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12:53 min
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June 14, 2017
DOI:
1UCLA AIDS Institute,University of California at Los Angeles (UCLA), 2Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics,University of California at Los Angeles (UCLA), 3Departments of Biomathematics and Mathematics,University of California at Los Angeles (UCLA), 4Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups,Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, 5Department of Medicine,University of California at Los Angeles (UCLA), 6Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine,The Ohio State University (OSU)
Summary
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Ce manuscrit décrit la procédure expérimentale et l'analyse de logiciel pour un test de site d'intégration bidirectionnelle qui peut analyser simultanément l'ADN de jonction vecteur-hôte en amont et en aval. Les produits de PCR bidirectionnels peuvent être utilisés pour toute plate-forme de séquençage en aval. Les données résultantes sont utiles pour une comparaison quantitative à haut débit des cibles intégrées d'ADN.
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Suryawanshi, G. W., Xu, S., Xie, Y., Chou, T., Kim, N., Chen, I. S. Y., Kim, S. Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow. J. Vis. Exp. (124), e55812, doi:10.3791/55812 (2017).
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