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UMD 패키지로 Ab Initio 분자 역학 시뮬레이션에서 용융 및 유체 분석
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Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package
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UMD 패키지로 Ab Initio 분자 역학 시뮬레이션에서 용융 및 유체 분석

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06:37 min

•

September 17, 2021

DOI:

10.3791/61534-v

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10.3791/61534-v

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06:37 min
September 17, 2021

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1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Özet

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용융 및 유체는 자연 시스템에서 대량 수송의 유비쿼터스 벡터입니다. 우리는 이러한 시스템의 ab initio 분자 역학 시뮬레이션을 분석하기 위해 오픈 소스 패키지를 개발했습니다. 우리는 구조 (접합, 클러스터화, 화학 적 분석), 운송 (확산, 점도) 및 열역학 적 특성 (진동 스펙트럼)을 계산합니다.

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Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

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Caracas, R., Kobsch, A., Solomatova, N. V., Li, Z., Soubiran, F., Hernandez, J. Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package. J. Vis. Exp. (175), e61534, doi:10.3791/61534 (2021).

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