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Preparazione del campione TMT per l'invio di strutture proteomiche e la successiva analisi dei dati
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TMT Sample Preparation for Proteomics Facility Submission and Subsequent Data Analysis
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Preparazione del campione TMT per l'invio di strutture proteomiche e la successiva analisi dei dati

DOI:
10.3791/60970-v

•

07:44 min

•

June 08, 2020

•

, , ,
1Pediatri Anabilim Dalı,Florida Üniversitesi

Bölümler

  • 00:04Introduction
  • 00:31Protein Extraction
  • 01:40Reducing/Alkylating Reagent Treatment
  • 02:39Methanol/Chloroform Precipitation
  • 04:20Protein Digestion
  • 04:56Peptide Labeling
  • 05:57Results: Representative Protein Quantification and Volcano Plot and Protein Analysis through Evolutionary Relationships (PANTHER) Analyses
  • 07:04Conclusion

Özet

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Presentiamo un protocollo di etichettatura ottimizzato per tag di massa tandem (TMT) che include informazioni dettagliate per ciascuno dei seguenti passaggi: estrazione delle proteine, quantificazione, precipitazioni, digestione, etichettatura, presentazione a un impianto proteomico e analisi dei dati.

Etiketler

TMT Sample PreparationProteomicsProtein ExtractionLabeling EfficiencyReproducibilityData AcquisitionCHAPS Lysis BufferBead DisruptorSonicationReducing/alkylating Reagent TreatmentTCEPIodoacetamideMethanol/chloroform Precipitation

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