等温滴定熱量測定を使用して、ウイルス侵入前後のライフサイクル段階を標的とする抗B型肝炎ウイルス(HBV)化合物をスクリーニングするためのプロトコルを提示し、宿主タウロコール酸ナトリウム共輸送ポリペプチドとの結合親和性(KD)を測定します。抗ウイルス効果は、ウイルスライフサイクルマーカー(cccDNA形成、転写、およびウイルス集合)の抑制によって決定されました。
B型肝炎ウイルス(HBV)感染は、肝細胞癌の重要な危険因子と見なされてきました。現在の治療はウイルス量を減らすことしかできませんが、完全な寛解をもたらすことはできません。HBV感染の効率的な肝細胞モデルは、治療薬のスクリーニングに不可欠な、実物に忠実なウイルスライフサイクルを提供します。利用可能なほとんどの抗HBV剤は、ウイルス侵入後のライフサイクル段階を標的としていますが、ウイルス侵入前は標的としていません。このプロトコルは、前ウイルス侵入およびウイルス侵入後のライフサイクル段階を標的とする治療薬をスクリーニングすることができる有能な肝細胞モデルの生成を詳述する。これには、タウロコール酸ナトリウム共輸送ポリペプチド(NTCP)結合、cccDNA形成、転写、および宿主細胞としてのimHCまたはHepaRGに基づくウイルスアセンブリの標的化が含まれます。ここで、HBV侵入阻害アッセイでは、NTCPを介したHBV結合および輸送機能を阻害するためにクルクミンを使用した。阻害剤は、熱力学的パラメーターに基づくHBV薬物スクリーニングのための普遍的なツールである等温滴定熱量測定(ITC)を使用して、NTCPとの結合親和性(KD)を評価しました。
B型肝炎ウイルス(HBV)感染は、世界中で生命を脅かす病気と見なされています。慢性HBV感染症は、肝硬変と肝細胞癌のリスクを伴います1。現在の抗HBV治療は、主にヌクレオス(t)イド類似体(NA)およびインターフェロンアルファ(IFN-α)2,3を使用したウイルス侵入後に焦点を当てています。HBV侵入阻害剤であるミルクルデックスBの発見により、抗HBV薬の新規標的が特定されました4。慢性HBVにおける侵入阻害剤とNAの組み合わせは、ウイルス複製のみを標的とするウイルス量と比較してウイルス量を大幅に減少させました5,6。しかしながら、HBV侵入阻害剤のスクリーニングのための古典的な肝細胞モデルは、低いウイルス受容体レベル(タウロコール酸ナトリウム共輸送ポリペプチド、NTCP)によって制限される。肝癌細胞(すなわち、HepG2およびHuh7)におけるhNTCPの過剰発現は、HBV感染性を改善する7,8。それにもかかわらず、これらの細胞株は低レベルの第I相および第II相薬物代謝酵素を発現し、遺伝的不安定性を示します9。前ウイルス侵入、NTCP結合、ウイルス侵入など、候補抗HBV化合物の明確なメカニズムを標的とするのに役立つ肝細胞モデルは、効果的な併用レジメンの同定と開発を促進します。クルクミンの抗HBV活性の研究は、ウイルス侵入後の中断に加えて、新しいメカニズムとしてウイルス侵入の抑制を解明しました。このプロトコルは、抗HBV侵入分子10のスクリーニングのための宿主モデルを詳述する。
この方法の目的は、ウイルス侵入阻害、特にNTCP結合および輸送の遮断のための候補となる抗HBV化合物を探索することです。NTCP発現はHBVの侵入と感染にとって重要な要素であるため、NTCPレベルを最大化するために肝細胞成熟プロトコルを最適化しました11。さらに、このプロトコルは、HBV侵入に対する阻害効果を、HBV付着の阻害対内在化の阻害として区別することができる。タウロコール酸(TCA)取り込みアッセイも、NTCP輸送を表すために放射性同位元素の代わりにELISAベースの方法を用いて改変された12,13。受容体とリガンドの相互作用は、それらの3D構造によって確認された14,15。NTCP機能の阻害は、TCA取り込み活性を測定することによって評価することができる16。しかしながら、この技術は、候補阻害剤へのNTCP結合の直接的な証拠を提供しなかった。したがって、結合は、表面プラズモン共鳴17、ELISA、蛍光ベースの熱シフトアッセイ(FTSA)18、FRET19、AlphaScreen、および他の様々な方法20などの様々な技術を用いて調べることができる。これらの手法の中でも、ITCはほぼすべての反応21において熱吸収または発光を観察できるため、結合解析における目標標準である。NTCPと候補化合物の結合親和性(KD)は、ITCを用いて直接評価した。これらの親和性値は、in silico予測モデル22を用いて得られた値よりも正確であった。
このプロトコルは、肝細胞の成熟、HBV感染、およびHBV侵入阻害剤のスクリーニングにおける技術をカバーしています。簡単に説明すると、肝細胞モデルは、imHCおよびHepaRG細胞株に基づいて開発された。培養細胞は2週間以内に成熟肝細胞に分化した。NTCPレベルのアップレギュレーションは、リアルタイムPCR、ウェスタンブロット、およびフローサイトメトリーを使用して検出されました11。B型肝炎ビリオン(HBVcc)が産生され、HepG2.2.15から収集されました。分化したimHCまたはHepaRG(d-imHC、d-HepaRG)を、HBVビリオンの接種2時間前に抗HBV候補で予防的に処理した。実験の期待される結果は、細胞のHBVと感染力を低下させる薬剤の特定でした。抗NTCP活性は、TCA取り込みアッセイを用いて評価した。NTCP活性は、NTCPを特異的に結合した薬剤によって抑制され得る。ITC技術は、生体分子複合体の非共有結合相互作用を介して受容体に対するリガンドの結合親和性(KD)を決定し、阻害剤とその標的タンパク質を予測できる相互作用的結合の実現可能性を調べるために採用されました23,24。例えば、KD ≥ 1 ×10 3 mMは弱い結合を表し、K D ≥ 1 × 106 μMは中程度の結合を表し、KD ≤ 1 × 109 nMは強い結合を表す。ΔGは結合相互作用と直接相関しています。特に、負のΔGとの反応はエクセルゴニック反応であり、結合が自発的なプロセスであることを示す。負のΔHとの反応は、結合プロセスが水素結合とファンデルワールス力に依存することを示します。TCA取り込みとITCデータの両方を使用して、抗HBVエントリーエージェントをスクリーニングすることができます。これらのプロトコルの結果は、抗HBVスクリーニングだけでなく、結合親和性と輸送機能を通じて評価されるNTCPとの相互作用の基礎も提供できます。この論文では、宿主細胞の調製と特性評価、実験デザイン、および抗HBVエントリーの評価とNTCP結合親和性について説明します。
HBV感染は、肝細胞上のヘパラン硫酸プロテオグリカン(HSPG)への低親和性結合25、続いてNTCPへの結合、続いてエンドサイトーシス26によるインターナリゼーションによって開始されます。NTCPはHBV侵入の重要な受容体であるため、HBV侵入を標的とすることは、臨床的には 、de novo 感染、母子感染(MTCT)、および肝移植後の再発を減少させるように翻訳する?…
The authors have nothing to disclose.
この研究プロジェクトは、マヒドン大学とタイ科学研究イノベーション(TSRI)の支援を受けており、A. WongkajornsilpとK. Sa-ngiamsuntornに別々に授与されています。この作業は、競争力のためのプログラム管理ユニット(助成金番号C10F630093)を通じて、国立高等教育科学研究イノベーション政策評議会のオフィスによって財政的に支援されました。A. Wongkajornsilpは、マヒドン大学医学部シリラート病院のChalermprakiat助成金の受領者です。著者らは、ITC技術を支援してくれたSawinee Seemakhan嬢(マヒドン大学理学部創薬エクセレントセンター)に感謝の意を表します。
Cell lines | |||
HepaRG Cells, Cryopreserved | Thermo Fisher Scientific | HPRGC10 | |
Hep-G2/2.2.15 Human Hepatoblastoma Cell Line | Merck | SCC249 | |
Reagents | |||
4% Paraformadehyde Phosphate Buffer Solution | FUJIFLIM Wako chemical | 163-20145 | |
BD Perm/Wash buffer | BD Biosciences | 554723 | Perm/Wash buffer |
Cyclosporin A | abcam | 59865-13-3 | |
EDTA | Invitrogen | 15575-038 | 8 mM |
G 418 disulfate salt | Merck | 108321-42-2 | |
Halt Protease Inhibitor Cocktail EDTA-free (100x) | Thermo Scientific | 78425 | |
HEPES | Merck | 7365-45-9 | |
illustraTM RNAspin Mini RNA isolation kits | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
illustra RNAspin Mini RNA Isolation Kit | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
ImProm-II Reverse Transcription System | Promega | A3800 | |
KAPA SYBR FAST qPCR Kit | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Lenti-X Concentrator | Takara bio | PT4421-2 | concentrator |
Luminata crescendo Western HRP substrate | Merck | WBLUR0100 | |
Master Mix (2x) Universal | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Nucleospin DNA extraction kit | macherey-nagel | 1806/003 | |
Phosphate buffered saline | Merck | P3813 | |
Polyethylene glycol 8000 | Merck | 25322-68-3 | |
ProLong Gold Antifade Mountant | Thermo scientific | P36930 | |
Recombinant NTCP | Cloud-Clone | RPE421Hu02 | |
RIPA Lysis Buffer (10x) | Merck | 20-188 | |
TCA | Sigma | 345909-26-4 | |
TCA Elisa kit | Mybiosource | MB2033685 | |
Triton X-100 | Merck | 9036-19-5 | |
Trypsin-EDTA | Gibco | 25200072 | Dilute to 0.125% |
Antibodies | |||
Anti-NTCP1 antibody | Abcam | ab131084 | 1:100 dilution |
Anti-GAPDH antibody | Thermo Fisher Scientific | AM4300 | 1:200,000 dilution |
HRP-conjugated goat anti-rabbit antibody | Abcam | ab205718 | 1:10,000 dilution |
HRP goat anti-mouse secondary antibody | Abcam | ab97023 | 1:10,000 dilution |
Goat anti-Rabbit IgG Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11008 | 1:500 dilution |
Reagent composition | |||
1° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
Sodium azide | Sigma | 199931 | Working concentration: 0.05% |
Hepatocyte Growth Medium | |||
DME/F12 | Gibco | 12400-024 | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
Hepatic maturation medium | |||
Williams’ E medium | Sigma Aldrich | W4125-1L | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
5 µg/mL Insulin | Sigma Aldrich | 91077C-100MG | |
50 µM hydrocotisone | Sigma Aldrich | H0888-1g | |
2% DMSO | PanReac AppliChem | A3672-250ml | |
IF Blocking solution | |||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
0.2% Triton X-100 | Sigma | T8787 | Working concentration: 0.2% |
RIPA Lysis Buffer Solution | Merck | 20-188 | Final concentration: 1X |
Protease Inhibitor Cocktail | Thermo Scientific | 78425 | Final concentration: 1X |
Na3VO4 | Final concentration: 1 mM | ||
PMSF | Final concentration: 1 mM | ||
NaF | Final concentration: 10 mM | ||
Western blot reagent | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | |
1x TBST | 0.1% Tween 20 | ||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo Fisher Scientific | A53225 | |
Polyacrylamide gel | Bio-Rad | 161-0183 | |
Ammonium Persulfate (APS) | Bio-Rad | 161-0700 | Final concentration: 0.05% |
TEMED | Bio-Rad | 161-0800 | Stacker gel: 0.1%, Resolver gel: 0.05% |
2x Laemmli Sample Buffer | Bio-Rad | 161-0737 | Final concentration: 1X |
Precision Plus Protein Dual Color Standards | Bio-Rad | 161-0374 | |
WB Blocking solution/ 2° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
5% Skim milk (nonfat dry milk) | Bio-Rad | 170-6404 | Working concentration: 5% |
1x Running buffer 1 L | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 14.4 g |
SDS | Merck | 7910 | Working concentration: 0.1% |
Blot transfer buffer 500 mL | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 7.2 g |
Methanol | Merck | 106009 | 100 mL |
Mild stripping solution 1 L | Adjust pH to 2.2 | ||
Glycine | Sigma | G8898 | 15 g |
SDS | Merck | 7910 | 1 g |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | 10 mL |
Equipments | |||
15 mL centrifuge tube | Corning | 430052 | |
50 mL centrifuge tube | Corning | 430291 | |
Airstream Class II | Esco | 2010621 | Biological safety cabinet |
CelCulture CO2 Incubator | Esco | 2170002 | Humidified tissue culture incubator |
CFX96 Touch Real-Time PCR Detector | Bio-Rad | 1855196 | |
FACSVerse Flow Cytometer | BD Biosciences | 651154 | |
Graduated pipettes (10 mL) | Jet Biofil | GSP010010 | |
Graduated pipettes (5 mL) | Jet Biofil | GSP010005 | |
MicroCal PEAQ-ITC | Malvern | Isothermal titration calorimeters | |
Mini PROTEAN Tetra Cell | Bio-Rad | 1658004 | Electrophoresis chamber |
Mini Trans-blot absorbent filter paper | Bio-Rad | 1703932 | |
Omega Lum G Imaging System | Aplegen | 8418-10-0005 | |
Pipette controller | Eppendorf | 4430000.018 | Easypet 3 |
PowerPac HC | Bio-Rad | 1645052 | Power supply |
PVDF membrane | Merck | IPVH00010 | |
T-75 A91:D106flask | Corning | 431464U | |
Trans-Blot SD Semi-Dry Transfer Cell | Bio-Rad | 1703940 | Semi-dry transfer cell |
Ultrasonic processor (Vibra-Cell VCX 130) | Sonics & Materials | ||
Versati Tabletop Refrigerated Centrifuge | Esco | T1000R | Centrifuge with swinging bucket rotar |