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Visualisierung und Quantifizierung hochdimensionaler Zytometriedaten mit Cytofast und den Upstream Clustering Methods FlowSOM und Cytosplore
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Visualization and Quantification of High-Dimensional Cytometry Data using Cytofast and the Upstream Clustering Methods FlowSOM and Cytosplore
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Visualisierung und Quantifizierung hochdimensionaler Zytometriedaten mit Cytofast und den Upstream Clustering Methods FlowSOM und Cytosplore

Deutsch

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December 12, 2019

DOI:

10.3791/60525-v

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10.3791/60525-v

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December 12, 2019

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1Department of Immunohematology and Blood Transfusion,Leiden University Medical Center, 2Department of Parasitology,Leiden University Medical Center

Summary

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Cytofast ist ein Visualisierungstool, das zum Analysieren der Ausgabe aus Clustering verwendet wird. Cytofast kann verwendet werden, um zwei Clustering-Methoden zu vergleichen: FlowSOM und Cytosplore. Cytofast kann schnell einen quantitativen und qualitativen Überblick über Massenzytometriedaten generieren und die Hauptunterschiede zwischen verschiedenen Clustering-Algorithmen hervorheben.

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Beyrend, G., Stam, K., Ossendorp, F., Arens, R. Visualization and Quantification of High-Dimensional Cytometry Data using Cytofast and the Upstream Clustering Methods FlowSOM and Cytosplore. J. Vis. Exp. (154), e60525, doi:10.3791/60525 (2019).

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