Hier stellen wir das Protokoll für die schrittweise Rekonstitution synthetischer Antigen-präsentierender Zellen unter Verwendung von Bead-Supported Lipid Bilayers und deren Verwendung zur Abfrage der synaptischen Ausgabe von aktivierten T-Zellen vor.
Antigen-präsentierende Zellen (APCs) präsentieren drei aktivierende Signale an T-Zellen, die in physischem Kontakt stehen: 1) Antigen, 2) Kostimulation / Kernpression und 3) lösliche Zytokine. T-Zellen setzen als Reaktion auf die Aktivierung zwei Arten von Effektorpartikeln frei: transsynaptische Vesikel (tSVs) und supramolekulare Angriffspartikel, die interzelluläre Botenstoffe übertragen bzw. Zytotoxizität vermitteln. Diese Entitäten werden schnell von APCs verinnerlicht, die in physischem Kontakt mit T-Zellen stehen, was ihre Charakterisierung entmutigend macht. Dieser Artikel stellt das Protokoll zur Herstellung und Verwendung von Bead-Supported Lipid Bilayers (BSLBs) als Antigen-präsentierende Zell (APC) Mimetika vor, um diese transsynaptischen Partikel zu erfassen und zu analysieren. Ebenfalls beschrieben sind die Protokolle für die absoluten Messungen von Proteindichten auf Zelloberflächen, die Rekonstitution von BSLBs mit solchen physiologischen Werten und das Durchflusszytometrieverfahren zur Verfolgung der synaptischen Partikelfreisetzung durch T-Zellen. Dieses Protokoll kann angepasst werden, um die Auswirkungen einzelner Proteine, komplexer Ligandengemische, Pathogenvirulenzdeterminanten und Medikamente auf den Effektorausgang von T-Zellen, einschließlich Helfer-T-Zellen, zytotoxischen T-Lymphozyten, regulatorischen T-Zellen und chimären Antigenrezeptor-exprimierenden T-Zellen (CART), zu untersuchen.
Die immunologische Synapse (IS) ist eine zentrale molekulare Struktur, die an der Schnittstelle von Zellen gebildet wird, die in physischem Kontakt stehen und den regulierten Austausch von Juxtracrin-Informationen erleichtern. Verschiedene ISs wurden in der Literatur beschrieben, und eine wachsende Zahl von Beweisen deutet darauf hin, dass diese molekularen Zentren ein konserviertes Merkmal zellulärer Netzwerke sind. Verschiedene Immunzellen, darunter B-Zellen, natürliche Killerzellen, dendritische Zellen, Makrophagen und T-Zellen, tauschen Informationen über den Aufbau kurzlebiger Kontakte aus1. Multiomische Studien fördern das Verständnis neuartiger Untergruppen von Leukozyten und Stromazellen, die pathogene zelluläre Netzwerke antreiben und Oberflächenproteine mit unbekannten Funktionen exprimieren. Als synthetische APCs erlauben BSLBs die direkte Untersuchung der funktionellen Rolle einzelner Proteine bei der Integration von aktivierenden Signalen, nämlich Antigenen und Kostimulation/Corepression, durch T-Zellen und die daraus resultierende Freisetzung von Effektorpartikeln, die als Signal vier bezeichnet werden.
In diesem Dokument werden die Protokolle und kritischen technischen Punkte beschrieben, die bei der Verwendung von BSLBs zur Nachahmung der Oberflächenzusammensetzung von Modell-APCs zu berücksichtigen sind. Die Protokolle für die quantitative Messung von Immunrezeptoren und anderen Oberflächenproteinen auf APCs werden zusammen mit dem Protokoll für die Rekonstitution synthetischer APCs, die diese gemessenen Größen enthalten, vorgestellt. Anschließend werden die schritte, die für die Kokulturation von T-Zellen und BSLB erforderlich sind, zusammen mit dem Protokoll für die quantitative Messung des transsynaptischen Partikeltransfers mittels Durchflusszytometrie vorgestellt. Am bemerkenswertesten ist, dass BSLBs die Untersuchung einer aus der Plasmamembran abgeleiteten Population von tSVs erleichtern, die als synaptische Ektosomen (SEs) bezeichnet werden. T-Zell-Antigenrezeptor-angereicherte (TCR+) SEs werden als Reaktion auf TCR-Triggerung2 abgestoßen und effizient von BSLBs3 abgefangen, was eine hervorragende Ablesung darstellt, um die agonistischen Eigenschaften von Antigenen und die modellierte Membranzusammensetzung zu bewerten. CD63+-Exosomen und supramolekulare Angriffspartikel (SMAPs) werden ebenfalls von stimulierten T-Zellen freigesetzt und von BSLBs eingefangen. Sie können als zusätzliche Auslesungen der Aktivierung und der daraus resultierenden exozytären und lytischen Granulensekretion durch T-Zellen verwendet werden. Die Mobilisierung exozytärer Vesikel zum interagierenden Pol der T-Zelle erleichtert auch die direktionale Freisetzung von Zytokinen wie IL-2, IFN-γ und IL-10 als Reaktion auf die Aktivierung4,5,6,7,8. Obwohl T-Zell-freigesetzte Zytokine auch auf BSLBs nachgewiesen werden können, befindet sich derzeit eine speziellere Studie in der Entwicklung, um die quantitative Analyse der Zytokinfreisetzung an der immunologischen Synapse zu validieren.
Um zu untersuchen, wie spezifische Membranzusammensetzungen die synaptische Leistung von T-Zellen beeinflussen, muss die physiologische Dichte der Zielmembrankomponente definiert werden. Durchflusszytometrie-basierte Quantifizierungen von Zelloberflächenproteinen sind ein wesentlicher Schritt in diesem Protokoll und erfordern: 1) die Verwendung von Antikörpern mit bekannter Anzahl von Fluorochromen pro Antikörper (F / P) und 2) Benchmark-Kügelchen, die eine Standardreferenz für die Interpolation von Fluorochrommolekülen aus gemessenen mittleren Fluoreszenzintensitäten (MFIs) darstellen.
Diese Benchmark-Standards bestehen aus fünf Perlenpopulationen, die jeweils eine zunehmende Anzahl äquivalenter löslicher Fluorochrome (MESFs) enthalten, die den Dynamikbereich der willkürlichen Fluoreszenzdetektion abdecken. Diese Standardpopulationen liefern diskrete Fluoreszenzpeaks, die die Umwandlung beliebiger Fluoreszenzeinheiten in MESFs durch einfache lineare Regression erleichtern. Die resultierenden MESFs werden dann zusammen mit Antikörper-F/P-Werten verwendet, um die durchschnittliche Anzahl der gebundenen Moleküle pro Zelle (oder BSLB in späteren Schritten) zu berechnen. Die Anwendung der geschätzten Zelloberflächen auf die durchschnittliche Anzahl der nachgewiesenen Moleküle ermöglicht dann die Berechnung physiologischer Dichten als Moleküle/μm2. Dieses Quantifizierungsprotokoll kann auch an die Messung von Proteindichten auf T-Zellen und die biochemische Rekonstitution von Membranzusammensetzungen angepasst werden, die die Bildung homotypischer T-Zell-Synapsen (d.h. T-T-Synapsen9) vermitteln. Bei Bedarf kann die Wertigkeit der Antikörperbindung weiter geschätzt werden, indem rekombinante Targets verwendet werden, die mit einer bekannten Anzahl von Fluorochromen pro Molekül markiert sind. Dann kann die Antikörper-bindende Valenz für die gleiche BSLB-Population berechnet werden, indem gleichzeitig die Anzahl der gebundenen fluoreszierenden Proteine und Quantifizierungsantikörper verglichen wird (unter Verwendung von zwei verschiedenen Quantifizierungsfluorochromen und MESF-Standards).
Die Rekonstitution von APC-Membranen erfordert die Montage von gestützten Lipiddoppelschichten (SLBs) auf Silica-Perlen1. Liposomenbestände, die verschiedene Phospholipidspezies enthalten, können zu einer vielseitigen Lipid-Doppelschicht-Matrix genutzt werden, die die Verankerung rekombinanter Proteine mit unterschiedlicher Bindungschemie ermöglicht (die Herstellung von Liposomen ist in 10 beschrieben). Sobald die physiologische Dichte (oder Dichte) des relevanten Liganden “auf Zellen” definiert ist, wird das gleiche Durchflusszytometrieprotokoll angepasst, um die Konzentration des rekombinanten Proteins abzuschätzen, das benötigt wird, um BSLBs mit der physiologischen Zieldichte zu beschichten. Zwei verschiedene Verankerungssysteme können entweder in Kombination oder separat verwendet werden.
Erstens reicht SLB, das die letzten 12,5 Mol-% Ni2+-haltiger Phospholipide enthält, aus, um etwa 10.000 His-Tag-Bindungsstellen pro Quadratmikron10 bereitzustellen, und eignet sich gut, um BSLBs mit den meisten kommerziell erhältlichen Proteinen zu dekorieren, deren physiologische Dichten diese maximale Beladungskapazität nicht überschreiten. Das zweite Ladesystem nutzt biotinhaltige Phospholipide (als mol%), um biotinylierte Anti-CD3e Fab (oder HLA /MHC-Monomere) über Streptavidinbrücken zu laden. Die Kombination dieser beiden BSLB-Dekorationsmethoden ermöglicht dann die flexible Anpassung von BSLBs als synthetische APCs. Bei hochkomplexen APC-Oberflächenzusammensetzungen kann der Mol-Anteil an Phospholipiden und Proteinen erhöht werden, um so viele Proteine zu laden, wie die vorliegende Frage erfordert. Sobald die Arbeitskonzentrationen von Proteinen und Mol-% biotinylierter Phospholipide definiert sind, können BSLBs zusammengestellt werden, um die synaptische Leistung von T-Zellen mit multiparametrischer Durchflusszytometrie zu abfragen.
BSLBs sind vielseitige Werkzeuge zur Untersuchung der Partikelabgabe von T-Zellen, die mit Modell-APC-Membranen stimuliert werden. Die Flexibilität der Methode ermöglicht die Rekonstitution komplexer und reduktionistischer Membranzusammensetzungen, um die Auswirkungen von Liganden und deren Signalen auf die Sekretion von tSVs und supramolekularen Angriffspartikeln und deren Komponenten zu untersuchen. Wir haben diese Technologie an verschiedenen T-Zellen getestet, darunter voraktivierte TH, CTL, Tregs und <sup class="x…
The authors have nothing to disclose.
Wir danken unseren Labormitgliedern und der Gemeinschaft des Kennedy Institute of Rheumatology für konstruktive wissenschaftliche Diskussionen, insbesondere unserem Durchflusszytometrie-Facility-Manager Jonathan Webber. Diese Arbeit wurde durch das Wellcome Trust Principal Research Fellowship 100262Z/12/Z, den ERC Advanced Grant (SYNECT AdG 670930) und den Kennedy Trust for Rheumatology Research (KTRR) (alle drei an MLD) finanziert. PFCD wurde durch embo Long-Term Fellowship (ALTF 1420-2015, in Zusammenarbeit mit der Europäischen Kommission (LTFCOFUND2013, GA-2013-609409) und Marie Sklodowska-Curie Actions) und ein Oxford-Bristol Myers Squibb Fellowship unterstützt.
1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-[(N-(5-amino-1-carboxypentyl)iminodiacetic acid)succinyl] (nickel salt) | Avanti Polar Lipids | 790404C-25mg | 18:1 DGS-NTA(Ni) in chloroform |
PIPETMAN L Multichannel P8x200L, 20-200 µL |
Gilson | FA10011 | |
1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine | Avanti Polar Lipids | 850375C-25mg | 18:1 (Δ9-Cis) PC (DOPC) in chloroform |
1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DOPE) ATTO 390 | ATTO-TEC | AD 390-165 | DOPE ATTO 390 |
1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DOPE) ATTO 488 | ATTO-TEC | AD 488-165 | DOPE ATTO 488 |
1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DOPE) ATTO 565 | ATTO-TEC | AD 565-165 | DOPE ATTO 565 |
1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-(cap biotinyl) (sodium salt) | Avanti Polar Lipids | 870273C-25mg | 18:1 Biotinyl Cap PE in chloroform |
200 µL yellow tips 10 x 96 Tips, Stack | Starlab | S1111-0206 | |
5 mL polystyrene round-bottom tubes | Falcon® | 352052 | |
5.00 ± 0.05 µm non-functionalized silica beads | Bangs Laboratories Inc. | SS05003 | |
96 Well Cell Cultture Plate U-bottom with Lid, Tissue culture treated, non-pyrogenic. | Costar® | 3799 | For FCM staining and co-culture of BSLB and cells. |
96 Well Cell Cultture Plate V-bottom with Lid, Tissue culture treated, non-pyrogenic. | Costar® | 3894 | For FCM staining of cells or beads in suspension. |
Alexa Fluor 488 NHS Ester (Succinimidyl Ester) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen™ | A20000 | |
Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen™ | A37573 and A20006 | |
Allegra X-12R Centrifuge | Beckman Coulter | For normal in tube staining of biological samples for FCM | |
Aluminum Foil | Any brand | For protecting cells and BSLBs from light | |
anti-human CD154 (CD40L), clone 24-31 | BioLegend | 310815 and 310818 | Alexa Fluor 488 and Alexa Fluor 647 conjugates, respectively. |
anti-human CD185 (CXCR5) Brilliant Violet 711, clone J252D4 | BioLegend | 356934 | For quantitative FCM analysis of tonsillar cells as shown in Fig. 1E |
anti-human CD19 Brilliant Violet 421, clone HIB19 | BioLegend | 302234 | For quantitative FCM analysis of tonsillar cells as shown in Fig. 1E |
anti-human CD2, clone RPA-2.10 | BioLegend | 300202 | Labeled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human CD2, clone TS1/8 | BioLegend | 309218 | Brilliant Violet 421 conjugate. |
anti-human CD252 (OX40L), clone 11C3.1 | BioLegend | Alexa Fluor 647 conjugate | |
anti-human CD28, clone CD28.2 | eBioscience | 16-0289-85 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human CD317 (BST2, PDCA-1), clone 26F8 | ThermoFisher Scientific, invitrogen | 53-3179-42 | Alexa Fluor 488 conjugate, we found this clone to be cleaner than clone RS38E. |
anti-human CD38, clone HB-7 | BioLegend | 356624 | Alexa Fluor 700 conjugate |
anti-human CD38, clone HIT2 | BioLegend | 303514 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human CD39, clone A1 | BioLegend | Labeled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) | |
anti-human CD4 Brilliant Violet 650, clone OKT4 | BioLegend | 317436 | For quantitative FCM analysis of tonsillar cells as shown in Fig. 1E |
anti-human CD4, clone A161A1 | BioLegend | 357414 and 357421 | PerCP/Cyanine5.5 and Alexa Fluor 647 conjugates, respectively |
anti-human CD4, clone OKT4 | BioLegend | 317414 and 317422 | PE/Cy7 and Alexa Fluor 647 conjugates, respectively |
anti-human CD40, clone 5C3 | BioLegend | 334304 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human CD40, clone G28.5 | BioLegend | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) | |
anti-human CD45, clone HI30 | BioLegend | 304056 and 368516 | Alexa Fluor 647 and APC/Cy7 conjugates |
anti-human CD47, clone CC2C6 | BioLegend | 323118 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human CD54 (ICAM-1), clone HCD54 | BioLegend | 322702 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human CD63 (LAMP-3), clone H5C6 | BioLegend | 353020 and 353015 | PerCP/Cyanine5.5 and Alexa Fluor 647 conjugates, respectively |
anti-human CD73, clone AD2 | BioLegend | 344002 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human CD80, clone 2D10 | BioLegend | 305216 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human CD81, clone 5A6 | BioLegend | 349512 and 349502 | PE/Cy7 conjugate and labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester), respectively. |
anti-human CD82, clone ASL-24 | BioLegend | 342108 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human CD86, clone IT2.2 | BioLegend | 305416 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human CD8a, clone HIT8a | BioLegend | 300920 | Alexa Fluor 700 conjugate |
anti-human CD8a, clone SK1 | BioLegend | 344724 | Alexa Fluor 700 conjugate |
anti-human HLA-A/B/C/E, clone w6/32 | BioLegend | 311414 and 311402 | Alexa Fluor 647 conjugate and Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human HLA-DR, clone L243 | BioLegend | 307656 and 307622 | Alexa Fluor 488 and Alexa Fluor 647 conjugates, respectively. |
anti-human ICAM-1, clone HCD54 | BioLegend | 322702 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human ICOS, clone C398.4A | BioLegend | 313516 | Armenian Hamster IgG |
anti-human ICOSL, clone MIH12 | BioLegend | 329611 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human ICOSL, clone MIH12 | eBioscience | 16-5889-82 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human LFA-1, clone TS1/22 | BioLegend | Produced in house | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human OX40, clone Ber-ACT35 (ACT35) | BioLegend | 350018 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human PD-1 , clone EH12.2H7 | BioLegend | 135230 and 329902 | Alexa Fluor 647 conjugate and Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human PD-L1, clone 29E.2A3 | BioLegend | 329702 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human PD-L2, clone 24F.10C12 | BioLegend | 329611 | Alexa Fluor 647 conjugate |
anti-human PD-L2, clone MIH18 | BioLegend | 345502 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
anti-human TCRab, clone IP26 | BioLegend | 306712 and 306714 | Alexa Fluor 488 and Alexa Fluor 647 conjugates, respectively. |
antti-human CD156c (ADAM10), clone SHM14 | BioLegend | 352702 | |
antti-human CD317 (BST2, Tetherin), clone RS38E | BioLegend | 348404 | Alexa Fluor 647 conjugate |
Armenian Hamster IgG Alexa Fluor 647 Isotype control, clone HTK888 | BioLegend | 400902 | Labelled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
BD Cytometer Setup and Tracking beads | Becton Dickinson & Company (BD) | 641319 | Performance track of instruments before quantitative FCM |
BD FACSDiva | Becton Dickinson & Company (BD) | 23-14523-00 | Acquisition software |
Bovine Seum Albumin | Merck, Sigma-Aldrich | A3294 | |
CaCl2, Calcium chloride | Merck, Sigma-Aldrich | C5670 | anhydrous, BioReagent, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥96.0% |
Casein from bovine milk, suitable for substrate for protein kinase (after dephosphorylation), purified powder | Merck, Sigma-Aldrich | C5890 | |
Dynabeads Human T-Activator CD3/CD28 | ThermoFisher Scientific, Gibco | 11132D | |
DynaMag-2 | ThermoFisher Scientific, Invitrogen™ | 12321D | For the removal of Dynabeads Human T-Activator CD3/CD28 in volumes less than 2 mL |
DynaMag™-15 | ThermoFisher Scientific, Invitrogen™ | 12301D | For the removal of Dynabeads™ Human T-Activator CD3/CD28 in volumes less than 15 mL |
Fetal Bovine Serum Qualified, One Shot | ThermoFisher Scientific, Gibco | A3160801 | Needs heat inactivation for 30 min at 56 oC |
Ficoll-Paque PLUS | Cytiva, GE Healthcare | GE17-1440-02 | Sterile solution of polysaccharide and sodium diatrizoate for lymphocyte isolation |
Fixable Viability Dye eFluor 780 | eBiosciences | 65-0865-14 | For the exclusion of dead cells during analyses |
FlowJo | Becton Dickinson & Company (BD) | Version 10.7.1 | Analysis software |
Grant Bio MPS-1 Multi Plate Shaker | Keison Products | MPS-1 | For the mixing of either cells during stainings or BSLBs during staning or protein loading (as an alternative to orbital agitation) |
HEPES Buffer Solution (1 M) | ThermoFisher Scientific, Gibco | 15630-056 | |
HEPES, N-(2-Hydroxyethyl)piperazine-N′-(2-ethanesulfonic acid), 4-(2-Hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid. | Merck, Sigma-Aldrich | H4034 | For preparation of HBS/HAS or HBS/BSA buffer. BioPerformance Certified, ≥99.5% (titration), suitable for cell culture |
HERACell 150i CO2 incubator, 150 L, Electropolished Stainless Steel | ThermoFisher Scientific | 51026282 | For culturing and expanding purified CD4+ and CD8+ T cells. |
Hula Mixer® Sample Mixer | ThermoFisher Scientific, Life Technologies | 15920D | Vertical, variable-angle laboratory mixer used for the mixing of BSLBs and lipid master mix, blocking solutions, protein master mix and small scale antibody stainings. |
Human Serum Albumin, 30% aqueous solution | Merck, Sigma-Aldrich | 12667-M | |
Human TruStain FcX Fc Receptor Blocking Solution | BioLegend | 422302 | Fc Receptor Blocking Solution for blocking of Fc Receptors from biologically relevant samples |
Innovatis CASY cell counter and analyzer TT | Biovendis Products GmbH | For the counting of cells and the determination of cell size and volume based on the exclusion of electric current. | |
KCl, Potassium chloride | Merck, Sigma-Aldrich | P5405 | Powder, BioReagent, suitable for cell culture |
L-Glutamine 200 mM (100x) | ThermoFisher Scientific, Gibco | 25030-024 | |
MgCl2, Magessium chloride | Merck, Sigma-Aldrich | M2393 | BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture |
Microtube Insert for 24 x 1.5/2.0 mL tubes | Keison Products | P-2-24 | Microtube insert for Grant Bio MPS-1 Multi Plate Shaker |
Mini Incubator | Labnet International | I5110A-230V | For the incubation (co-culturing) of BSLB and cells in the absence of CO2 |
Minimum Essential Medium Non-Essential Amino Acids | ThermoFisher Scientific, Gibco | 11140-035 | |
Mouse IgG polyclonal antibody control | Merck, Sigma-Aldrich | PP54 | Used as positive control for the measurement of antibodies bound to mouse IgG capture bead standards |
Mouse IgG1, k Isotype, clone MOPC-21 | BioLegend | 400129, 400112, 400130, 400144, 400128 and 400170 | Alexa Fluor 488, PE, Alexa Fluor 647, Alexa Fluor 700, APC/Cyanine7 and Brilliant Violet 785 conjugates, respectively. |
Mouse IgG1, k Isotype, clone X40 | Becton Dickinson & Company (BD), Horizon | 562438 | Brilliant Violet 421 conjugate. |
Mouse IgG1, κ Isotype control, clone P3.6.2.8.1 | eBioscience | 14-4714-82 | Labeled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
Mouse IgG2a, k Isotype, clone MOPC-173 | BioLegend | 400240 | Alexa Fluor 647 conjugate |
Mouse IgG2b, k Isotype, clone MPC-11 | BioLegend | 400330 and 400355 | Alexa Fluor 647 and Brilliant Violet 785 conjugates, respectively |
Multiwell 6 well Tissue culture treated with vacuum gas plasma | Falcon | 353046 | For culturing and expanding purified CD4+ and CD8+ T cells. |
Na2HPO4, Disodium Phosphate | Merck, Sigma-Aldrich | S7907 | |
NaCl, Sodium chloride | Merck, Sigma-Aldrich | S5886 | BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99% |
NiSO4, Nickel(II) sulfate | Merck, Sigma-Aldrich | 656895 | For saturating NTA sites; added during the blocking process |
Penicillin Streptomycin [+]10,000 units Penicillin; [+] 10,000 µg/mL Streptomycin | ThermoFisher Scientific, Gibco | 15140-122 | |
Phosphate Buffered Saline pH 7.4, sterile | ThermoFisher Scientific, Gibco | 10010 | No Ca2+ or Mg2+ added |
Polyethersulfone (PES) Filter unit | Thermo Scientific Nalgene | UY-06730-43 | Hydrophilic PES membrane with low protein binding facilitates the filtering of solutions with high protein content |
PURESHIELD argon ISO 14175-I1-Ar | BOC Ltd. | 11-Y | For the protection of lipid stocks stored at +4 ºC. |
Purified Streptavidin | BioLegend | 280302 | |
Quantum Alexa Fluor 488 MESF beads | Bangs Laboratories Inc. | 488 | Benchmark beads for the interpolation of Alexa Fluor 488 molecules bound to cells and/or BSLB |
Quantum Alexa Fluor 647 MESF beads | Bangs Laboratories Inc. | 647 | Benchmark beads for the interpolation of Alexa Fluor 647 molecules bound to cells and/or BSLB |
Rat anti-mouse IgG Kappa Light Chain, clone OX-20 | ThermoFisher Scientific, invitrogen | SA1-25258 | Labeled in house with Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) |
Recombinant human IL-2 | Peprotech | 200-02-1MG | |
RMPI Medium 1640 (1x); [-] L-Glutamine | ThermoFisher Scientific, Gibco | 31870-025 | |
Rosette Human B Cell Enrichment Cocktail | STEMCELL Technologies | 15064 | Isolation of B cells for measuring densities of proteins in purified cell populations |
Rosette Human CD4+ T Cell Enrichment Cocktail | STEMCELL Technologies | 15022C.1 | |
Rosette Human CD4+CD127low T Cell Enrichment Cocktail | STEMCELL Technologies | 15361 | Pre-enrichment of CD4+ CD127Low T cells for the downstream isolation of Tregs by FACS. |
Rosette Human CD8+ T Cell Enrichment Cocktail | STEMCELL Technologies | 15063 | |
RPMI Medium 1640 (1x); [-] Phenol Red | ThermoFisher Scientific, Gibco | 11835-063 | For the incubation (co-culturing) of BSLB and cells in the absence of CO2. Phenol red-free media reduces the autofluorescence of cells in flow cytometry and microscopy based measurements. |
Sodium Pyruvate (100 mM) | ThermoFisher Scientific, Gibco | 11360-070 | |
Sprout mini centrifuge | FisherScientific, Heathrow Scientific LLC | 120301 | Benchtop microcentrifuge used to wash silica beads and BSLB in 1.5 mL Eppendorf tubes. |
Sterile cappeed 5 mL polystyrene round-bottom tubes | Falcon | 352058 | |
UltraComp eBeads Compensation Beads | ThermoFisher Scientific, invitrogen | 01-2222-42 | |
Zeba Spin Desalting Columns 7K MWCO | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen™ | 89882 |