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Un ensayo celular basado en reporteros para monitorear la eficiencia del empalme
JoVE Journal
Biyokimya
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JoVE Journal Biyokimya
A Reporter Based Cellular Assay for Monitoring Splicing Efficiency

Un ensayo celular basado en reporteros para monitorear la eficiencia del empalme

DOI:

08:53 min

September 15, 2021

, ,

Bölümler

  • 00:04Introduction
  • 00:31Cotransfection of HeLa Cells with the Reporter and U1 Small Nuclear RNA (snRNA) Plasmids
  • 02:0032P-Labeling of Oligonucleotides
  • 02:52Analysis of the Spliced Reporter Transcripts by Primer Extension
  • 03:53Analysis of the Spliced Reporter Transcripts by Fluorescent RT-PCR
  • 05:08Analysis of Variant U1 snRNA Expression by RT-qPCR
  • 05:38Setup and Running of Urea-PAGE Gels
  • 06:27Results: Reporter Based Splicing Efficiency of U1 snRNA Constructs
  • 08:09Conclusion

Özet

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Este protocolo describe un ensayo de reportero de minigenes para monitorear el impacto de las mutaciones del sitio de empalme 5'en el empalme y desarrolla snRNA supresor U1 para el rescate de la inhibición del empalme inducida por la mutación. Las construcciones de snRNA U1 reportero y supresor se expresan en células HeLa, y el empalme se analiza por extensión de cebador o RT-PCR.

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