פרוטוקול זה מציע הליכי מעבדה הוליסטיים הנדרשים לאיתור פולימורפיזמים של נוקלאוטידים בודדים בדגימות סרטן קיבה המבוססים על פלטפורמת ריצוף מוליכים למחצה של יונים. רצפי היעד, מתאמי קשירה, הגברה וטיהור ספרייה וקריטריונים לבקרת איכות מתוארים גם הם בפירוט.