דג זברה היא מערכת מודל יש תכונות רבות ערך כולל בהירות אופטית, התפתחות חיצוני מהירה,, חשוב במיוחד בתחום השמיעה ושיווי, מבחוץ ממוקם תאי שיער חישה. מאמר זה מתאר כיצד הטרנסגניים דג זברה יכול לשמש כדי assay שיער-תא mechanosensation ותפקוד presynaptic בוססו.
תאי חישה שיער הם mechanoreceptors נמצאו באוזן הפנימית הנדרשים עבור השמיעה ושיווי. תאים שיער מופעלות בתגובה לגירויים החישה זה מכנית להסיט את הפסגה בליטות קרא צרורות שיער. סטיה פותח ערוצי mechanotransduction (MET) צרורות שיער, המוביל אל זרם של קטיונים, כולל סידן. זה זרם הקטיון depolarizes התא ופותחת ערוצי סידן ממותגת מתח הממוקם basally presynapse שיער-cell. ביונקים, תאים שיער הם בארגז, זה מאתגר להעריך באופן פונקציונלי פעילויות אלה ויוו. לעומת זאת, דג זברה זחל שקופים והינם בעלי איבר מבחוץ ממוקם לרוחב שורה המכילה תאים שיער. אלו תאים שיער יופי של מבנית דומה בתרבית של תאים שיער, יכול להיות פונקציונלית מוערך ויוו. מאמר זה מתאר שיטה אשר מנצל מחוון סידן מקודדים גנטית (GECI), GCaMP6s, כדי למדוד את הגירוי-עורר סידן אותות בתאים דג זברה לרוחב קו השיער. GCaMP6s ניתן להשתמש, יחד עם הדמיה קונאפוקלית, למדוד אותות סידן ויוו איפקס, בסיס של תאים שיער קו לרוחב. אותות אלה מספקים בזמן אמת, הניתנות לכימות, מפרט. של החלקים שתי פעילויות סידן mechanosensation ותלוי presynapse בתוך התאים האלה שיער. אותות אלה סידן גם לספק מידע פונקציונלי חשוב לגבי כמה תאים שיער לזהות ושידור של גירויים. בסך הכל, טכניקה זו יוצרת נתונים שימושי אודות השינויים בפעילות סידן ויוו. . זה פחות מתאים היטב על כימות של בהירות מוחלטת של סידן שינויים. טכניקה זו אין ויוו רגיש לחפצים תנועה. כמות סבירה של תרגול ומיומנות נדרשים עבור מיקום מתאים, קיבעון, גירוי של הזחלים. בסופו של דבר, כאשר, בביצוע פרוטוקול שתואר במאמר זה מספק דרך רבת עוצמה כדי לאסוף מידע חיוני אודות הפעילות של תאי-שיער במדינות שלהם טבעי, אינטגרטיבי בתוך-חיים.
הדמיה תפקודית סידן הוא כלי רב עוצמה שיכול לשמש כדי לפקח על הפעילות של רבים תאים בו זמנית1. בפרט, הדמיית סידן באמצעות מחווני סידן מקודדים גנטית (GECIs) הוכח להיות יתרון כי GECIs יכול להתבטא סוגי תאים ספציפיים לשפות אחרות subcellularly2. במחקר מדעי המוח, תכונות אלה הפכו סידן הדמיה באמצעות GECIs שיטה חזקה כדי להגדיר דפוסי הפעילות בתוך רשתות עצביים והן למדוד זרם סידן הסינפסות בודדים3,4. תוך ניצול תכונות אלה, מחקר שנערך לאחרונה נעשה שימוש מיקרוסקופיה קונפוקלית GECIs כדי לעקוב אחר פעילות subcellular בתוך אוספים של תאים שיער חושי5.
תאים שיער הן mechanoreceptors לזהות גירויים קול ואת שיווי המשקל באוזן הפנימית, תנועת המים המקומי במערכת לרוחב-line6,vetebrates הימית7. תאים שיער לעתים קרובות המטרה של נזק או מוטציות גנטיות שגורמות הצורה הנפוצה ביותר של אובדן שמיעה בבני אדם המכונה שמיעה sensorineural אובדן8,9. לכן, חיוני להבין כיצד אלה התאים פועלים כדי להבין כיצד לטפל ולמנוע אובדן שמיעה. לתפקד כראוי, תאים שיער לנצל שני מבנים מיוחדים הנקראים mechanosensory-שיער חבילות וסרטים סינפטית ויוכל להעביר גירויים, בהתאמה. צרורות שיער ממוקמים השיא של תאים שיער, מורכב בעיקר של בליטות בסדר, שיער כמו המכונה stereocilia (איור 1א’). שיווי המשקל ואת קו הצד תאים שיער, תתי שיער יש גם עם kinocilium ארוך בודד (ריסי האמיתית היחידה של התא), אשר יכול להאריך הרבה מעל stereocilia (איור 1א’). Mechanosensory גירויים להסיט צרורות שיער, סטיה שם המתח על קישורים שנקרא “טיפ-קישורים” המקשרות stereocilia10. המתח הזה פותח ערוצי mechanotransduction (MET) ממוקם stereocilia, וכתוצאה מכך זרם הפסגה של קטיונים, כולל סידן11,12. בסופו של דבר, פעילות זו הפסגה depolarizes תא שיער ופותח ערוצים ממותגת מתח סידן (Cav1.3) בבסיס של התא. Cav1.3 ערוצי נמצאים סמוך לרצועות סינפטית, מבנה presynaptic אשר היתדות שלפוחית-אזורי פעיל. סידן הבזליים זרם דרך Cav1.3 ערוצים נדרשת עבור שלפוחית פיוז’ן, עצבית, והפעלה של נוירונים מביא13,14.
במשך שנים רבות, אלקטרופיזיולוגיות טכניקות כגון תאים כל תיקון מחבר חובק למעקה שימשו כדי לחקור את מאפייני פונקציונלי של תאים שיער במינים רבים, כולל דג זברה15,16,17, 18,19,20. ההקלטות אלקטרופיזיולוגיות היה יקר במיוחד בתחומי השמיעה ושיווי כי הם יכולים לשמש כדי לקבל מדידות מאוד רגישות מתאי החישה בודדים, שמטרתו קידוד גירויים מהיר במיוחד מעל מגוון רחב של תדרים ועוצמות21,22. למרבה הצער, כל תא הקלטות. אי אפשר לאמוד את הפעילות של אוכלוסיות של תאי שיער. ללמוד את הפעילות של אוכלוסיות של תאים לקו לרוחב דג זברה, פוטנציאל microphonic, פוטנציאל פעולה מביא שימשו כדי למדוד את mechanosensitive מסוכם והמאפיינים postsynaptic התגובה של הפרט neuromasts23 ,24. למרבה הצער, לא כל תא הקלטות ולא מדידות פוטנציאליים שדה מקומי יש את הרזולוציה המרחבית לאתר שבו הפעילות מתרחשת בתוך תאים בודדים או למדוד את הפעילות של כל תא בתוך אוכלוסיה. לאחרונה, צבע סידן ו GECIs יש כבר מועסקים כדי לעקוף את אלה אתגרים25,26.
בדג זברה, GECIs הוכיחו להיות בגישה רב-עוצמה לבחינת תפקוד תא שיער בשל הקלות היחסית יצירת דג זברה מהונדס ועל בהירות אופטית הזחלים27. בדג זברה הזחלים, נמצאים תאים שיער באוזן הפנימית, כמו גם מערכת קו הצד. הקו לרוחב מורכב של שושנת עלים דמויי אשכולות של שיער תאים הנקראים neuromasts המשמשים לזהות שינויים המקומיות תנועת המים (איור 1). מערכת קו הצד שימושי במיוחד מאחר שהוא ממוקם באופן חיצוני על פני הדג. גישה זו איפשרה לעורר תאים שיער ולמדוד את אותות סידן שטיחות ב הזחלים ללא פגע. בסך הכל, הקלות של transgenesis, השקיפות של הזחלים, וגישה ללא תחרות של תאים שיער קו הצד הפכו דג זברה מודל לא בפז ללמוד את הפעילות של תאים שיער ויוו. זהו יתרון משמעותי לעומת מערכות יונקים שבו תאים שיער מוקף מבנים גרמי של האוזן הפנימית. חוסר הגישה הפכה קשה מאוד לרכוש פונקציונלי ויוו מדידות של בתרבית של תאים שיער.
פרוטוקול שמפורטות כאן מתאר כיצד לעקוב אחר השינויים ערוץ ותלוי presynapse MET סידן תוך תאים שיער בודדים, בין תאים בתוך neuromasts של דג זברה זחל. פרוטוקול זה מנצל קו הוקמה דג זברה מהונדס המבטא של GCaMP6s מותאמת לשפות אחרות ממברנה תחת השליטה של תאים שיער מסוים myosin6b יזם28. לוקליזציה קרום זה עמדות GCaMP6s כדי לזהות זרם סידן דרך תעלות יונים ממוקם קרום פלזמה קריטית לתפקוד תאי שיער. לדוגמה, GCaMP6s מקומי-ממברנה יכול לזהות סידן זרם דרך MET ערוצי בחבילות שיער הפסגה ודרך CaV1.3 ערוצי ליד סרטי הסינפטית בבסיס של התא. זה מנוגד באמצעות GECIs מקומית של ציטוזול, כפי cytosolic GECIs לזהות אותות סידן הם שילוב של המטרופוליטן CaV1.3 ערוץ פעילות, כמו גם תרומות סידן ממקורות אחרים (למשל, חנות לשחרר). פרוטוקול זה מתאר כיצד לשתק, לשתק את הזחלים הטרנסגניים GCaMP6s לפני הדמיה. אז הוא מתאר כיצד להכין ולהשתמש מטוס נוזל כדי להסיט את צרורות שיער כדי לעורר תאים שיער קו הצד באופן מבוקר לשחזור. נציג נתונים יכולה להיות מושגת באמצעות פרוטוקול זה מוצגים. דוגמאות של נתונים מייצגים תנועה חפצים מוצגים. ניסויים בקרה המשמשים כדי לאמת תוצאות או לא לכלול פריטים מתוארים. לבסוף, מתוארת שיטה להציג באופן חזותי מרחבי סידן אותות בתוכנה פיג’י. ניתוח זה פיג’י היא ממאמרו של שיטות הדמיה שנקבעו קודם פותח באמצעות MATLAB5. בסך הכל, פרוטוקול זה מתווה הכנה עוצמה טכניקה המשתמשת GECIs ב דג זברה זחל כדי למדוד והמחש שיער-תא סידן dynamics ויוו.
דימות in vivo בבעלי חיים שלמים הוא מטבעו מאתגר. מספר צעדים בשיטה זו הן קריטיות להשגת אמין ויוו מדידות סידן מתאי לרוחב קו השיער. לדוגמה, חשוב מאוד כי הזחל מוצמדים, משותק כראוי לפני הדמיה כדי למזער את התנועה במהלך דימות. תנועה עודפת במהלך דימות יכול להוביל שינויים בזריחה GCaMP6s כי אינם אותות אמת, שלא תואמים לשינויים ברמות הסידן (למשל, דמויות 4B1′-B1 ‘ , 4 C 1′-C1 ‘). הזנב סיכות ניתן להציב יותר anteriorly כדי לסייע במזעור התנועה, אם כי זה עלול להפוך neuromasts האחורי יותר לא נגיש. יתר על כן, לאחר ההזרקה הלב, סיכות ראש ניתן לסובב כך החלק האופקי של ה-pin שוכבת על פני החלמון. בנוסף שינוי המיקום של סיכות, זה גם ניתן להשתמש נבל פרוסות המוח במקום סיכות כדי לשתק את הזחלים34. כשהוא ממוקם על הזחלים כראוי, נבל הוא נוסף, שעשוי להיות פחות פולשני בשיטה בקיבוע הזחלים. בזמן תנועה משמעותית יכול לנבוע הצמדה לקוי, כשל לבצע כראוי את הזריקה הלב כדי לספק α-bungarotoxin, לשתק את הזחלים יכול לגרום לשיתוק לא שלם, תנועה, ותנועה בסופו של דבר חפצים. למרות הרדמה נפוץ הוכחו להשפיע על רגישות תאי שיער דג זברה, עבודה אחרונים הראו בנזוקאין הרדמה לא מפריע היבטים רבים של פעילות תאי שיער. באופן דומה, יותר נפוץ הרדמה ש-MS-222 רק מפריע היבטים מסוימים של פעילות של תאים שיער15. לכן, בשל אופיו מאתגר של α-bungarotoxin הזרקת, בנזוקאין או MS-222 יישום עשויה להיות שיטה חלופית שימושית שיתוק כדי למנוע תנועת הזחל במהלך הדמיה תפקודית סידן.
בנוסף האתגרים הטכניים שמעורבים במשימה פרוטוקול זה, אפילו מדגם נטען בצורה מושלמת היא חסרת תועלת אם זחל של תאים שיער אינם בריאים לפני כן, במהלך ניסוי הדמיה. כדי להבטיח כי הזחלים ותאים שיער בריא, חשוב כי הזחלים נשמרים במאגר E3 ללא תשלום של פסולת כגון chorions (קליפות ביצה), פסולת, מיקרואורגניזמים. למרות המיקום שטחית של תאים שיער קו הצד היא יתרון עבור הדמיה, מיקום זה הופך אותם לפגיעים יותר נזק תאי כאשר המאגר E3 היא עבירה. סביבה נקייה, מימית חשוב במיוחד עבור הזחלים הצעירים (2-4 dpf) או מוטציות. זה לא יכול לשמור על שחייה זקוף מקם ולשקר בעיקר בתחתית הפטרי. במצבים אלה, לרוחב קו השיער והתאים את cupula מגן סביב השיער חבילות יכול בקלות להיות בסכנה. גם כאשר החל הזחלים בריא תאים שיער, לאורך כל הניסוי, חיוני כדי להבטיח כי הזחל כולל פעימות, זרימת דם מהירה. אם זרימת הדם מאט או מפסיקה, הבריאות של תאי השיער יכול להיות בסכנה. פרוץ ההכנות לערב הזחלים לא בריא או אובדן של זרימת הדם, למות תאים שיער ניתן לזהות מספר דרכים: הראשונה, המראה של karyopyknosis או גרעיני התעבות, הבאה לידי ביטוי כמו בועה בתוך התא תחת DIC אופטיקה; שנית, על ידי תא הצטמקות ואת נוכחותם של נעה במהירות חלקיקים בתוך הציטופלסמה; והשלישי, כאשר kinocilia טיפים לפעור כיוונים שונים35. כאשר הם צרורות שיער, להזיז kinocilia splayed לא cohesively יחד במהלך גירוי.
ההכנה הזאת יש מספר מגבלות קלות, אחד להיות ההכנה רק נותרת איתנה במשך 1-3 שעות לאחר שהיא מתקבלת. שינויים כגון שימוש סיכות קטנות יותר או פרוסות המוח של נבל לשתק את הזחלים, הוספת מערכת זלוף רשאי להאריך את אורך החיים של הכנת ויוו . מגבלה נוספת היא photobleaching הזה, phototoxicity עלולה להתרחש לאחר חזר הדמיה ניסויים. דרך מרגשת אחת כדי להתגבר על האתגר הזה נועד להתאים פרוטוקול זה עבור מיקרוסקופ אור גיליונות. מיקרוסקופ אור גיליונות היא דרך רבת עוצמה כדי להפחית מאור המוקד, שמוביל פחות photobleaching ו- phototoxicity36. יחד, קיבעון עדינה וחשיפה פחות צילום-עשוי לסייע להאריך כל מושב הדמיה. הפעלות עוד הדמיה ניתן לבחון המשך מלא של שינויים פונקציונליים ליווי ופיתוח התהליכים שבבסיס סיווג תאים שיער והתחדשות לאחר פציעה. חשוב לציין כי בנוסף מיקרוסקופ אור גיליונות, פרוטוקול זה ניתן להתאים מערכות קונאפוקלית אחרות סוגים (לסריקת נקודה 2-פוטון, המסתובבים דיסק) כמו גם widefield פשוט יחסית מערכות28,34 . בסך הכל, צדדיות שלה עושה את זה פרוטוקול כלי חשוב כי ניתן הותאם בשימוש עם מספר מערכות הדמיה.
בעוד פרוטוקול זה יכול להיות הותאם בשימוש עם מערכות הדמיה רבים, חלקים של פרוטוקול זה יכול גם להיות מותאם ומשמשת (1) עם סממנים אחרים חוץ GCaMP6s, (2) כדי התמונה פעילות תאי חישה אחרים של נוירונים בתוך דג זברה זחל. לדוגמה, במחקר הקודם, השתמשנו פרוטוקול זה לפעילות התמונה באמצעות מחווני מקודדים גנטית מרובות בתוך תאים שיער קו הצד כדי לזהות סידן cytosolic (RGECO1), שלפוחית פיוז’ן (syphy ב), מתח הממברנה (Bongwoori), קרום סידן (jRCaMP1a-caax ו- GCaMP6s-caax), ובתוך קו הצד תהליכים מביא לגילוי ממברנה סידן (GCaMP6s-caax)5. על סמך הניסיון שלנו שימוש במחוונים אלה, הקו הטרנסגניים ש-tg(myo6b:gcamp6s-caax) המתוארות פרוטוקול זה מציע התחלה מצויינת הדמיה פעילות קו הצד neuromasts. של כל האינדיקטורים המפורטים לעיל, מצאנו כי GCaMP6s הוא רגיש ביותר, photostable. בנוסף לתכונות אלו, אנחנו להדגיש קו הטרנסגניים Tg(myo6b:GCaMP6s-caax) כי זה יכול לשמש כדי להפוך שתי מדידות שונות: שיער-תא mechanosensation וסידן presynaptic בתוך הטרנסגניים שורה אחת.
הטכניקה שתואר במאמר זה מדגים איך סידן הדמיה בשורה לרוחב דג זברה יכולה להיות שיטה חזקה כדי ללמוד כיצד תאים שיער לתפקד בסביבה הטבעית שלהם. גישה זו היא משלימה מחקרים של יונקים בתא שבו השיער פונקציה היא כיום נחקר ב explants vivo לשעבר . בנוסף, המודל דג זברה תוכל להמשיך לשמש כפלטפורמה כדי לבדוק את היעילות של אינדיקטורים מקודדים גנטית שניתן להחיל ואז לבחון פעילות בתרבית של תאי שיער.
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכה על ידי NIH/NIDCD מחקר מגזר קרנות 1ZIADC000085-01 (K.S.K.). ברצוננו להודות וונג ממתקים על הסיוע בכתיבת המאקרו פיג’י. כן נרצה להודות דוריס Wu ווונג ממתקים על ההערות המועילות שלהם עם הפרוטוקול.
Section 1 | |||
α-Bungarotoxin | R&D Systems | 2133 | For paralyzing larvae prior to imaging |
Phenol red Solution 0.5% | Sigma-Aldrich | P0290 | For visualization of α-bungarotoxin solution during heart injection |
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate (MESAB, MS-222, tricaine) | Sigma-Aldrich | A5040 | For anesthetizing larvae |
Section 2 | |||
Imaging chamber | Siskiyou | PC-R | Platform to mount larvae for imaging |
No. 1.5 Coverslips square, 22*22 mm | VWR | 48366-227 | To seal imaging chamber |
High vacuum silicone grease | Fischer Scientific | 14-635-5D | For affixing of coverslip to imaging chamber |
Silicone encapsulant clear 0.5 g kit | Ellsworth Adhesives | Dow Corning Sylgard, 184 SIL ELAST KIT 0.5KG | To fill imaging chamber to create a surface to pin fish |
Oven | Techne | HB-1D | For drying silicone encapsulant |
Stereomicroscope | Carl Zeiss Microscopy | Stemi 2000 with transmitted light illumination | For illuminating wire, forceps and scissors to make pins |
Fine forceps | Fine Science Tools | Dumont #5 (0.05 x 0.02 mm) Item No. 11295-10 | For making pins |
Fine scissors | Cole-Palmer | 5.5", EW-10818-00 | For cutting tunsgten wire to make pins |
Tungsten wire, 0.035 mm | Goodfellow | W005131 | For head pins to immobilize larvae |
Tungsten wire, 0.025 mm | ThermoFischer Scientific | AA10405-H4 | For tail pins to immobilize larvae |
Section 3 | |||
Micropipette guller | Sutter Instrument Company | P-97 | For pulling capillary glass for fluid-jet and heart injection needles |
Borosilicate glass capillaries w/ filament | Sutter Instrument Company | BF 150-86-10 | Glass to be pulled into α-bungarotoxin injection needles for heart injection |
Borosilicate glass capillaries w/o filament | Sutter Instrument Company | B 150-86-10 | Glass to be pulled into fluid-jet needles to stimulate hair cells |
Pipette polisher | Narishige | MF-830 microforge | To polish fluid-jet pipette tips to smooth jagged breaks |
Ceramic tile | Sutter Instrument Company | NC9569052 | For scoring and evening breaking fluid-jet needles |
Sections 4 & 5 | |||
Fine forceps | Fine Science Tools | Dumont #5 (0.05 x 0.02 mm) Item No. 11295-10 | For pinning larvae |
Gel loading tips | Eppendorf | 5242956003 | For backfilling heart injection needles |
Stereomicroscope | Carl Zeiss Microscopy | Stemi 2000 with transmitted light illumination | For illuminating larvae during pinning and heart injection |
Glass capillary/needle holder | WPI | MPH315 | To hold fluid-jet needles |
Manual micromanipulator | Narishige | M-152 | For holding and positioning of needle holder to inject α-bungarotoxin |
Magnetic stand | Narishige | GJ-1 | For holding manual micromanipulator for α-bungarotoxin injection |
Pressure injector | Eppendorf | Femtojet 4x | To deliver α-bungarotoxin |
Sections 6, 7 & 8 | |||
Confocal microscope | Bruker | Swept field/Opterra confocal microscope | Fixed, upright microscope with DIC optics and 488nm laser with appropriate filters |
Microscope software | Bruker | Prairieview 5.3 | To coordinate and control the microscope, lasers, stage, piezo-z, cameras and fluid jet |
10X air objective | Nikon | MRH00101 | Low magnification for positioning of larvae and fluid jet |
60X water objective | Nikon | MRF07620 | Water immerison objective with high NA (1.0) and adequate working distance (2.0 mm) |
Piezo-Z objective scanner with controller/driver | Physik Intruments instruments/Bruker | 01144210/UM-Z-PZ | High-speed z-stack acquisition with 0.025um accuracy |
EMCCD camera | QImaging | Rolera EM-C2 EMCCD camera | Camera with small pixel size that can acquire up to 100 frames per s |
Circular chamber adapter | Siskiyou | PC-A | For holding and rotating imaging chamber on microscope stage |
Motorized Z-deck stage | Prior Scientific | ZDN12MP | Microscope stage that can hold and move sample and micromanipulator with fluid-jet needle together |
Z-deck stage insert adaptor | NIH Machine shop | custom | To fit the circular chamber adaptor onto the z-deck stage |
Fluid-jet apparatus | ALA scientific instruments | HSPC-1 High-speed pressure Clamp with PV-PUMP | For controlling and delivering the fluid-jet stimulus |
Masterflex Peroxide-cured silicone tubing (1 ft) | Cole-Palmer | Masterflex L/S 13, 96400-13 | For connecting the fluid-jet needle holder to pressure pump |
Motorized micromanipulator | Sutter Instrument Company | MP-225 | For holding and positioning of needle holder for fluid jet |
Micromanipulator controller | Sutter Instrument Company | MPC-200 | For controlling fluid-jet needle manipulator |
Gel loading tips | Eppendorf | 5242956003 | For backfilling fluid-jet needles |
Glass capillary/needle holder | WPI | MPH315 | To hold fluid-jet needles |
PSI manometer | Sper Scientific | 840081 | For measuring pressure clamp output |
Section 9 | |||
BAPTA, Tetrapotassium Salt, cell impermeant | ThermoFischer Scientific | B1204 | To cleave tips links, uncouple MET channels and block all evoked GCaMP6s signals |
Isradipine | Sigma-Aldrich | I6658 | To block signals dependent on the L-type calcium channels (CaV1.3) at the presynapse |
DMSO | Sigma-Aldrich | D8418 | Solvent for pharmacological compounds |
Section 10 | |||
Prism7 | Graphpad | Prism7 | Software to plot GCaMP6 intensity changes |
FIJI | Schindelin, et., al.34 | https://fiji.sc/ | Software to process images and create spatio-temporal signal maps |
Turboreg Plugin | Thévenaz et., al.29 | http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/turboreg/ | Plugin to register GCaMP6 image sequences in FIJI |
StackReg Plugin | Thévenaz et., al.29 | http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/ | Plugin to register GCaMP6 image sequences in FIJI |
Times Series Analyzer V3 Plugin | Balaji J 2007, Dept. of Neurobiology, UCLA | https://imagej.nih.gov/ij/plugins/time-series.html | Plugin to create multiple ROIs to measure GCaMP6 intensity changes |