Протокол для синтеза алкильных-модифицированных гуанидин, основанных на использовании соответствующих предшественников представлен.
Группа гуанидин является одним из наиболее важных фармакофорных групп в медицинской химии. Только аминокислоты, несущая группу гуанидин представляет собой аргинин. В этой статье, простой способ для модификации гуанидин группы в пептидных лигандах обеспечиваются, с примером RGD-связывающим интегриными лигандов. Недавно было показано , что отличие модификация группы гуанидина в этих лигандов позволяет селективной модуляции подтипа (например, между подтипами αv и а5). Кроме того, ранее неизвестная стратегия для функционализации через группу гуанидин была продемонстрирована, и синтетический подход рассматривается в данном документе. Модификации , описанные здесь , включают терминально (N ω) алкилированная и ацетилированный гуанидин группу. Для синтеза, индивидуальные молекулы-предшественники синтезируются, которые затем подвергают реакции с ортогонально разблокированному амина, чтобы передать предварительно-modified гуанидин группа. Для синтеза алкилированных гуанидин, предшественники на основе N, N'-ди-Вос-1Н – пиразол-1-карбоксамидин используется для синтеза ацилированных соединений, предшественник выбора того , чтобы быть соответствующим образом ацилированной производным N -Boc- S – метилизотиомочевины, которые могут быть получены в одно- и двухступенчатых реакций.
Среди наиболее распространенных фармакофорных групп в природных лигандов представляет собой гуанидина группу, которая участвует в множественных взаимодействий 1, 2. Например, она служит в качестве потенциального четырехкратным донора водорода при взаимодействии водородной связи и участвует в электростатических взаимодействиях, такие как солевые мостики или катион-π взаимодействий. В медицинской химии, эта группа часто встречаются в лекарственных препаратах и лекарственных средств – кандидатах 4, хотя и очень часто , как гуанидин миметики 5, 6. Причиной развития гуанидина миметиков является удаление повсеместной, положительно заряженного гуанидина группы, а также регулировка липофильности лиганда. В пептидных лигандов, единственный гуанидина, содержащий группу-аминокислота представляет собой аргинин, который, следовательно, часто встречается в биоактивного области пептидных лигандов.
Очень прominent примером для аргинин-содержащий лиганд семейства является подсемейство из RGD-связывающих интегринов. В общем, интегрины являются классом рецепторов клеточной адгезии, которые принимают более важные функции во всех высших организмов. Некоторые из этих функций включают клеточную адгезию, миграцию и выживание клеток. Таким образом, они также участвуют в патологических признаков, таких как рак и фиброз. Интегрины представляют собой трансмембранные белки гетеродимерных, состоящие из альфа- и бета-субъединицы, которые образуют 24 известных в настоящее время интегрина подтипов; 8 из них признают последовательность трипептида Arg-Gly-Asp (RGD) = в их лигандов 7. Область связывания расположена на границе между этими двумя подтипами во внеклеточной части, так называемого интегрина головной группы 8. РГД признана двух общих взаимодействий: металл-ион-зависимой адгезии сайта (MIDAS) область, которая находится в бета-субъединицы, и который связывает карбоновую кислоту в лигандов (боковые чав АСП); и гуанидин группа лигандов, которая находится в альфа-субъединицы. Большинство интегринов подтипов неразборчивы и разделяют по крайней мере часть их естественного внеклеточного матрикса (ЕСМ) лигандами 9. Таким образом, для развития искусственных интегрина лигандов, основное внимание, помимо высокой аффинности связывания, подтип селективности. Недавно мы смогли раскрыть ключевой элемент для генерации подтипа селективных лигандов: в группу гуанидина. Через различных модификаций, biselective лиганды αv- и а5-содержащие интегрин подтипов может быть превращена в селективные соединения путем простых модификаций на гуанидин группы, которые затем могут различать различные α-субъединиц 10.
В кармане αv, группа гуанидин взаимодействует бок о бидентатном через солевой мостик с Asp218 11, 12. Это взаимодействие стакже наблюдается в α5β1 (здесь, с Asp227 в а5), но , кроме того, там наблюдается 13 конечный на взаимодействии группы гуанидина с остатком Gln (Gln221). Таким образом, мы модифицировали группу гуанидина в двух противоположных направлениях: в одном случае, путем блокирования бок о взаимодействии с метилирования N б группы гуанидина, и в другом случае, с метилирования гуанидин N со, блокируя взаимодействие с торца. Удивительно, но эта небольшая модификация привела к полному смещению селективности в лигандах. В дополнении к алкилированию, новый метод функционализации был введен в данной публикации. Классический метод функционализации для этого типа pentapeptidic лиганда через боковой цепи сопряжения аминокислоты не участвуют в связывании (например, К в с (RGDfK)) 14, 15. Вот,мы покажем, что функционализации также возможны путем модификации гуанидина – которая имеет решающее значение для связывания – с ацил или алкилированным линкером. Положительный заряд , что имеет важное значение для связывания сохраняется, и модели показывают , что длинные точки цепи из кармана связывания, обеспечивая тем самое идеальную возможность для крепления дополнительных линкеров и маркировка единиц (например, флуоресцентная метка или хелатор для молекулярного томография).
В этой работе, мы сосредоточиться на препаративных шагов для модификации группы гуанидина в аргинин-содержащих лигандов. Это предполагает синтез N со | -methylated видов, а также гуанидины с более длинными единицами компоновщика. Различные модификации включают ацильные и алкильные группы.
Предшественником guanidinylation является ортогонально деблокировали циклический пептид производного (с (OrnD (Ot – Бу) Gf (N Me) V)), который синтезировали с помощью стандартного протокола Fmoc твердофазного пептидного синтеза (SPPS). Ornithin был использован в качестве защищенного производно…
The authors have nothing to disclose.
ТГК признает Международную Высшую школу по науке и технике (IGGSE) из Technische Universität München за финансовую поддержку. HK признает центр Integrated Protein Science Мюнхен (CIPSM) для их поддержки.
N,N′-Di-Boc-1H-pyrazole-1-carboxamidine, 98% | Sigma Aldrich | 434167 ALDRICH | |
Triphenylphosphine, 99% | Sigma Aldrich | T84409 SIGMA-ALDRICH | |
Tetrahydrofuran, >99.5% | Carl Roth | 4745 | |
Tetrahydrofuran anhydrous, 99.8% | Carl Roth | 5182 | |
Methanol anhydrous, 99.8% | Sigma Aldrich | 322415 SIGMA-ALDRICH | |
Diisopropyl azodicarboxylate, 98% | Sigma Aldrich | 225541 ALDRICH | |
Dichlormethan, for synthesis, 99.5% | Carl Roth | 8424 | |
Silica gel for flash chromtaography | Sigma Aldrich | 60738 SIGMA-ALDRICH | |
n-Pentane, 99% | Carl Roth | 8720 | |
n-Hexane, 99% | Carl Roth | CP47 | |
Ethylacetate, 99.5% | Carl Roth | 7338 | |
Aminohexanol, 95% | Sigma Aldrich | A56353 ALDRICH | |
S-Methylisothiourea hemisulfate, 98% | Sigma Aldrich | M84445 ALDRICH | |
Di-tert-butyl dicarbonate, 99% | Sigma Aldrich | 205249 ALDRICH | |
N,N-Dimethylformamid, 99.8% | Carl Roth | A529 | |
N,N-Diisopropylethylamin, 99.5% | Carl Roth | 2474 | |
Acetic anhydrid, 99% | Carl Roth | 4483 | |
Chlortrityl resin | Carbolution | CC11006 | |
Fmoc-Gly-OH, 98% | Carbolution | CC05014 | |
Piperidin, 99% | Sigma Aldrich | 104094 SIGMA-ALDRICH | |
Fmoc-Orn(Dde)-OH | Iris-Biotech | FAA1502 | |
HATU, 99% | Carbolution | CC01011 | |
HOAt, 99% | Carbolution | CC01004 | |
Fmoc-Val-OH | Carbolution | CC05028 | |
2-Nitrobenzenesulfonyl chloride, 97% | Sigma Aldrich | N11507 ALDRICH | |
2,4,6-Collidine, 99% | Sigma Aldrich | 27690 SIGMA-ALDRICH | |
Mercaptoethanol, 99% | Sigma Aldrich | M6250 ALDRICH | |
Diazabicycloundecen, 98% | Sigma Aldrich | 139009 ALDRICH | |
Fmoc-D-Phe-OH, 98% | Sigma Aldrich | 47378 ALDRICH | |
Fmoc-Asp(OtBu)-OH, 98% | Carbolution | CC05008 | |
Hexafluoroisopropanol | Carbolution | CC03056 | |
Diphenylphosphoryl azide, 97% | Sigma Aldrich | 178756 ALDRICH | |
TFA, 99.9% | Carl Roth | P088 | |
Triisopropylsilan, 98% | Sigma Aldrich | 233781 ALDRICH | |
Acetonitrile, HPLC grade | Carl Roth | HN44 |