxicité contre la cellule hôte mammifère.

Abstract

Mycobacterium tuberculosis, the causative agent of tuberculosis (TB), is a leading cause of morbidity and mortality worldwide. With the increased spread of multi drug-resistant TB (MDR-TB), there is a real urgency to develop new therapeutic strategies against M. tuberculosis infections. Traditionally, compounds are evaluated based on their antibacterial activity under in vitro growth conditions in broth; however, results are often misleading for intracellular pathogens like M. tuberculosis since in-broth phenotypic screening conditions are significantly different from the actual disease conditions within the human body. Screening for inhibitors that work inside macrophages has been traditionally difficult due to the complexity, variability in infection, and slow replication rate of M. tuberculosis. In this study, we report a new approach to rapidly assess the effectiveness of compounds on the viability of M. tuberculosis in a macrophage infection model. Using a combination of a cytotoxicity assay and an in-broth M. tuberculosis viability assay, we were able to create a screening system that generates a comprehensive analysis of compounds of interest. This system is capable of producing quantitative data at a low cost that is within reach of most labs and yet is highly scalable to fit large industrial settings.

Introduction

Mycobacterium tuberculosis, l'agent causal de la tuberculose (TB), est une des principales causes de morbidité et de mortalité dans le monde. TB sensible aux drogues est une maladie traitable qui nécessite de multiples antibiotiques pour une période de 6 mois. En dépit d' être une maladie curable, la tuberculose mortalité a été estimée à 1,5 million en 2015 1. Au cours des 10 dernières années, il y a eu des préoccupations croissantes quant à la prévalence de la tuberculose M. pharmacorésistante. TB multirésistante (MDR-TB) est définie comme la tuberculose qui est résistante à au moins l'isoniazide (INH) et rifampicine (RMP), et la plupart des souches de MDR-TB sont également résistantes à sélectionner des médicaments antituberculeux de deuxième ligne, limitant ainsi les options de traitement . Les effets de la résistance aux médicaments créent un plus grand défi pour le traitement des patients co-infectés par le virus de l'immunodéficience humaine (VIH); 400.000 patients dans le monde sont morts de la tuberculose associée au VIH en 2015 1. Il est décevant, la Food and Drug États-Unis Administration a approuvé un seul nouveau médicament contre la tuberculose MDR-TB, bédaquiline, au cours des 40 dernières années 2. Les progrès dans la recherche de meilleures thérapies et de la tuberculose plus courtes sont nécessaires de toute urgence afin de rester en tête dans la lutte contre la tuberculose et la tuberculose multirésistante.

Traditionnellement, les écrans de médicaments antituberculeux sont effectuées sous des conditions in vitro de la croissance dans un milieu de croissance, de sorte que les composés sont ajoutés à une culture en croissance et de leur efficacité dans l' élimination des micro – organismes sont déterminés en comptant les unités formant des colonies (CFU) sur un milieu solide. Comme UFC compte sont chronophage intensifs, la main-d'œuvre, et coûteuse, diverses méthodes indirectes ont été développées pour remédier à ce problème. Ces procédés comprennent le dosage de viabilité Alamar Bleu 3, la détermination de la fluorescence à partir de 4 protéine fluorescente verte (GFP) ou la luminescence 5 à partir de bactéries exprimant la luciférase, et l'estimation de l' adénosine triphosphate totale (ATP) 6, 7.

TB typique est caractérisée par une infection par M. tuberculosis du poumon, où les bactéries se trouvent et se répliquent à l' intérieur des phagosomes des macrophages alvéolaires 8. L'écran phénotypiques simple bouillon peut convenir à des agents pathogènes extracellulaires; Cependant, dans la perspective historique, ont frappé des composés contre M. tuberculosis identifiés en utilisant cette méthode ne parviennent souvent pas à la hauteur des attentes au cours des étapes de validation en aval dans les modèles d'infection. Nous proposons que médicaments contre la tuberculose est mieux réalisée dans un modèle d'infection de la cellule hôte intracellulaire. Néanmoins, les modèles intracellulaires possèdent de nombreux obstacles technologiques et biologiques au développement de criblage à haut débit (HTS). Un grand obstacle est la complexité du processus d'infection, illustrée par de nombreuses étapes et l'élimination complexe de bactéries extracellulaires par lavage entre-deux. Un deuxième obstacle majeur est le long temps requirements, comme la détection de la croissance, normalement effectuée par comptage CFU sur les plaques de culture, est un processus qui prend plus de 3 semaines. Une solution pour remplacer CFU chiffres a été fournie par microscopie à fluorescence automatisée en combinaison avec des bactéries fluorescentes. Cependant, cette solution nécessite un investissement initial de l'équipement qui est hors de portée pour de nombreux laboratoires de recherche. Un simple, à faible coût, et la méthode de HTS pertinente maladie améliorerait considérablement le processus de découverte de médicaments.

Dans cette étude, nous présentons un nouveau système modulaire qui HTS vise à fournir une réponse rapide et hautement évolutive, mais économique, dosage approprié pour déterminer l'activité des composés contre intracellulaire M. tuberculosis. Ce système est composé de trois modules: (i) intracellulaire, (ii) la cytotoxicité, et (iii) des essais in-bouillon. Le résultat final combiné fournit une description complète des propriétés du composé, avec des informations supplémentaires quant au mode d'action potentiel. cette scSystème écologisation a été utilisé dans plusieurs projets avec diverses banques de composés qui ciblent le mode d'action, y compris l'analyse de la synergie des médicaments 9, la stimulation de l' autophagie 10, et l'inhibition de M. tuberculosis -secreted facteur de virulence (non publié). Les composés de mode d'action inconnu ont également été étudiés 11. Une version modifiée de cette méthode a également été adoptée par notre partenaire industriel comme la principale méthode de criblage pour identifier de nouveaux composés contre la tuberculose intracellulaire M. 11.

Protocol

1. La souche bactérienne et la croissance moyenne Faire dextrose albumine et solution de réserve de sel (ADS) en solubilisant 25 g d'albumine de sérum bovin, 10,0 g de dextrose et 4,05 g de chlorure de sodium dans 460 ml d'eau déminéralisée. Filtre-stériliser l'ADS et stocker à 4 ° C. Ajouter le bouillon 7H9 en ajoutant 4,7 g de poudre 7H9 et 2 ml de glycerol à 900 mL d'eau purifiée. Autoclaver le bouillon 7H9 à 121 ° C pendant 10 minutes et laisser refroidir à la temp?…

Representative Results

Criblage intracellulaire à haut débit en utilisant M. tuberculosis exprimant le gène de la luciférase La figure 2A et le tableau 1 contiennent les données brutes recueillies par le luminomètre, exprimés en unités luminescentes relatives (RLU), montrant l'effet d'une concentration croissante de la rifampicine aux antituberculeux de M. tuberculosis dans les cellule…

Discussion

L'objectif de cette étude était de créer une méthode simple et rentable en utilisant un modèle HTS d'infection intracellulaire humaine pour M. tuberculosis. La tuberculose est une maladie humaine caractérisée par l'infection des macrophages alvéolaires par M. tuberculosis. En raison de problèmes de biosécurité, la recherche sur des modèles biologiques à la fois la bactérie et les cellules hôtes a été utilisé dans le passé. Cependant, il a été démontré que l'utilis…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This work was supported by BC Lung Association and Mitacs.

Materials

RPMI 1640 Sigma-Aldrich R5886
L-glutamine Sigma-Aldrich G7513
Fetal bovine serum (FBS) Thermo Fisher Scientific 12483020
Middlebrook 7H9 Becton, Dickinson and Company 271210
Tween80 Fisher Scientific T164
Albumin, Bovine pH7 Affymetrix 10857
Dextrose Fisher Scientific BP350
Sodium Chloride Fisher Scientific BP358
kanamycin sulfate Fisher Scientific BP906
PMA Sigma-Aldrich P8139
MTT Sigma-Aldrich M2128
N,N-Dimethylformamide (DMF) Fisher Scientific D131
1M Hydrocholoric acid (HCl) Fisher Scientific 351279212
Acetic acid Fisher Scientific 351269
SDS Fisher Scientific BP166
Resazurin Alfa Aesar B21187
DMSO Sigma-Aldrich D5879
Glycerol Fisher Scientific BP229
THP-1 American Type Culture Collection TIB-202
M. tuberculosis H37Rv
96-well flat bottom white plate Corning 3917
95-well flat bottom clear plate Corning 3595
Transparent plate sealer Thermo Fisher Scientific AB-0580
Spectrophotometer Thermo Fisher Scientific Biomate 3
Microplate spectrophotometer Biotek Epoch
luminometer Applied Biosystems Tropix TR717

References

  1. WHO. . Global tuberculosis report 2015. , (2016).
  2. Yajko, D. M., et al. Colorimetric method for determining MICs of antimicrobial agents for Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol. 33, 2324-2327 (1995).
  3. Khare, G., Kumar, P., Tyagi, A. K. Whole-cell screening-based identification of inhibitors against the intraphagosomal survival of Mycobacterium tuberculosis. Antimicrob Agents Chemother. 57, 6372-6377 (2013).
  4. Andreu, N., Fletcher, T., Krishnan, N., Wiles, S., Robertson, B. D. Rapid measurement of antituberculosis drug activity in vitro and in macrophages using bioluminescence. J Antimicrob Chemother. 67, 404-414 (2012).
  5. Mak, P. A., et al. A high-throughput screen to identify inhibitors of ATP homeostasis in non-replicating Mycobacterium tuberculosis. ACS Chem Biol. 7, 1190-1197 (2012).
  6. Pethe, K., et al. A chemical genetic screen in Mycobacterium tuberculosis identifies carbon-source-dependent growth inhibitors devoid of in vivo efficacy. Nat Commun. 1, 57 (2010).
  7. Hmama, Z., Pena-Diaz, S., Joseph, S., Av-Gay, Y. Immunoevasion and immunosuppression of the macrophage by Mycobacterium tuberculosis. Immunol Rev. 264, 220-232 (2015).
  8. Ramon-Garcia, S., et al. Synergistic drug combinations for tuberculosis therapy identified by a novel high-throughput screen. Antimicrob Agents Chemother. 55, 3861-3869 (2011).
  9. Lam, K. K., et al. Nitazoxanide stimulates autophagy and inhibits mTORC1 signaling and intracellular proliferation of Mycobacterium tuberculosis. PLoS Pathog. 8, e1002691 (2012).
  10. Sorrentino, F., et al. Development of an Intracellular Screen for New Compounds Able To Inhibit Mycobacterium tuberculosis Growth in Human Macrophages. Antimicrob Agents Chemother. 60, 640-645 (2015).
  11. Sun, J., et al. A broad-range of recombination cloning vectors in mycobacteria. Plasmid. 62, 158-165 (2009).
  12. . THP-1 (ATCC TIB-202) Available from: https://www.atcc.org/products/all/TIB-202.aspx (2016)
  13. Hansen, M. B., Nielsen, S. E., Berg, K. Re-examination and further development of a precise and rapid dye method for measuring cell growth/cell kill. J Immunol Methods. 119, 203-210 (1989).
  14. Invitrogen. . AlamarBlue assay. , (2008).
  15. . Handbook of anti-tuberculosis agents. Introduction. Tuberculosis (Edinb). 88 (2), 85-86 (2008).
  16. Riss, T. L., et al. . Cell Viability Assays. , (2004).
  17. Meyer, M., et al. In vivo efficacy of apramycin in murine infection models. Antimicrob Agents Chemother. 58, 6938-6941 (2014).
  18. Ballell, L., et al. Fueling open-source drug discovery: 177 small-molecule leads against tuberculosis. ChemMedChem. 8, 313-321 (2013).
  19. Grundner, C., Cox, J. S., Alber, T. Protein tyrosine phosphatase PtpA is not required for Mycobacterium tuberculosis growth in mice. FEMS Microbiol Lett. 287, 181-184 (2008).
  20. Wong, D., Bach, H., Sun, J., Hmama, Z., Av-Gay, Y. Mycobacterium tuberculosis protein tyrosine phosphatase (PtpA) excludes host vacuolar-H+-ATPase to inhibit phagosome acidification. Proc Natl Acad Sci U S A. 108, 19371-19376 (2011).
  21. Bach, H., Papavinasasundaram, K. G., Wong, D., Hmama, Z., Av-Gay, Y. Mycobacterium tuberculosis virulence is mediated by PtpA dephosphorylation of human vacuolar protein sorting 33B. Cell Host Microbe. 3, 316-322 (2008).
  22. Chanput, W., Peters, V., Wichers, H. . The Impact of Food Bioactives on Health: in vitro and ex vivo models. , 147-159 (2015).
  23. Maess, M. B., Wittig, B., Lorkowski, S. Highly efficient transfection of human THP-1 macrophages by nucleofection. J Vis Exp. , e51960 (2014).
  24. Ferguson, J. S., Weis, J. J., Martin, J. L., Schlesinger, L. S. Complement protein C3 binding to Mycobacterium tuberculosis is initiated by the classical pathway in human bronchoalveolar lavage fluid. Infect Immun. 72, 2564-2573 (2004).
  25. Andreu, N., et al. Optimisation of bioluminescent reporters for use with mycobacteria. PLoS One. 5, e10777 (2010).
  26. Queval, C. J., et al. A microscopic phenotypic assay for the quantification of intracellular mycobacteria adapted for high-throughput/high-content screening. J Vis Exp. , e51114 (2014).
  27. Christophe, T., et al. High content screening identifies decaprenyl-phosphoribose 2′ epimerase as a target for intracellular antimycobacterial inhibitors. PLoS Pathog. 5, e1000645 (2009).
  28. Pethe, K., et al. Discovery of Q203, a potent clinical candidate for the treatment of tuberculosis. Nat Med. 19, 1157-1160 (2013).

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Cite This Article
Zheng, X., Av-Gay, Y. System for Efficacy and Cytotoxicity Screening of Inhibitors Targeting Intracellular Mycobacterium tuberculosis. J. Vis. Exp. (122), e55273, doi:10.3791/55273 (2017).

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