Archaeen und Bakterien sind Prokaryoten. Kleine einzellige Organismen. Alle prokaryotischen Zellen sind von einer selektiv durchlässigen Plasmamembran umgeben, die von einer Peptidoglycan-Wand bedeckt sein kann, Polymeren aus Aminosäuren und Zuckern, was eine zusätzliche Schutzschicht ist, um sowohl den osmotischen Druck als auch die Gesamtform zu erhalten. Außerhalb der Hülle befindet sich eine zweite Schutzschicht. Die hydrophile Kapsel. Eine Polysaccharidwand, die die Adhäsion fördert. Im Inneren schweben mehrere Komponenten frei im Zytoplasma herum einschließlich des genetischen Materials. Anstelle eines Kerns ist die DNA als einfacher Doppelstrang im Mittelteil angeordnet, der als Nucleoid bezeichnet wird, wo sie mit frei schwebenden Proteinen interagieren kann. Kleinere, runde Stücke, Plasmide, sind physikalisch von dieser chromosomalen DNA getrennt und können sich unabhängig replizieren, was einen Vorteil beim Überleben bietet wie durch Antibiotikaresistenz. Abgesehen von den universellen strukturellen Ähnlichkeiten enthalten verschiedene Arten ihr spezifisches Protein und lipidgebundene Organellen. Beispielsweise besitzen Cyanobakterien Mikrokompartimente wie kohlenstoffbindende Carboxysomen und photosynthesefähige Thylakoide zur Lichtgewinnung bei sehr geringer Intensität, während magnetotaktische Bakterien Magnetosomen haben, die ihre Bewegung entlang magnetischer Feldlinien lenken. Andere Methoden sind Sporenbildung und das Einschließen zur Speicherung von überschüssigen Nährstoffen. Trotz ihres Rufs, einfache Strukturen zu besitzen mit einem geringen Grad an Zellkompartimentierung, haben sich prokaryotische Zellen angepasst, um in komplexen Umgebungen zu überleben.