Dergi
/
Biyokimya
/
JUMPn: оптимизированное приложение для кластеризации коэкспрессии белка и сетевого анализа в протеомике
JoVE Journal
Biyokimya
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliği gereklidir.  Oturum açın veya ücretsiz deneme sürümünü başlatın.
JoVE Journal Biyokimya
JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

JUMPn: оптимизированное приложение для кластеризации коэкспрессии белка и сетевого анализа в протеомике

2,849 Views

•

07:28 min

•

October 19, 2021

DOI:

10.3791/62796-v

DOI:
10.3791/62796-v

•

07:28 min
October 19, 2021

•

14 Views
, , , , , , , ,
1Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Center for Proteomics and Metabolomics,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Department of Computational Biology,St. Jude Children’s Research Hospital

Özet

Automatically generated

Мы представляем инструмент системной биологии JUMPn для выполнения и визуализации сетевого анализа количественных данных протеомики с подробным протоколом, включающим предварительную обработку данных, кластеризацию коэкспрессии, обогащение путей и сетевой анализ белково-белкового взаимодействия.

Explore More Videos

Protein Co-expressionClusteringNetwork AnalysisProteomicsJUMPn SoftwareCo-expression ClusteringPathway EnrichmentPPI Module DetectionUser-friendly InterfaceInteractive VisualizationPhosphoproteomicsInteractome DataWGCNA AlgorithmCo-expression PatternsTrends PlotPathway Ontology Enrichment Heatmap

Read Article

Cite this Article

Vanderwall, D., Suresh, P., Fu, Y., Cho, J., Shaw, T. I., Mishra, A., High, A. A., Peng, J., Li, Y. JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics. J. Vis. Exp. (176), e62796, doi:10.3791/62796 (2021).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy