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Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes
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Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis
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Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes

français

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10:05 min

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December 12, 2017

DOI:

10.3791/56085-v

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10.3791/56085-v

•

10:05 min
December 12, 2017

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1Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, 2Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Summary

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Nous présentons une immunoprécipitation de la chromatine native mis à jour le séquençage (ChIP-seq) méthodologie pour la production d’ensembles de données de séquence pour un cadre d’analyse des nucléosomes densité ChIP-seq intégrant l’accessibilité nucléase micrococcique (MNase) avec mesures de modification d’histone.

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Native Chromatin ImmunoprecipitationNucleosome Density AnalysisEpigeneticsEpigenomic FeaturesChromatin SignaturesMNaseCell PreparationLysis BufferMNase DigestionEDTA

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Lorzadeh, A., Lopez Gutierrez, R., Jackson, L., Moksa, M., Hirst, M. Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis. J. Vis. Exp. (130), e56085, doi:10.3791/56085 (2017).

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