genotipado de<em> Staphylococcus aureus</em> por Ribosómica espaciador de PCR (RS-PCR)

Staphylococcus (S. aureus) se conoce como el patógeno más importante en todo el mundo responsable de la infección intramamaria (IMI) en el ganado ^1. El estudio realizado por Fournier et al., ² demostrado en las vacas suizas y los estudios realizados por Cosandey et al. ³ y de Boss et al. ⁴ en vacas de 12 países europeos que S. aureus aislado de bovino IMI es un grupo genéticamente heterogéneo. Mediante amplificación por PCR de la región espaciadora intergénica 16S-23S rRNA (RS-PCR), un total de 17 genotipos se detectaron inicialmente en 101 aislamientos epidemiológicamente independientes ^2. El genotipo B y C de genotipo (GTC) fueron más comunes (80%), mientras que los otros 15 genotipos (SMT) se produjeron en raras ocasiones, cada uno haciendo del 1 al 4% de todos los aislamientos. A nivel europeo ^3, GTB, GTC, GTF, GTI, y GTR fueron los genotipos más importantes que comprenden el 76% de todas las cepas analizadas (n = 456). GTB se encuentra en el centro de Europa wientras los otros genotipos se difundieron ampliamente. El 24% restante de las cepas incluyó 41 genotipos, muchos de ellos, sin embargo, se observaron sólo una vez.

Los estudios realizados por Fournier et al., ^2, Cosandey y col. ^3, y Graber et al. ⁵ demostraron además que los genotipos fueron altamente asociados con su patrón de genes de virulencia, así como en el suizo como a nivel europeo. Los estudios revelaron diferencias más grandes en la prevalencia entre IMI S. aureus GTB, GTC y los otros genotipos ^2,5: Teniendo en cuenta GTB, hasta el 87% de las vacas de un rebaño se infectaron por este genotipo. En el caso de GTC y de los otros genotipos, sin embargo, IMI fue sólo se encuentra en 1 a 2 vacas de un rebaño.

IMI causada por S. aureus, normalmente resulta en la inflamación de las glándulas mamarias correspondientes y un aumento de células inflamatorias en la leche. Como consecuencia de ello, la co células somáticasunts en la leche (SCC), el indicador clave de la calidad de la leche en la mayoría de los países, se incrementa dando lugar a una disminución del precio de la leche o incluso detener la entrega.

Además de la RS-PCR de Fournier et al. ^2, se han descrito otros métodos de tipificación para subtipificación cepas bovinas de S. aureus ^8-11. Dos de los más comunes incluyen la tipificación spa de ¹² y Multi Locus Secuencia Typing (MLST) ^13. El primero de ellos está basado en el ADN secuenciación de la región espaciadora variable del gen que codifica para la proteína de spa estafilocócica A, mientras que el segundo se requiere la secuenciación de los genes de limpieza 7. Esto significa que un ¹² y siete PCRs ^13, respectivamente, necesitan ser realizados, seguido de purificación amplicón, reacción de secuenciación y el análisis utilizando equipo específico. En comparación con RS-PCR, estos métodos requieren un esfuerzo adicional considerable en el laboratorio que resulta en un flujo de muestras de bajo y altos costos. losel rendimiento es especialmente baja en el PFGE. Teniendo en cuenta la resolución de estos métodos para las cepas de la especie bovina de S. aureus, RS-PCR es por lo menos tan bueno como spa escribir ⁴ y mejor que MLST ⁴ o PFGE ^15.

Todos estos métodos que incluyen la tipificación binaria ¹³ demostraron su eficacia en la obtención de una mayor comprensión de la patogénesis de la IMI bovina causada por S. aureus, pero debido a las restricciones mencionadas son menos apropiados para grandes investigaciones clínicas. Además, la genotipificación por RS-PCR como se describe por Fournier et al. ² permite la predicción fiable de la epidemiológica y el potencial patógeno de S. aureus involucrado en el IMI bovina, dos valores clave en la medicina veterinaria clínica.