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12:53 min
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June 14, 2017
DOI:
1UCLA AIDS Institute,University of California at Los Angeles (UCLA), 2Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics,University of California at Los Angeles (UCLA), 3Departments of Biomathematics and Mathematics,University of California at Los Angeles (UCLA), 4Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups,Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, 5Department of Medicine,University of California at Los Angeles (UCLA), 6Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine,The Ohio State University (OSU)
Summary
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Questo manoscritto descrive la procedura sperimentale e l'analisi del software per un test di sito di integrazione bidirezionale che può contemporaneamente analizzare il DNA di giunzione vettoriale-host a monte ea valle. I prodotti bidirezionali di PCR possono essere usati per qualsiasi piattaforma di sequencing a valle. I dati risultanti sono utili per un confronto quantitativo e ad alto rendimento dei target integrati del DNA.
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Suryawanshi, G. W., Xu, S., Xie, Y., Chou, T., Kim, N., Chen, I. S. Y., Kim, S. Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow. J. Vis. Exp. (124), e55812, doi:10.3791/55812 (2017).
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