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Hi-C: un metodo per studiare l'architettura tridimensionale dei genomi.
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Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.
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Hi-C: un metodo per studiare l'architettura tridimensionale dei genomi.

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22:27 min

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May 06, 2010

DOI:

10.3791/1869-v

DOI:
10.3791/1869-v

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22:27 min
May 06, 2010

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1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology,University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology,Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics,Harvard University , 5Department of Applied Mathematics,Harvard University , 6Fizik Bölümü,Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology,Harvard Tıp Fakültesi, 8Biyoloji Bölümü,Massachusetts Institute of Technology

Özet

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L'Hi-C metodo consente l'identificazione imparziali, genoma delle interazioni della cromatina (1). Hi-C coppie legatura di prossimità e di sequenziamento massicciamente parallelo. I dati ottenuti possono essere usati per studiare architettura genomica alle scale multiple: risultati iniziali identificate caratteristiche come territori cromosoma, la segregazione della cromatina aperti e chiusi, e la struttura della cromatina alla scala megabase.

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Hi-CThree-dimensional Architecture Of GenomesChromosome FoldingGenome ActivityTranscriptionReplicationMicroscopyChromosomal InteractionsChromosome Conformation Capture (3C)Genome-wide StudiesHi-C MethodDNA-protein Cross-linksBiotinylated ResidueLigation Products

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van Berkum, N. L., Lieberman-Aiden, E., Williams, L., Imakaev, M., Gnirke, A., Mirny, L. A., Dekker, J., Lander, E. S. Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.. J. Vis. Exp. (39), e1869, doi:10.3791/1869 (2010).

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