Der Zebrabärbling ist ein Modell, das hat viele wertvolle Eigenschaften einschließlich optischen Klarheit, schnelle externe Entwicklung und von besonderer Bedeutung auf dem Gebiet der Gehör und Gleichgewicht befindet sich extern sensorischen Haarzellen. Dieser Artikel beschreibt wie transgene Zebrafisch Haarzelle Mechanosensation und präsynaptischen Funktion in toto assay genutzt werden.
Sensorische Haarzellen sind Mechanorezeptoren gefunden im Innenohr, die für das hören und Gleichgewicht erforderlich sind. Haarzellen sind als Reaktion auf sensorische Reize aktiviert, die mechanisch apikalen Vorsprünge genannt Haar Bündel abzulenken. Durchbiegung öffnet Mechanotransduktion (MET) Kanäle in Haar bündeln, führt zu einem Zustrom von kationen, einschließlich Kalzium. Dieser Zustrom kation erschüttert die Zelle und öffnet Voltage-gated Calciumkanäle basal an der Haarzelle Presynapse gelegen. Bei Säugetieren Haarzellen sind eingehüllt in Knochen, und es ist schwierig, um diese Tätigkeiten in-vivo funktionell zu beurteilen. Im Gegensatz dazu Larven Zebrafisch sind transparent und besitzen eine extern befindet sich Seitenlinienorgan, die Haarzellen enthält. Diese Haarzellen sind funktionell und strukturell ähnlich wie Haare Säugerzellen und können funktionell in-vivo bewertet werden. Dieser Artikel beschreibt eine Technik, die einen genetisch codierte Kalzium-Indikator (GECI) nutzt, Signale GCaMP6s Reiz-evozierten Kalzium Messen in Zebrafisch-Seitenlinie Haarzellen. GCaMP6s kann verwendet werden zusammen mit confocal imaging, in-vivo Calcium-Signale an der Spitze und Basis der Seitenlinie Haarzellen messen. Diese Signale liefern eine in Echtzeit, quantifizierbare Auslesen der beiden Mechanosensation und Presynapse-abhängige Kalzium Tätigkeiten innerhalb diese Haarzellen. Diese Kalziumsignale bieten auch wichtige funktionelle Informationen über wie Haarzellen erkennen und sensorische Reize zu übertragen. Insgesamt erzeugt diese Technik nützliche Daten über relative Änderungen in Kalzium Aktivität in-vivo. Es eignet sich weniger für die Quantifizierung der Absolutwert des Kalzium-Änderungen. Diese in-vivo Technik reagiert empfindlich auf Bewegungsartefakte. Eine angemessene Menge an Übung und Geschick sind erforderlich für die richtige Positionierung, Immobilisierung und Stimulation der Larven. Letztlich, wenn richtig ausgeführt, das Protokoll in diesem Artikel beschriebenen bietet eine leistungsfähige Methode, wertvolle Informationen über die Aktivität der Haarzellen in ihre natürliche, voll integrierten Bundesstaaten ein lebendes Tier zu sammeln.
Funktionale Kalzium Imaging ist ein leistungsfähiges Werkzeug, das verwendet werden kann, um die Aktivität von vielen überwachen gleichzeitig1Zellen. Insbesondere Kalzium Bildgebung mittels genetisch codierte Kalzium Indikatoren (GECIs) nachweislich vorteilhaft sein, weil GECIs können, in bestimmten Zelltypen ausgedrückt werden und subcellularly2 lokalisiert. In der neurowissenschaftlichen Forschung haben diese Eigenschaften gemacht Kalzium Bildgebung mit GECIs eine leistungsfähige Methode, um sowohl Aktivitätsmuster innerhalb neuronaler Netzwerke definieren und Messen Kalzium Zustrom an einzelne Synapsen3,4. Unter Ausnutzung dieser Funktionen, eine aktuelle Studie konfokalen Mikroskopie und GECIs zur subzellulären Aktivität in Sammlungen von sensorischen Haarzellen5Überwachung eingesetzt.
Haarzellen sind Mechanorezeptoren, die Ton- und vestibuläre Reize im Innenohr und lokalen Wasserbewegung zu, in der Seitenlinie System in aquatischen Vetebrates6,7 erkennen. Haarzellen sind häufig das Ziel von Schäden oder genetische Mutationen, die die häufigste Form des Verlusts der Hörfähigkeit in den Menschen bekannt als Anhörung sensorineuralem Verlust8,9führen. Daher ist es wichtig zu verstehen, wie diese Zellen-Funktion um zu verstehen wie die Behandlung und Prävention von Hörverlust. Um richtig zu funktionieren, nutzen die Haarzellen zwei spezialisierte Strukturen, so genannte Mechanosensory-Haar-Bundles und synaptischen Bändern zu erkennen und zu reizen, bzw. zu übertragen. Haar-Bundles befinden sich an der Spitze der Haarzellen und bestehen hauptsächlich aus feinen, haarähnlichen Vorsprünge, bekannt als Stereocilia (Abb. 1A). Im vestibulären und Seitenlinie Haarzellen hat jedes Haarbündel auch eine einzelne lange Kinocilium (die Zelle einzig wahre Zilie), die weit über die Stereocilia (Abb. 1A) verlängern kann. Mechanosensory Reize abzulenken Haare bündeln, und Ablenkung legt Spannung auf Verbindungen genannt “Tipp-Links”, die Stereocilia10miteinander zu verbinden. Diese Spannung öffnet Mechanotransduktion (MET) Kanäle befindet sich in der Stereocilia, wodurch eine apikale Zustrom von kationen, darunter Kalzium11,12. Diese apikale Aktivität letztlich erschüttert die Haarzellen und Spannung-gated Calciumkanäle (CaV1.3) an der Basis der Zelle öffnet. CaV1.3 Kanäle werden angrenzend an synaptischen Bändern, einer präsynaptischen Struktur gefunden, die Vesikel an aktiven Zonen begrenzt. Basalen Kalzium Zustrom durch CaV1.3 Kanäle ist erforderlich für Vesicle Fusion, Neurotransmission und Aktivierung der afferenten Neuronen13,14.
Seit vielen Jahren elektrophysiologische Techniken wie die gesamte Zelle Patch spannen wurden verwendet, um die funktionellen Eigenschaften der Haarzellen in vielen Arten, darunter Zebrafisch15,16,17, Sonde 18,19,20. Diese elektrophysiologischen Aufnahmen wurden besonders wertvoll im Bereich hören und Gleichgewicht, weil sie verwendet werden können, zu extrem empfindliche Messungen aus einzelnen Sinneszellen, deren Zweck es ist, extrem schnelle Reize über kodieren ein breites Spektrum an Frequenzen und Intensitäten21,22. Leider messen nicht ganz-Zell-Aufnahmen die Aktivität der Bevölkerung von Haarzellen. Um die Aktivität der Bevölkerungen der Zellen in der Zebrafisch Seitenlinie zu untersuchen, wurden Mikrofonie Potenziale und afferenten Aktionspotentiale zur Messung der summierten Mechanosensitive und postsynaptischen Antworteigenschaften der einzelnen Neuromasts23 ,24. Leider haben weder ganze Zelle Aufnahmen noch lokales Feld möglicher Messungen die räumliche Auflösung zu lokalisieren, wo Tätigkeit vollzieht sich in den einzelnen Zellen oder die Aktivität der einzelnen Zellen innerhalb einer Population zu messen. Vor kurzem haben Kalzium Farbstoffe und GECIs eingesetzt worden, um diesen Herausforderungen25,26zu umgehen.
Im Zebrafisch erwiesen GECIs sich ein leistungsfähiger Ansatz zu prüfen, Haar-Zellfunktion aufgrund der relativen Leichtigkeit der transgenen Zebrafisch und die optische Klarheit der Larven27zu schaffen. Im Zebrafischlarven sind Haarzellen im Innenohr sowie die Seitenlinie System vorhanden. Die Seitenlinie ist bestehend aus Rosette-wie Cluster von Haarzellen genannt Neuromasts, die verwendet werden, um lokale Änderungen in Bewegung des Wassers (Abbildung 1) zu erkennen. Die Seitenlinie ist besonders nützlich, weil es nach außen entlang der Oberfläche des Fisches befindet. Dieser Zugang hat es ermöglicht, zu stimulieren Haarzellen und Kalziumsignale optisch in intakten Larven zu messen. Insgesamt, die Leichtigkeit der Transgenese, Transparenz der Larven und der beispiellosen Zugang der Seitenlinie Haarzellen haben Zebrafisch eine unschätzbare Modell, die Aktivität der Haarzellen in vivo zu studieren. Dies ist ein wesentlicher Vorteil im Vergleich zu Säugetieren Systemen in die knöchernen Strukturen des Innenohrs Haarzellen umgeben sind. Dieser Mangel an Zugang machte es sehr schwierig, in-vivo Funktionsmessungen von Säugerzellen Haar zu erwerben.
Das Protokoll hier skizzierten beschreibt das MET Kanal und Presynapse-abhängige Änderungen an Kalzium in einzelnen Haarzellen und zwischen den Zellen in Neuromasts im Larvenstadium Zebrafisch zu überwachen. Dieses Protokoll nutzt eine etablierten transgenen Zebrafisch-Linie, die eine Membran lokalisiert GCaMP6s unter der Kontrolle der Haarzelle spezifischen myosin6b Promotor28drückt. Diese Membran Lokalisierung Positionen GCaMP6s um Kalzium Zustrom durch Ionenkanäle befindet sich in der Plasmamembran zu erkennen, die für Haar-Zellfunktion wichtig sind. Beispielsweise erkennt Membran lokalisiert GCaMP6s Kalzium Zustrom durch MET Kanälen in apikalen Haare bündeln und durch CaV1,3 in der Nähe von synaptischen Bändern an der Basis der Zelle. Im Gegensatz dazu mit GECIs in das Zytosol lokalisiert wie cytosolischen GECIs Kalziumsignale erkennen, die eine Kombination von MET und CaV1.3 Kanal Aktivität sowie Kalzium Beiträge aus anderen Quellen (z. B., Speicher freizugeben). Dieses Protokoll wird beschrieben, wie immobilisieren und GCaMP6s transgenen Larven vor Bildgebung zu lähmen. Es beschreibt dann vorbereiten und einen Fluid-Jet verwenden, um die Haare-Bündel zur Seitenlinie Haarzellen in einer kontrollierten und reproduzierbaren Weise stimulieren abzuwenden. Repräsentative Daten, die mithilfe dieses Protokolls erreicht werden kann, werden vorgestellt. Beispiele für Daten, die Bewegungsartefakte darstellen werden ebenfalls vorgestellt. Experimente, die verwendet werden, um Ergebnisse zu überprüfen und auszuschließen Artefakte werden beschrieben. Zu guter Letzt bezeichnet man eine Methode, um räumliche Kalziumsignale in der Fidschi-Software zu visualisieren. Diese Fidschi-Analyse ist von vorher festgelegten Visualisierungsmethoden entwickelt mit MATLAB5angepasst. Dieses Protokoll beschreibt insgesamt eine starke Vorbereitung Technik, die verwendet GECIs im Larvenstadium Zebrafisch zu messen und visualisieren Haarzelle Kalzium Dynamik in-vivo.
In-Vivo Bildgebung bei intakten Tieren ist grundsätzlich schwierig. Mehrere Schritte in dieser Methode sind entscheidend für die Erlangung zuverlässig in Vivo Calcium-Messungen von Seitenlinie Haarzellen. Zum Beispiel ist es sehr wichtig, dass die Larve angeheftet und richtig gelähmt vor imaging zu Bewegung während der Bildgebung zu minimieren. Überschüssige Bewegung während der Bildgebung kann führen zu Veränderungen im GCaMP6s Fluoreszenz, die keine wahren Signale und Veränderungen der Calciumspiegel nicht entsprechen (z.B. Figuren 4B1′-B1” und 4 C 1′ C1”). Tail-Pins können mehr anterior zu minimieren, Bewegung, obwohl dies mehr posterior Neuromasts unzugänglich machen kann platziert werden. Darüber hinaus kann nach Herz-Injektion, Kopfstifte gedreht werden, dass der horizontale Teil des Stiftes über das Eigelb liegt. Zusätzlich die Veränderung der Position der Pins, ist es auch möglich, eine Gehirn-Scheibe Harfe statt Nadeln verwenden, um Larven34zu immobilisieren. Wenn über die Larven richtig platziert, ist eine Harfe eine zusätzliche, möglicherweise weniger invasive Methode der Immobilisierung Larven. Während nennenswerte Bewegung dazu führen kann, von unzureichend anheften, kann Nichterfüllung richtig die Herz-Injektion für α-Bungarotoxin und Larven zu lähmen unvollständige Lähmung, Bewegung, führen und letztlich Bewegung Artefakte. Obwohl häufig verwendeten Anästhetika gezeigt worden, um die Erregbarkeit der Zebrafisch Haarzellen beeinflussen, hat den letzten Arbeit gezeigt, dass die Betäubungsmittel Benzocain viele Aspekte des Haar-Zell-Aktivität nicht stört. In ähnlicher Weise verwendete mehr häufig Anästhetikum, die MS-222 nur mit bestimmten Aspekten der Haarzelle Aktivität15eingreift. Daher, aufgrund der anspruchsvollen Art der α-Bungarotoxin Injektion, Benzocain oder MS-222 Anwendung erweisen sich eine nützliche alternative Methode der Lähmung, Bewegung in die Larve während der funktionalen Kalzium-Aufnahme zu verhindern.
Neben den technischen Herausforderungen in diesem Protokoll ist auch eine perfekt montierte Probe nutzlos, wenn die Larve und Haarzellen nicht gesund vor und während jeder imaging Experiment sind. Um sicherzustellen, dass die Larven und Haarzellen gesund sind, ist es wichtig, dass Larven in E3 Puffer verwaltet werden, die frei von Verschmutzungen wie Chorions (Eierschalen), Abfall und Mikroorganismen ist. Obwohl die oberflächliche Lage der Seitenlinie Haarzellen vorteilhaft für die Bildgebung ist, macht diese Lage sie anfälliger für zelluläre Schäden bei der E3-Puffer verschmutzt ist. Eine saubere, wässrige Umgebung ist besonders wichtig für junge Larven (2-4 Dpf) oder Mutanten, die eine aufrechte schwimmen können nicht behaupten, zu positionieren und vor allem liegen auf dem Boden der Petrischale. In diesen Situationen können Seitenlinie Haarzellen und schützende Cupula, die rund um die Bündel Haare leicht beschädigt werden. Auch beim Starten mit gesunden Larven und Haarzellen im Laufe jedes Experiment ist es wichtig, sicherzustellen, dass die Larve Herzschlag und schnelle Durchblutung hat. Wenn der Blutfluss verlangsamt oder stoppt, kann die Gesundheit der Haarzellen beschädigt werden. In gefährdeten Vorbereitungen mit ungesunden Larven oder Verlust des Blutflusses, sterben Haarzellen identifiziert werden mehrere Möglichkeiten: Erstens durch das Auftreten von Karyopyknosis oder nuklearen Kondensation, was als eine Blase innerhalb der Zelle unter DIC Optik; Zweitens durch Schrumpfung der Zelle und das Vorhandensein von sich schnell bewegenden Partikel im Zytoplasma; und drittens, wenn Kinocilia Tipps in verschiedene Richtungen35, heraus spreizen. Wenn Haare Bündel gestört sind, die gespreizten Kinocilia bewegen sich nicht zusammenhängend zusammen während der Stimulation.
Dieses Präparat hat mehrere kleinere Einschränkungen, ein Wesen, dass die Vorbereitung bleibt nur für 1-3 Stunden nach seiner Gründung ist robust. Änderungen wie die Verwendung kleiner Stifte oder eine Gehirn-Scheibe Harfe, um Larven zu immobilisieren und Hinzufügen einer Perfusion System kann die Lebensdauer dieses Präparats in Vivo verlängern. Eine weitere Einschränkung ist, dass Immunofluoreszenz und Phototoxizität kann auftreten, nachdem bildgebende Studien wiederholt. Eine spannende Möglichkeit, diese Herausforderung zu meistern ist, dieses Protokoll für die Licht-Blatt Mikroskopie anzupassen. Licht-Blatt Mikroskopie ist eine leistungsfähige Methode, aus Licht fokussieren, was zu weniger Immunofluoreszenz und Phototoxizität36zu reduzieren. Zusammen, helfe sanfter Immobilisierung und weniger Foto-Exposition jeder bildgebenden Sitzung zu verlängern. Mehr bildgebende Sitzungen können verwendet werden, um die gesamte Dauer der funktionalen Veränderungen begleiten die Entwicklung und den Prozessen zugrunde liegenden Haarzellen Clearance und Regeneration nach Verletzungen zu untersuchen. Es ist wichtig, darauf hinzuweisen, dass neben Licht-Blatt-Mikroskopie, dieses Protokoll auf andere Arten konfokale Systeme (Punkt-Scan 2-Photonen und Spinnerei Disk) sowie relativ einfach Weitfeld Systeme28,34 angepasst werden kann . Alles in allem macht seine Vielseitigkeit ein wertvolles Werkzeug-Protokoll, das angepasst und mit mehreren bildgebenden Systemen verwendet werden können.
Während dieses Protokoll angepasst und mit vielen bildgebenden Systemen verwendet werden kann, können Teile dieses Protokolls auch angepasst und verwendet (1) mit anderen Indikatoren neben GCaMP6s und (2) Bild Tätigkeit in anderen Sinneszellen und Neuronen im Larvenstadium Zebrafisch. Z. B. in einer früheren Studie, wir dieses Protokoll zum Bild Aktivität mit mehrere genetisch codierte Indikatoren innerhalb des Seitenlinie Haarzellen zytosolischen Kalzium (RGECO1), Vesikel Fusion (SypHy), Membran-Spannung (Bongwoori) und Membran erkennen Kalzium (jRCaMP1a-Caax und GCaMP6s-Caax), und innerhalb der Seitenlinie afferenten Prozesse, Membran Kalzium (GCaMP6s-Caax)5zu erkennen. Basierend auf unserer Erfahrung im Umgang mit diesen Indikatoren, bietet die transgene Linie, die Tg(myo6b:GCaMP6s-caax) in diesem Protokoll beschrieben einen hervorragenden Start für imaging-Aktivität in Seitenlinie Neuromasts. Alle oben aufgeführten Indikatoren haben wir festgestellt, dass GCaMP6s der sensibelsten und photostabil. Zusätzlich zu diesen Funktionen markieren wir die Tg(myo6b:GCaMP6s-caax) transgene Linie weil es verwendet werden kann, um zwei unterschiedliche Messungen vorzunehmen: Haarzelle Mechanosensation und präsynaptischen Calcium innerhalb einer einzigen transgene Linie.
Die Technik, die in diesem Artikel beschriebenen zeigt wie Kalzium Bildgebung in der Zebrafisch Seitenlinie sein kann eine leistungsfähige Methode zur Funktionsweise von Haarzellen in ihrer natürlichen Umgebung zu studieren. Dieser Ansatz ist komplementär zum Studium der Säugetiere, die in die Haarzellen in Ex Vivo Explantaten Funktion derzeit untersucht wird. Darüber hinaus kann das Zebrafisch-Modell weiterhin als Plattform verwendet werden, um die Wirksamkeit der genetisch codierten Indikatoren zu testen, die dann angewendet werden kann, um Aktivität in Säugetierzellen Haar zu untersuchen.
The authors have nothing to disclose.
Diese Arbeit wurde von NIH/NIDCD intramuralen Forschung Mittel 1ZIADC000085-01 (K.S.K.) unterstützt. Wir würden gerne Candy Wong für ihre Hilfe bei der Fidschi-Makro schreiben zu bestätigen. Wir möchten auch Danke Doris Wu und Candy Wong für ihre Anregungen mit dem Protokoll.
Section 1 | |||
α-Bungarotoxin | R&D Systems | 2133 | For paralyzing larvae prior to imaging |
Phenol red Solution 0.5% | Sigma-Aldrich | P0290 | For visualization of α-bungarotoxin solution during heart injection |
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate (MESAB, MS-222, tricaine) | Sigma-Aldrich | A5040 | For anesthetizing larvae |
Section 2 | |||
Imaging chamber | Siskiyou | PC-R | Platform to mount larvae for imaging |
No. 1.5 Coverslips square, 22*22 mm | VWR | 48366-227 | To seal imaging chamber |
High vacuum silicone grease | Fischer Scientific | 14-635-5D | For affixing of coverslip to imaging chamber |
Silicone encapsulant clear 0.5 g kit | Ellsworth Adhesives | Dow Corning Sylgard, 184 SIL ELAST KIT 0.5KG | To fill imaging chamber to create a surface to pin fish |
Oven | Techne | HB-1D | For drying silicone encapsulant |
Stereomicroscope | Carl Zeiss Microscopy | Stemi 2000 with transmitted light illumination | For illuminating wire, forceps and scissors to make pins |
Fine forceps | Fine Science Tools | Dumont #5 (0.05 x 0.02 mm) Item No. 11295-10 | For making pins |
Fine scissors | Cole-Palmer | 5.5", EW-10818-00 | For cutting tunsgten wire to make pins |
Tungsten wire, 0.035 mm | Goodfellow | W005131 | For head pins to immobilize larvae |
Tungsten wire, 0.025 mm | ThermoFischer Scientific | AA10405-H4 | For tail pins to immobilize larvae |
Section 3 | |||
Micropipette guller | Sutter Instrument Company | P-97 | For pulling capillary glass for fluid-jet and heart injection needles |
Borosilicate glass capillaries w/ filament | Sutter Instrument Company | BF 150-86-10 | Glass to be pulled into α-bungarotoxin injection needles for heart injection |
Borosilicate glass capillaries w/o filament | Sutter Instrument Company | B 150-86-10 | Glass to be pulled into fluid-jet needles to stimulate hair cells |
Pipette polisher | Narishige | MF-830 microforge | To polish fluid-jet pipette tips to smooth jagged breaks |
Ceramic tile | Sutter Instrument Company | NC9569052 | For scoring and evening breaking fluid-jet needles |
Sections 4 & 5 | |||
Fine forceps | Fine Science Tools | Dumont #5 (0.05 x 0.02 mm) Item No. 11295-10 | For pinning larvae |
Gel loading tips | Eppendorf | 5242956003 | For backfilling heart injection needles |
Stereomicroscope | Carl Zeiss Microscopy | Stemi 2000 with transmitted light illumination | For illuminating larvae during pinning and heart injection |
Glass capillary/needle holder | WPI | MPH315 | To hold fluid-jet needles |
Manual micromanipulator | Narishige | M-152 | For holding and positioning of needle holder to inject α-bungarotoxin |
Magnetic stand | Narishige | GJ-1 | For holding manual micromanipulator for α-bungarotoxin injection |
Pressure injector | Eppendorf | Femtojet 4x | To deliver α-bungarotoxin |
Sections 6, 7 & 8 | |||
Confocal microscope | Bruker | Swept field/Opterra confocal microscope | Fixed, upright microscope with DIC optics and 488nm laser with appropriate filters |
Microscope software | Bruker | Prairieview 5.3 | To coordinate and control the microscope, lasers, stage, piezo-z, cameras and fluid jet |
10X air objective | Nikon | MRH00101 | Low magnification for positioning of larvae and fluid jet |
60X water objective | Nikon | MRF07620 | Water immerison objective with high NA (1.0) and adequate working distance (2.0 mm) |
Piezo-Z objective scanner with controller/driver | Physik Intruments instruments/Bruker | 01144210/UM-Z-PZ | High-speed z-stack acquisition with 0.025um accuracy |
EMCCD camera | QImaging | Rolera EM-C2 EMCCD camera | Camera with small pixel size that can acquire up to 100 frames per s |
Circular chamber adapter | Siskiyou | PC-A | For holding and rotating imaging chamber on microscope stage |
Motorized Z-deck stage | Prior Scientific | ZDN12MP | Microscope stage that can hold and move sample and micromanipulator with fluid-jet needle together |
Z-deck stage insert adaptor | NIH Machine shop | custom | To fit the circular chamber adaptor onto the z-deck stage |
Fluid-jet apparatus | ALA scientific instruments | HSPC-1 High-speed pressure Clamp with PV-PUMP | For controlling and delivering the fluid-jet stimulus |
Masterflex Peroxide-cured silicone tubing (1 ft) | Cole-Palmer | Masterflex L/S 13, 96400-13 | For connecting the fluid-jet needle holder to pressure pump |
Motorized micromanipulator | Sutter Instrument Company | MP-225 | For holding and positioning of needle holder for fluid jet |
Micromanipulator controller | Sutter Instrument Company | MPC-200 | For controlling fluid-jet needle manipulator |
Gel loading tips | Eppendorf | 5242956003 | For backfilling fluid-jet needles |
Glass capillary/needle holder | WPI | MPH315 | To hold fluid-jet needles |
PSI manometer | Sper Scientific | 840081 | For measuring pressure clamp output |
Section 9 | |||
BAPTA, Tetrapotassium Salt, cell impermeant | ThermoFischer Scientific | B1204 | To cleave tips links, uncouple MET channels and block all evoked GCaMP6s signals |
Isradipine | Sigma-Aldrich | I6658 | To block signals dependent on the L-type calcium channels (CaV1.3) at the presynapse |
DMSO | Sigma-Aldrich | D8418 | Solvent for pharmacological compounds |
Section 10 | |||
Prism7 | Graphpad | Prism7 | Software to plot GCaMP6 intensity changes |
FIJI | Schindelin, et., al.34 | https://fiji.sc/ | Software to process images and create spatio-temporal signal maps |
Turboreg Plugin | Thévenaz et., al.29 | http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/turboreg/ | Plugin to register GCaMP6 image sequences in FIJI |
StackReg Plugin | Thévenaz et., al.29 | http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/ | Plugin to register GCaMP6 image sequences in FIJI |
Times Series Analyzer V3 Plugin | Balaji J 2007, Dept. of Neurobiology, UCLA | https://imagej.nih.gov/ij/plugins/time-series.html | Plugin to create multiple ROIs to measure GCaMP6 intensity changes |