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Clasificación negativa de neuronas de núcleos activados por fluorescencia combinada con secuenciación de ARN de núcleos únicos para estudiar el nicho neurogénico del hipocampo
JoVE Journal
Nörobilim
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JoVE Journal Nörobilim
Fluorescence-Activated Nuclei Negative Sorting of Neurons Combined with Single Nuclei RNA Sequencing to Study the Hippocampal Neurogenic Niche

Clasificación negativa de neuronas de núcleos activados por fluorescencia combinada con secuenciación de ARN de núcleos únicos para estudiar el nicho neurogénico del hipocampo

DOI:

08:16 min

October 20, 2022

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Bölümler

  • 00:04Introduction
  • 01:08Dissection of the Dentate Gyrus (DG)
  • 01:53Tissue Dissociation, Single Nuclei Isolation, and Anti-NeuN Immunostaining
  • 04:03Fluorescence Activated Nuclei Sorting (FANS) to Exclude Neuronal Populations
  • 05:12Preparation of the Single Nuclei Suspension to Perform Single Nuclei RNA Sequencing
  • 05:59Results: Preparation of a Suspension of Non-Neuronal Single Nuclei Isolated from the Dentate Gyrus (DG)
  • 07:51Conclusion

Özet

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Aquí se presenta un método para secuenciar núcleos individuales aislados del giro dentado de ratón que excluye la mayoría de las neuronas a través de la clasificación de núcleos activados por fluorescencia (FAN). Este enfoque genera perfiles de expresión de alta calidad y facilita el estudio de la mayoría de los otros tipos de células representadas en el nicho, incluidas las poblaciones escasas, como las células madre neurales.

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