Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project

Francis R. G. Amrit; Arjumand Ghazi

doi:10.3791/55473

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Análisis de transcriptómica C. elegans ARN secuencia de datos a través de la suite smoking en el Proyecto Galaxy

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Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project

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Análisis de transcriptómica C. elegans ARN secuencia de datos a través de la suite smoking en el Proyecto Galaxy

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10:19 min

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April 08, 2017

DOI:

10.3791/55473-v

DOI:

10.3791/55473-v

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10:19 min

April 08, 2017

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Francis R. G. Amrit¹, Arjumand Ghazi¹

¹Department of Pediatrics,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

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Galaxy y David se han convertido en herramientas populares que permiten a los investigadores sin formación bioinformática para analizar e interpretar los datos de RNA-Seq. Se describe un protocolo para C. elegans los investigadores realizar RNA-Seq experimentos, acceder y procesar el conjunto de datos usando Galaxy y obtener información biológica significativa de las listas de genes usando DAVID.

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