Dergi
/
Biyokimya
/
JUMPn: Proteomikte Protein Ko-İfade Kümelemesi ve Ağ Analizi için Kolaylaştırılmış Bir Uygulama
JoVE Journal
Biyokimya
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir.  Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
JoVE Journal Biyokimya
JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

JUMPn: Proteomikte Protein Ko-İfade Kümelemesi ve Ağ Analizi için Kolaylaştırılmış Bir Uygulama

2,849 Views

•

07:28 min

•

October 19, 2021

DOI:

10.3791/62796-v

DOI:
10.3791/62796-v

•

07:28 min
October 19, 2021

•

14 Views
, , , , , , , ,
1Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Center for Proteomics and Metabolomics,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Department of Computational Biology,St. Jude Children’s Research Hospital

Özet

Automatically generated

Kantitatif proteomik veriler için ağ analizini gerçekleştirmek ve görselleştirmek için bir sistem biyolojisi aracı JUMPn'ı, veri ön işleme, birlikte ekspresyon kümeleme, yol zenginleştirme ve protein-protein etkileşim ağı analizi dahil olmak üzere ayrıntılı bir protokolle sunuyoruz.

Explore More Videos

Protein Co-expressionClusteringNetwork AnalysisProteomicsJUMPn SoftwareCo-expression ClusteringPathway EnrichmentPPI Module DetectionUser-friendly InterfaceInteractive VisualizationPhosphoproteomicsInteractome DataWGCNA AlgorithmCo-expression PatternsTrends PlotPathway Ontology Enrichment Heatmap

Read Article

Cite this Article

Vanderwall, D., Suresh, P., Fu, Y., Cho, J., Shaw, T. I., Mishra, A., High, A. A., Peng, J., Li, Y. JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics. J. Vis. Exp. (176), e62796, doi:10.3791/62796 (2021).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy