La combinaison de plusieurs modalités d’imagerie est souvent nécessaire pour obtenir une compréhension complète de la physiopathologie. Cette approche utilise des fantômes pour générer une transformation différentielle entre les systèmes de coordonnées de deux modalités, qui est ensuite appliquée pour le co-enregistrement. Cette méthode élimine le besoin de repères dans les scans de production.