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Morphologie-basierte Unterscheidung zwischen gesunden und pathologischen Zellen mittels Fourier-Transformationen und Self-Organizing Maps
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October 28, 2018
DOI:
1Department of Chemical and Product Safety,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Deutsches Rheuma-Forschungszentrum (DRFZ) Berlin, a Leibniz Institute, 3Charité Universitätsmedizin Berlin, 4Applied Systems Biology,Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology Hans Knöll Institute
Summary
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Hier bieten wir einen Workflow, der die Identifizierung von gesunden und pathologischen Zellen basierend auf ihre 3-dimensionale Form erlaubt. Wir beschreiben den Prozess der Verwendung 2D-Projektion Umrisse anhand der 3D-Oberflächen, um ein Self-Organizing-Map zu trainieren, die Objektive clustering der untersuchten Zellpopulationen bieten wird.
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Kriegel, F. L., Köhler, R., Bayat-Sarmadi, J., Bayerl, S., Hauser, A. E., Niesner, R., Luch, A., Cseresnyes, Z. Morphology-Based Distinction Between Healthy and Pathological Cells Utilizing Fourier Transforms and Self-Organizing Maps. J. Vis. Exp. (140), e58543, doi:10.3791/58543 (2018).
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