Visual Dynamics는 Gromacs를 사용하여 분자 역학 시뮬레이션의 구현 및 학습을 가속화하는 오픈 소스 도구입니다. 제시된 프로토콜은 ACPYPE에서 준비된 단백질-리간드 시뮬레이션을 쉽게 수행하는 단계와 다른 시뮬레이션 모델에 대한 일반적인 단계를 안내합니다.