Ячейки автономных функций генов в мозге могут быть изучены, вызывая потери или получить функции в разреженных популяции клеток. Здесь мы описываем в утробе матери электропорации доставить рекомбиназа КРР в разреженных населения вызывают потери функции в vivoразвивающихся корковых нейронов с floxed генов.
Ячейки автономных функций нейронов генов могут быть выявлены, вызывая потери или получить функции гена в небольшой и редкие популяции нейронов. Для этого требуется создание мозаику, в которой нейроны с прибылей или убытков функции гена окружены генетически невозмущенной ткани. Здесь мы сочетаем системе рекомбинации Cre-lox с электропорации в утробе матери для того, чтобы генерировать ткани мозга мозаики, которые могут быть использованы для изучения клеток автономные функции генов в нейронах. ДНК конструкции (доступно через репозитории), кодирование для флуоресцентные метки и Cre рекомбиназа, вводятся в разработке корковых нейронов, содержащие гены с сайтов loxP в мозгах зародышей мыши, используя в утробе матери Электропорация. Кроме того мы описываем различные приспособления в метод электропорации в утробе матери , которые увеличивают выживаемость и воспроизводимость. Этот метод также включает установление титра для Cre опосредованной рекомбинации в разреженный или плотные популяции нейронов. Гистологические препараты помечены мозговой ткани не требуется (но могут быть адаптированы к) иммуногистохимия. Конструкции, используемые гарантируют что дневно помечены нейронов нести ген рекомбиназа Cre. Гистологические препараты позволяют морфологический анализ нейронов через конфокальная томография дендритных и аксональной беседки и дендритных шипиков. Потому что в разреженных мозаика ткани достигается прибылей или убытков функции, этот метод позволяет исследование клеток автономная необходимость и достаточность гена продуктов в естественных условиях.
Создание генетических мозаика — классический экспериментальная парадигма для понимания функции гена интереса. Чтобы определить, является ли необходимой для клеточном фенотипу ген, простейший подход вызывает потерю функции гена во всем организме (например , нокаут). Однако чтобы определить, если ген требуется конкретно определенного типа клеток, нокаут гена во всем организме не является допустимым подход. Вместо этого метода не требуется, приведет к потере функции гена в данной ячейке, в то время как он окружен ткани wildtype (т.е. генетически невозмущенной) — другими словами, создание мозаики тканей. Если мутант ячейки показывает мутант фенотип, но окружающие клетки wildtype, не гена функции клеток автономные образом. Анализ мозаика ткани, в которой мутантные клетки окружены wildtype ткани, идеально подходит для понимания клеток автономных функций генов, особенно в головном мозге, где нейронов и глии образуют обширную сеть взаимосвязанных ткани.
Несколько видов ткани мозга мозаики предоставляют мощные модели для изучения клеток автономных функций генов. Исследования были посвящены нейрональных трансплантации1, женский Х-хромосомой мозаичностью2,3,4, и эндогенного соматических мозаичностью5,6 нарисовали их выводы, основанные на мозаика ткани мозга. Условного удаления гена через систему Cre-lox рекомбинации является метод, который принимает полное преимущество большой доступности трансгенные мыши линий. В этом методе два loxP сайты появляются по обе стороны требуемую последовательность гена (например экзона), оставляя его в окружении loxP сайты, что оба лицом в одном направлении («floxed»). CRE рекомбиназа акцизов последовательности между сайты loxP7. CRE опосредованной рекомбинации можно достичь путем скрещивания floxed мышей к другой мыши линии, выражая Cre рекомбиназа наряду с флуоресцентные маркер в подмножество ячеек («Cre репортер линия»). Это было продемонстрировано в различных способов, чтобы раскрыть функции гена в подмножества ячеек, например возбуждающих нейронов или астроциты8. CRE репортер линии можно выразить CreERT2 разрешить Cre опосредованной рекомбинации быть наркотиков индуцибельной (сингл нейрон маркировки с индуцибельной Cre опосредованной нокаутом, или пятно)9. В другой стратегии под названием Мозаика анализ с маркерами (MADM)10,11КРР опосредованной interchromosomal Рекомбинация позволяет гомозиготных мутанта созданы наряду с гетерозиготной ткани. В этих подходов новая линия мышей должна производиться каждый раз для каждого кандидата ген или сотовой подтип, для которого проверяется. Кроме того рекомбиназа Cre могут быть введены постнатально через ионофорез12 или вирусных векторов (например аденоассоциированный вирусов13 или lentiviruses14 ношение сотовых подтип конкретных промоутеры). Эта стратегия создает сильный и послеродовой маркировки. Ориентироваться на развитие мозга корковых нейронов малонаселенных и пренатально, идеальной стратегии находится в утробе матери электропорации Cre рекомбиназа с маркером флуоресцентные.
Кроме объединения Cre-lox рекомбинации через в утробе матери электропорации производить мозаика ткани в естественных условиях, мы представляем несколько адаптации процедур из других опубликованных протоколов15,,16 17,18,19,,2021. Мы предоставляем информацию для улучшения успех размножения приурочен беременных самок. Мы также приводим наши две стратегии ввести разреженных и яркие маркировки нейронов коркового ткани: одна стратегия заключается в том, чтобы Титруйте уровни одной конструкции кодирования для рекомбиназа КРР и флуоресцентных маркеров22. Другая стратегия заключается в использовании системы «Supernova», разработанный специально с этими параметрами в виду23,24. Кроме того мы предлагаем улучшений на производстве последовательной микроинъекции пипетки и упрощения для хирургии электропорации в утробе матери . Наконец мы наметим важнейшие шаги в упрощенной гистологический препарат, который позволяет анализ дендритных шипиков и дендритных и аксональной беседок, без дальнейшего окрашивания или иммуногистохимия.
Здесь мы представляем сочетание в утробе матери электропорации с КРР рекомбиназа floxed мышей для создания мозаики мозговой ткани. Преимуществом этого подхода является, что новая линия мыши не нужно создаваться каждый раз разных клеточных подтип направлены: электропорация в утро?…
The authors have nothing to disclose.
Авторы благодарят щедрой поддержке Департамента биологии университета Джеймс Мэдисон и Джеймс Мэдисон университета свет микроскопии и визуализации объекта. Д-р Марк л Gabriele за полезные рекомендации относительно подготовки молодых послеродовой ткани, и Drs. Джастин Браун и Кори л Cleland щедрой координации хирургических материалов и пространства. Это исследование финансировалось частично совместный исследовательский грант 4-ва, партнерством для продвижения Содружества Вирджинии (G.S.V.) и по Вирджинии Академии от науки малых проекта исследовательский грант (G.S.V.). Поддержка была щедро предоставляемые Бетти Джо любящий Батлер ‘ 58 пожертвований для Undergraduate исследований стипендию (K.M.B.), Фаррелл летних исследований стипендию (K.M.B.), Джеймс Мэдисон университета второго века стипендию (K.M.B.), Джеймс Столетия стипендии университета Мэдисона (для C.J.H.), Университет Джеймса Мэдисона Люси Робинсон Поиск ‘ 30 Мемориал стипендию (Z.L.H.) и Джеймс Мэдисон университетский колледж науки и математика Грант факультет (для G.S.V.).
C57BL/6J mice | The Jackson Laboratory | #000664 | See "1. Mouse set-up" (step 1.1, "wildtype mice") |
GFP.Cre empty vector | AddGene | #20781 | See "2. DNA set-up" (step 2.1 "single DNA construct that codes for Cre recombinase as well as a fluorescent marker"). GFP.Cre empty vector was a gift from Tyler Jacks. |
pK029.CAG-loxP-stop-loxP-RFP-ires-tTA-WPRE (Supernova) | AddGene | #69138 | See "2. DNA set-up" (step 2.1 "Supernova" system) and http://snsupport.webcrow.jp/. pK029.CAG-loxP-stop-loxP-RFP-ires-tTA-WPRE (Supernova) was a gift from Takuji Iwasato. |
pK031.TRE-Cre (Supernova) | AddGene | #69136 | See "2. DNA set-up" (step 2.1 "Supernova" system) and http://snsupport.webcrow.jp/. pK031.TRE-Cre (Supernova) was a gift from Takuji Iwasato. |
pK038.CAG-loxP-stop-loxP-EGFP-ires-tTA-WPRE (Supernova) | AddGene | #85006 | See "2. DNA set-up" (step 2.1 "Supernova" system) and http://snsupport.webcrow.jp/. pK038.CAG-loxP-stop-loxP-EGFP-ires-tTA-WPRE (Supernova) was a gift from Takuji Iwasato. |
EndoFree Plasmid Maxi Kit (10) | Qiagen | #12362 | See "2. DNA set-up" (step 2.3 "endotoxin-free plasmid purification kit") |
Trypan Blue powder, BioReagent grade | Sigma | T6146-5G | See "2. DNA set-up" (step 2.5 "trypan blue") |
Sodium Chloride, ACS, 2.5 kg | VWR | BDH9286-2.5KG | See "2. DNA set-up" (step 2.5 "NaCl") |
Potassium Chloride, ACS, 500 g | VWR | #97061-566 | See "2. DNA set-up" (step 2.5 "KCl") |
Sodium phosphate dibasic, ReagentPlus, 100 g | Sigma-Aldrich | S0876-100G | See "2. DNA set-up" (step 2.5 "Na2HPO4") |
Potassium phosphate monobasic, ReagentPlus, 100 g | Sigma-Aldrich | P5379-100G | See "2. DNA set-up" (step 2.5 "KH2PO4") |
Hydrochloric acid, ACS reagent, 500 mL | Fisher Scientific | A144-500 | See "2. DNA set-up" (step 2.5 "HCl") |
P-97 Micropipette Puller | Sutter Instrument | P-97 | See "3. Pipette set-up" (step 3.1 "glass capillary puller") |
3.0 mm wide trough filament | Sutter Instrument | FT330B | See "3. Pipette set-up" (step 3.1 "glass capillary puller") |
Thin Wall Glass Capillaries, 4", 1 / 0.75 OD/ID | World Precision Instruments | TW100-4 | See "3. Pipette set-up" (step 3.1.1 "glass capillary") |
Single Ply Soft-Tech Wipes, 4.5" | Phenix | LW-8148 | See "3. Pipette set-up" (step 3.2.1 "single-ply task wipe"); other single-ply wipes (e.g. Kimwipes) can be used. |
Graefe Forceps, 7 cm, Straight, 0.7 mm 1×2 Teeth | World Precision Instruments | #14140 | See "4. In utero electroporation" (step 4.1 "Graefe forceps") |
Iris Scissors, 11.5 cm, Straight, 12-pack | World Precision Instruments | #503708-12 | See "4. In utero electroporation" (step 4.1 "iris scissors") |
Hartman Mosquito Forceps, 9 cm, Straight, 12-pack | World Precision Instruments | #503728-12 | See "4. In utero electroporation" (step 4.1 "Hartman mosquito forceps") |
General Purpose Non-Woven Sponges, 2" x 2", 4-ply | Medrepexpress | #2204-c | See "4. In utero electroporation" (step 4.1 "non-woven gauze sponges") |
Ring Tipped Forceps, 10 cm, Straight, 2.2mm ID | World Precision Instruments | #503203 | See "4. In utero electroporation" (step 4.1 "ring-tipped forceps") |
Pyrex petri dishes complete, O.D. × H 100 mm × 20 mm | Sigma-Aldrich | CLS3160102-12EA | See "4. In utero electroporation" (step 4.1 "Petri dishes") |
Flat Type Instrument Tray, Stainless Steel, 13-5/8" x 9-3/4" x 5/8" | Amazon | B007SHGAHA | See "4. In utero electroporation" (step 4.1 "stainless steel tray") |
Platinum Tweezertrode, 5 mm | BTX | #45-0489 | See "4. In utero electroporation" (step 4.3 and 4.16 "tweezer-type electrodes") |
ECM 830 Foot Pedal | BTX | #45-0211 | See "4. In utero electroporation" (step 4.3 and 4.17 "foot pedal") |
ECM 830 Generator | BTX | #45-0052 | See "4. In utero electroporation" (step 4.3 "generator") |
Single Animal Isoflurane Anesthesia System with Small Induction Box | Harvard Apparatus | #72-6468 | See "4. In utero electroporation" (step 4.4 and 4.6 "nose cone", step 4.4 "induction chamber") |
Ophthalmic ointment | Hanna Pharmaceutical Supply Co | #0536108691 | See "4. In utero electroporation" (step 4.7 "veterinary ophthalmic ointment") |
Space Gel (AIMS) | VWR | #95059-640 | See "4. In utero electroporation" (step 4.8 "sealed pouch filled with supersaturated salt solution") |
Hair Remover Gel Cream, Sensitive Formula | Veet | #062200809951 | See "4. In utero electroporation" (step 4.9 "depilatory cream") |
10ul Low Retention Tip Starter (960 tips/pk) | Phenix Research Products | TSP-10LKIT | See "4. In utero electroporation" (step 4.12 "sterile 10 µL micropipette tip") |
Aspirator tube assemblies for calibrated microcapillary pipettes | Sigma-Aldrich | A5177 | See "4. In utero electroporation" (step 4.15 "aspirator tube assembly") |
Braided Absorbable Suture, 4-0, Needle NFS-2(FS-2), 27" | Medrepexpress | MV-J397 | See "4. In utero electroporation" (step 4.19 "absorbable sutures") |
“LiquiVet Rapid” Tissue Adhesive | Medrepexpress | VG3 | See "4. In utero electroporation" (step 4.20 "tissue adhesive") |
Hypodermic syringes, polypropylene, Luer lock tip, capacity 1.0 mL | Sigma-Aldrich | Z551546-100EA | See "4. In utero electroporation" (step 4.21 "1 mL syringe") |
BD Precisionglide syringe needles gauge 26, L 1/2 in. | Sigma-Aldrich | Z192392-100EA | See "4. In utero electroporation" (step 4.21 "26G, ½” needle") |
Nestlets Nesting Material | Ancare | NES3600 | See "4. In utero electroporation" (step 4.24 "nesting materials") |
Sunflower Seeds, Black Oil, Sterile | Bio-Serv | S5137 | See "4. In utero electroporation" (step 4.24 "sunflower seeds") |
Paraformaldehyde, 97% | Alfa Aesar | A11313 | See "5. Histology" (step 5.1.1 "PFA") |
Economy Tweezers #3, 11 cm, 0.2 x 0.4 mm tips | World Precision Instruments | #501976 | See "5. Histology" (step 5.5 "tweezers") |
Agar powder | Alfa Aesar | #10752 | See "5. Histology" (step 5.8.1 "agar") |
Single-edge razor blades, #9 blade | Stanley Tools | #11-515 | See "5. Histology" (step 5.9 "single-edge razor blade") |
Specimen disc S D 50 mm | Leica | #14046327404 | See "5. Histology" (step 5.9 "vibrating microtome specimen disc") |
Buffer tray S assembly | Leica | #1404630132 | See "5. Histology" (step 5.10 "buffer tray") |
VT1000 S Vibratome | Leica | #14047235612 | See "5. Histology" (step 5.10 "vibrating microtome") |
Double Edge Razor Blades | Personna | BP9020 | See "5. Histology" (step 5.10 "blade") |
Knife Holder S | Leica | #14046230131 | See "5. Histology" (step 5.10 "knife holder") |
Studio Elements Golden Taklon Short Handle Round Brush Set | Amazon | B0089KU6XE | See "5. Histology" (step 5.12.1 "fine tipped paintbrush") |
Superfrost Plus Slides | Electron Microscopy Services | #71869-11 | See "5. Histology" (step 5.12.1 "microscope slide") |
ProLong Diamond Antifade Mountant, 10 ml | Thermofisher | P36970 | See "5. Histology" (step 5.12.3-5.12.4 "mountant") |
Cover Glass, 24 x 50 mm, No. 1 | Phenix Research Products | MS1415-10 | See "5. Histology" (step 5.12.4 "coverslip") |
4′,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride (DAPI) | Sigma-Aldrich | D9542 | See "5. Histology" (step 5.13.1 "DAPI") |
Fixed Stage Upright Microscope | Olympus | BX51WI | See "5. Histology" (step 5.15 "light microscope") |
Laser Scanning Confocal Microscope | Nikon | TE2000/C2si | See "5. Histology" (step 5.15 "confocal microscope") |
4x objective, NA = 0.20 | Nikon | CFI Plan Apo Lambda 4X | See "5. Histology" (step 5.15 "low-power objective") |
20x objective, NA = 0.75 | Nikon | CFI Plan Apo Lambda 20X | See "5. Histology" (step 5.15 "medium-power objective") |
60x objective, NA = 1.40 | Nikon | CFI Plan Apo VC 60X Oil | See "5. Histology" (step 5.15 "high-power objective") |