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ボクセルからの知識へ：複雑な電子顕微鏡3D-データのセグメンテーションの実用ガイド
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From Voxels to Knowledge: A Practical Guide to the Segmentation of Complex Electron Microscopy 3D-Data
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ボクセルからの知識へ：複雑な電子顕微鏡3D-データのセグメンテーションの実用ガイド

24,186 Views

•

12:08 min

•

August 13, 2014

DOI:

10.3791/51673-v

DOI:
10.3791/51673-v

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12:08 min
August 13, 2014

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1Life Sciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 2Joint Bioenergy Institute, Physical Biosciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 3National Energy Research Scientific Computing Center,Lawrence Berkeley National Laboratory

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携帯3D電子顕微鏡のためのボトルネックは非常に複雑な3D密度マップにおける特徴抽出（セグメンテーション）です。私たちは、このように効果的なセグメンテーションのための出発点を提供し、セグメント化アプローチ（手動、半自動、また​​は自動で）異なるデータ型に最も適しているに関するガイダンスを提供する基準のセットを開発した。

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Tsai, W., Hassan, A., Sarkar, P., Correa, J., Metlagel, Z., Jorgens, D. M., Auer, M. From Voxels to Knowledge: A Practical Guide to the Segmentation of Complex Electron Microscopy 3D-Data. J. Vis. Exp. (90), e51673, doi:10.3791/51673 (2014).

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