Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization

Mustafa Bulut; Alisdair R. Fernie; Saleh Alseekh

doi:10.3791/62732

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Large-scale Multi-omics Genome-wide Association Studies (Mo-GWAS): Richtlinien für die Probenvorbereitung und Normalisierung

JoVE Journal
Biochemistry

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Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization

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Large-scale Multi-omics Genome-wide Association Studies (Mo-GWAS): Richtlinien für die Probenvorbereitung und Normalisierung

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08:27 min

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July 27, 2021

DOI:

10.3791/62732-v

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10.3791/62732-v

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08:27 min

July 27, 2021

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Mustafa Bulut¹, Alisdair R. Fernie^1,2, Saleh Alseekh^1,2

¹Max-Planck-Institute of Molecular Plant Physiology, ²Center of Plant Systems Biology and Biotechnology

Summary

In diesem Protokoll stellen wir einen optimierten Workflow vor, der eine effiziente und schnelle Probenvorbereitung vieler Proben kombiniert. Darüber hinaus bieten wir eine Schritt-für-Schritt-Anleitung zur Reduzierung analytischer Variationen für die Hochdurchsatzbewertung metabolischer GWAS-Studien.

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Multi-omics Genome-wide Association Studies Mo-GWAS Sample Preparation Normalization Technical Variation Biological Variance Metabolites Analytical Platform Genotypic Information Phenotypic Information Natural Population Flash Freezing Extraction Centrifugation Solvent Evaporation GCMS UHPLC-MS

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