Описанный является протеомикой рабочего процесса для выявления белковых партнеров взаимодействия из ядерной субклеточной фракции с использованием иммуноаффинити обогащения данного белка интерес и этикетки свободной масс-спектрометрии. Рабочий процесс включает в себя субклеточной фракционации, иммунопрецитистицитов, фильтр помощь подготовки образца, автономной очистки, масс-спектрометрии, и вниз по течению биоинформатики трубопровода.