Конденсатная реакция Клейзена-Шмидта является важной методологией для генерации конъюгированных велосипедных ароматических соединений, спрягаемых на метане. Благодаря использованию базового варианта реакции алдола, ряд флуоресцентных и / или биологически соответствующих молекул могут быть доступны через в целом недорогой и оперативно простой синтетический подход.
Конъюгированные конъюгированные велосипедные ароматические соединения являются общими составляющими целого ряда биологически релевантных молекул, таких как порфирины, дипыриноны и фармацевтические препараты. Кроме того, ограниченное вращение этих систем часто приводит к высокой до умеренно флуоресцентных систем, как наблюдается в 3H,5H-dipyrrolo’1,2-c:2′,1′-f’pyrimidin-3-ones, xanthoglows, pyrroloindolizinedione аналоги, BODIPY аналоги, и фенольные и imidazolinone кольцевых систем Зеленого флуоресцентного белка (GFP). Эта рукопись описывает недорогой и оперативно простой метод выполнения конденсата Клейзен-Шмидт для создания серии флуоресцентных рН зависимых пиразол / имидазол / изойндолон дипиринон аналогов. Хотя методология иллюстрирует синтез дипиринона аналогов, она может быть переведена для производства широкого спектра конъюгированных велосипедистических ароматических соединений. Используемая в этом методе конденсатная реакция Клейзена-Шмидта ограничена нуклеофилами и электрофилами, которые обнуляются в основных условиях (нуклеофиловая составляющая) и неоленоизуемыми альдегидами (электрофилическим компонентом). Кроме того, нуклеофильные и электрофильные реакционы должны содержать функциональные группы, которые не будут непреднамеренно реагировать с гидроксидом. Несмотря на эти ограничения, эта методология предлагает доступ к совершенно новым системам, которые могут быть использованы в качестве биологических или молекулярных зондов.
Ряд спряженных велосипедных систем, в которых два ароматических кольца соединены монометином мостом, проходят изомеризацию через вращение связи, когда возбуждаются фотоном(рисунок 1A)1,2,3,4,5. Возбужденный изомер, как правило, расслабиться до состояния земли через нелучающих процессов распада6. Если энергетический барьер для вращения связи увеличен до достаточно большой степени, можно ограничить или предотвратить фотоизомеризацию. Вместо этого, фотонический возбуждение приводит к возбужденным синглетным состоянием, которое часто расслабляется через флуоресценцию, а не нелучающий распад(рисунок 1B). Ограничение фотоизомеризации чаще всего достигается механически ограничивающим вращением связей путем привязывания двух ароматических кольцевых систем ковалентными связями, тем самым запирая молекулу в определенном изомеристом состоянии. Этот подход был использован для создания нескольких различных флуоресцентных трициклических дипирринон и дипиролеметан аналоги, такие как: 3H,5H-dipyrrolo-1,2-c:2′,1′-f’pyrimidin-3-ones (1), xanthoglows (2)6,7, пирролоиндолизиндион аналоги (3)8, и BODIPYаналоги 9 (4, Рисунок 2), в котором пирролидин и / или пиррол кольцо системы привязаны с метиленом, карбонилом, или бор дифторо связующихся. Как правило, 1–4 обладают ΦF > 0,7 предполагая, что эти системы очень эффективны, как фторфор единиц.
Также можно ограничить фотоизомеризацию с помощью других средств, помимо ковалентной связи систем кольца. Например, кольца фенольных и имидазолинонов(рисунок 2)зеленого флуоресцентного белка (GFP) ограничиваются вращением белковой среды; ограничительная настройка увеличивает квантовую доходность на три порядка величины по сравнению с той же единицей хромофора в свободном растворе10. Считается, что белок эшафот GFP обеспечивает вращательное барьер через стерические и электростатические эффекты11. Недавно наша группа в сотрудничестве с группой Odoh в Университете Невады, Рено обнаружил другую систему флюорофора, которая несет структурное сходство с дипиринон основе ксантоглоу систем (Рисунок 2)12. Эти аналоги дипиринона, однако, отличаются от системы ксантогов в том, что внутримолекулярные водородные связи, а не ковалентные связи, сдерживают фотоизомеризацию и приводят к флуоресцентной велосипедной системе. Кроме того, пиразол, имидазол и изойндолон дипиринон аналоги могут водородной связи в протонированных и депротонированных состояний; депротонация приводит к смещению красных волн возбуждения и выбросов, что, вероятно, объясняется изменением электронного характера системы. Хотя водородные связи, как сообщается, увеличение квантовой урожайности, хотяограниченное вращение 13,14,15,16, мы не знаем о какой-либо другой флюорофорной системы, в которой ограниченная изомеризация служит режимом флуоресценции как в протонированных и депротонированных состояний молекулы. Таким образом, эти рН зависимых дипиринон фторфоры уникальны в этом отношении.
В этом видео мы сосредоточимся на синтезе и химической характеристике аналоговой серии флуоресцентных дипиринонов. В частности, особое внимание уделяется методологии конденсации Клейзен-Шмидт, которая использовалась для построения полной серии флуоресцентных аналогов. Эта реакция опирается на генерацию базового опосредованного винилогоя энолета, который атакует группу альдегидов, чтобы произвести алкоголь, который впоследствии подвергается ликвидации. Для аналоговой серии дипиринона пирролинон/изойндолон преобразуется в энолат для облегчения нападения на группу альдегидов, прикрепленную к пиразолу или имидазоловому кольцу(рисунок 3); после ликвидации образуется полностью конъюгированный велосипедная система, соединенная метан-мостом. Примечательно, что вся серия аналогов дипиринона может быть построена из легкодоступных коммерческих материалов и может быть произведена в одной последовательности реакции одного горшка, как правило, в умеренных и высоких урожаев (доходность варьируется от примерно 50-95%). Поскольку большинство аналогов дипиринона имеют высококристаллическую природу, для получения аналитически чистых образцов требуется очень мало очистки вне стандартных условий работы. Следовательно, эта система флюорофора требует лишь нескольких шагов для доступа из легкодоступных коммерческих материалов и может быть синтезирована, очищена и подготовлена для аналитических или биологических исследований в относительно короткие сроки.
Подход к конденсации Клейзен-Шмидт обеспечивает довольно надежное средство генерации пиразола, имидазола и изойндолона дипиринона флюорофоров с помощью относительно упрощенного в эксплуатации протокола. Хотя синтез флуоресцентных аналогов дипиринона был в центре внимания этого ис?…
The authors have nothing to disclose.
З.Р.В. и Н.B. благодарят NIH (2P20 GM103440-14A1) за щедрое финансирование, а также Jungjae Koh и Университет Невады, Лас-Вегас за помощь в приобретении 1H и 13C NMR. Кроме того, мы хотели бы поблагодарить студентов НСК визуальных средств массовой информации, Арнольд Placencia-Флорес, Обри Джейкобс, и Алистер Купер за их помощь в съемках и анимации процессов в кинематографических части этой рукописи.
3-ethyl-4-methyl-3-pyrrolin-2-one | Combi-Blocks | [766-36-9] | Yellow solid reagent |
isoindolin-1-one | ArkPharm | [480-91-1] | Off-white solid reagent |
5-bromoisoindolin-1-one | Combi-Blocks | [552330-86-6] | Pink solid reagent |
2-formylimidazole | Combi-Blocks | [10111-08-7 ] | Off-white solid reagent |
Imidazole-4-carbaldehyde | ArkPharm | [3034-50-2] | Solid reagent |
1-H-pyrazole-4-carbaldehyde | Oakwood Chemicals | [35344-95-7] | Solid reagent |
1-H-pyrazole-5-carbaldehyde | Matrix Scientific | [3920-50-1] | Solid reagent |
Solid KOH Pellets | BeanTown Chemicals | [1310-58-3] | White solid pellets |
Siliflash Silica Gel | Scilicycle | R12030B | Fine white powder |
Phosphate Buffered Saline (PBS) (x10) | Growcells | MRGF-6235 | Colorless translucent liquid |
Beckman Coulter DU-800 UV/Vis Spectrophotometer and Software | Beckman Coulter | N/A | Spectroscopy Instrument and Software |
Fluoromax-4 Spectrofluorometer | Horiba Scientific | N/A | Spectroscopy Instrument |
FluorEssence Fluoremetry Software V3.5 | Horiba Scientific | N/A | Spectroscopy Software |
Finnpipette II Micropipette (sizes: 100-1,000, 20-200, and 0.5-10 µL) | Fischerbrand | N/A | Equipment |
Wilmad-LabGlass Rotary Evaporator (Model: WG-EV311-V-PLUS) | SP Scienceware | N/A | Equipment |
DuoSeal Vacuum Pump (Model Number: 1405) | Welch | N/A | Equipment |
GraphPad Prism 4 | GraphPad | N/A | Data Analysis Software |
SympHony pH Meter (Model: Sb70P) | VWR | N/A | Equipment |