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Oi-C: um método para estudar a arquitetura tridimensional de Genomas.
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Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.

Oi-C: um método para estudar a arquitetura tridimensional de Genomas.

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•

22:27 min

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May 06, 2010

DOI:

10.3791/1869-v

DOI:
10.3791/1869-v

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22:27 min
May 06, 2010

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1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology,University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology,Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics,Harvard University , 5Department of Applied Mathematics,Harvard University , 6Fizik Bölümü,Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology,Harvard Tıp Fakültesi, 8Biyoloji Bölümü,Massachusetts Institute of Technology

Özet

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O método de Hi-C permite a identificação imparciais, de todo o genoma de interações cromatina (1). Oi-C casais ligadura proximidade e seqüenciamento massivamente paralelo. Os dados resultantes podem ser usados ​​para estudar a arquitetura genômica em múltiplas escalas: resultados iniciais identificadas características como territórios cromossomo, a segregação da cromatina abertas e fechadas, e estrutura da cromatina na escala megabase.

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Hi-CThree-dimensional Architecture Of GenomesChromosome FoldingGenome ActivityTranscriptionReplicationMicroscopyChromosomal InteractionsChromosome Conformation Capture (3C)Genome-wide StudiesHi-C MethodDNA-protein Cross-linksBiotinylated ResidueLigation Products

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van Berkum, N. L., Lieberman-Aiden, E., Williams, L., Imakaev, M., Gnirke, A., Mirny, L. A., Dekker, J., Lander, E. S. Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.. J. Vis. Exp. (39), e1869, doi:10.3791/1869 (2010).

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