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CARIP-Seq e ChIP-Seq: metodi per identificare la cromatina associata RNAs e interazioni proteina-DNA in cellule staminali embrionali
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CARIP-Seq and ChIP-Seq: Methods to Identify Chromatin-Associated RNAs and Protein-DNA Interactions in Embryonic Stem Cells
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CARIP-Seq e ChIP-Seq: metodi per identificare la cromatina associata RNAs e interazioni proteina-DNA in cellule staminali embrionali

DOI:
10.3791/57481-v

•

11:13 min

•

May 25, 2018

•

1Department of Oncology,Wayne Eyalet Üniversitesi Tıp Fakültesi, 2Karmanos Cancer Institute,Wayne Eyalet Üniversitesi Tıp Fakültesi

Bölümler

  • 00:04Başlık
  • 01:02Crosslinking of Embryonic Stem Cells for ChIP and CARIP
  • 02:29Chromatin Sonication for ChIP and CARIP
  • 03:48ChIP and CARIP Process
  • 07:12Double-stranded cDNA Synthesis for CARIP-Seq
  • 08:53Use of ChIP-Seq and CARIP-Seq to Study Global Protein-DNA Interactions and Chromatin-Associated RNAs in Embryonic Stem Cells
  • 10:43Conclusion

Özet

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Qui, descriviamo i metodi per eseguire ChIP-Seq e CARIP-Seq, compresa la preparazione di libreria per il sequenziamento di nuova generazione, per generare globale epigenomic e cromatina-associated RNA mappe in cellule ES.

Etiketler

CARIP-SeqChIP-SeqChromatin-associated RNAsProtein-DNA InteractionsEmbryonic Stem CellsEkolojiTranscription FactorsEpigenetic RegulatorsHistone ModificationsChromatin ImmunoprecipitationSonicationFormaldehyde Cross-linkingGlycinePhosphate Buffered SalineTrypsinizationMEF MediumFetal Bovine SerumSonication BufferSodium Dodecyl Sulfate

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