Journal
/
Biochemistry
/
מחקרי אסוציאציה רב-גנומית בקנה מידה גדול (Mo-GWAS): קווים מנחים להכנת דגימות ונורמליזציה
JoVE Journal
Biochemistry
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

מחקרי אסוציאציה רב-גנומית בקנה מידה גדול (Mo-GWAS): קווים מנחים להכנת דגימות ונורמליזציה

DOI:
10.3791/62732-v

•

08:27 min

•

July 27, 2021

•

, ,
1Max-Planck-Institute of Molecular Plant Physiology, 2Center of Plant Systems Biology and Biotechnology

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:48Preparation of Biological Plant Material
  • 01:57Sample Extraction
  • 03:35UHPLC-MS Analysis of Semi-Polar Metabolites and Normalization of Large-Scale Metabolomics Dataset
  • 05:37Genome-Wide Association Studies (GWAS)
  • 06:26Results: Metabolomics Data Normalization and QTL Visualization
  • 07:45Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

בפרוטוקול זה אנו מציגים זרימת עבודה ממוטבת, המשלבת הכנת דגימות יעילה ומהירה של דגימות רבות. בנוסף, אנו מספקים מדריך שלב אחר שלב להפחתת וריאציות אנליטיות להערכת תפוקה גבוהה של מחקרי GWAS מטבוליים.

Tags

Multi-omicsGenome-wide Association StudiesMo-GWASSample PreparationNormalizationTechnical VariationBiological VarianceMetabolitesAnalytical PlatformGenotypic InformationPhenotypic InformationNatural PopulationFlash FreezingExtractionCentrifugationSolvent EvaporationGCMSUHPLC-MS

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

הכנת הדוגמא לזיהוי מבוססי ספקטרומטר מסה של RNA-איגוד אזורים

הגנום כולו כימות של תרגום ניצני שמרים על-ידי יצירת פרופיל ריבוזום

מבוסס על צלחת Large-scale טיפוח Caenorhabditis elegans: הכנת הדוגמא על המחקר של שינויים מטבוליים בחולי סוכרת

הכנה לדוגמא לתרסיס אלקטרונון מהמוני ספקטרומטר מונמטריה

Immunoprecipitation ללא תווית של זרימת עבודה בהיקפים גדולים של החברה ליצירת פרופיל רב-ממדי של Interactome גרעינית

הכנה לדוגמא להגשת מתקנים פרוטאומניקס וניתוח נתונים שלאחר מכן

צינור הכנה לדוגמה עבור מיקרוקריסטלים בקו הקרן VMXm

הכנת רשתות דגימה בטמפרטורה גבוהה עבור Cryo-EM

הכנה לדוגמה וכמות יחסית באמצעות מתילציה מופחתת של אמינים למחקרי פפטידומית

הכנה לדוגמה באמצעות שיטת חד שכבתית שומנים למחקרים קריסטלוגרפיים אלקטרונים

Read Article