Visualisatie en kwantificering van High-dimensionale Cytometrie gegevens met behulp van Cytofast en de upstream clustering methoden FlowSOM en Cytosplore
Visualisatie en kwantificering van High-dimensionale Cytometrie gegevens met behulp van Cytofast en de upstream clustering methoden FlowSOM en Cytosplore
Cytofast is een visualisatietool die wordt gebruikt om de uitvoer van clustering te analyseren. Cytofast kan worden gebruikt om twee clustering methoden te vergelijken: Flowsom en cytosplore. Cytofast kan snel een kwantitatief en kwalitatief overzicht van Mass cytometrie gegevens genereren en de belangrijkste verschillen tussen verschillende clustering algoritmen benadrukken.
Beyrend, G., Stam, K., Ossendorp, F., Arens, R. Visualization and Quantification of High-Dimensional Cytometry Data using Cytofast and the Upstream Clustering Methods FlowSOM and Cytosplore. J. Vis. Exp. (154), e60525, doi:10.3791/60525 (2019).