Asociaciones genéticas con frecuencia permanecen sin explicación a un nivel funcional. Este método tiene como objetivo evaluar el efecto del fenotipo asociado a los marcadores genéticos en la expresión génica mediante el análisis de las células heterocigotos para SNPs transcrito. La tecnología permite la medición precisa de MALDI-TOF espectrometría de masas para cuantificar alelo-específicas de los productos de extensión del cebador.