Two assays for microscopy-based high-throughput screening of host factors involved in Brucella infection are described. The entry assay detects host factors required for Brucella entry and the endpoint assay those required for intracellular replication. While applicable for alternative approaches, siRNA screening in HeLa cells is used to illustrate the protocols.
Las especies de Brucella son patógenos intracelulares facultativos que infectan a los animales como sus huéspedes naturales. La transmisión al hombre es más comúnmente causada por el contacto directo con animales infectados o por la ingestión de alimentos contaminados y puede conducir a infecciones crónicas graves.
Brucella puede invadir las células fagocíticas profesionales y no profesionales y replica dentro del retículo endoplasmático (ER) -derivado vacuolas. Los factores del huésped requeridos para entrar en las células huésped Brucella, la evitación de la degradación lisosomal, y la replicación en el compartimiento ER-como siguen siendo en gran parte desconocido. A continuación se describen dos ensayos para identificar los factores del huésped implicados en la entrada de Brucella y replicación en células HeLa. Los protocolos describen el uso de ARN de interferencia, mientras que los métodos de detección alternativos se podrían aplicar. Los ensayos se basan en la detección de bacterias marcadas con fluorescencia en la etiqueta fluorescente células huésped utilizando automatizadoLa microscopía de campo amplio. Las imágenes fluorescentes se analizaron mediante un análisis de tuberías imagen normalizada en CellProfiler que permite solo de puntuación infección basado en células.
En el ensayo de punto final, la replicación intracelular se mide dos días después de la infección. Esto permite que las bacterias tráfico a su nicho replicativo en que se inicia la proliferación alrededor de 12 horas después de la entrada de bacterias. Brucella que se han establecido con éxito un nicho intracelular se hace un enérgico han proliferado en el interior de las células huésped. Puesto que las bacterias intracelulares serán más numerosos que en gran medida las bacterias no replicativos extracelulares o intracelulares individuales, una cepa que expresa constitutivamente GFP se puede utilizar. La señal de GFP fuerte se utiliza entonces para identificar las células infectadas.
Por el contrario, para el ensayo de entrada es esencial diferenciar entre intracelular y las bacterias extracelulares. Aquí, se utiliza una codificación de cepa para una GFP inducible por tetraciclina. Inducciónde GFP con la inactivación simultánea de bacterias extracelulares por gentamicina permite la diferenciación entre intracelular y bacterias extracelulares en base a la señal de GFP, con sólo las bacterias intracelulares ser capaz de expresar GFP. Esto permite la detección robusta de bacterias intracelulares individuales antes de que se inicie la proliferación intracelular.
Las especies de Brucella son gram-negativos, patógenos intracelulares facultativos pertenecientes a la clase de α-proteobacterias. Causan abortos e infertilidad en sus huéspedes naturales tales como vacas, cabras, ovejas o que resulta en graves pérdidas económicas en las zonas endémicas. La brucelosis es una de las enfermedades zoonóticas más importantes en todo el mundo que causan más de medio millón de nuevos casos de infección humana por año 1. La transmisión a humanos es causada generalmente por el contacto directo con animales infectados o por la ingestión de alimentos contaminados, tales como la leche no pasteurizada. Los síntomas de la enfermedad febril son inespecíficos, lo que provoca dificultades en el diagnóstico de la brucelosis. Si no se trata, los pacientes pueden desarrollar una infección crónica con síntomas más graves como la artritis, endocarditis y la neuropatía 2.
En el nivel celular Brucella es capaz de invadir las células fagocíticas y no fagocíticas y se replica dentro de un intracelularcompartimento conocida como la Brucella -Con vacuola (BCV). La internalización de bacterias requiere reordenamientos del citoesqueleto de actina por Rac, Rho, y la activación directa de Cdc42 3. Dentro de la célula huésped eucariota, el BCV transita a lo largo de la vía endocítica y pese a la interacción con los lisosomas, las bacterias logran evitar la degradación 4. Se requiere la acidificación del BCV por el vesicular ATPasa para inducir la expresión del sistema de secreción de tipo IV bacteriana (T4SS) 5. Se cree que los efectores bacterianas secretadas por el T4SS son esenciales para Brucella a establecer su nicho replicativo, ya que la deleción de la T4SS 6 o la inhibición de la ATPasa vesicular de plomo a defectos en el establecimiento del nicho intracelular 7. Las bacterias no se multiplican durante la fase de tráfico hasta que se llegar a un compartimiento vacuolar derivados del ER 8. Una vez que se produce la proliferación intracelular, el BCV se encuentra en close asociación con marcadores ER como calnexina y la glucosa-6-fosfatasa 6.
Los mecanismos moleculares por los que entra en las células Brucella, evita la degradación lisosomal y, finalmente, se replica en un compartimento de ER-como siguen siendo en gran medida desconocido. Los factores del huésped implicados en diferentes pasos de la infección principalmente han sido identificados por los enfoques dirigidos o una pequeña pantalla pequeña escala ARN de interferencia (siRNA) realizado en células de Drosophila 9. Estos han arrojado luz sobre la contribución de los factores del huésped durante la infección por Brucella pero aún estamos lejos de una comprensión global de todo el proceso.
A continuación, se presentan los protocolos que permiten la identificación de los factores del huésped humano usando interferencia de ARN de cribado a gran escala (RNAi) en combinación con microscopía de fluorescencia de campo amplio y análisis automatizado de imágenes automatizado. Reverse transfección siRNA de células HeLa se realizó como se described anterior 10,11 con modificaciones menores. El ensayo de punto final cubre una gran parte del ciclo de vida intracelular Brucella excepto la salida y la infección de las células vecinas. Para caracterizar adicionalmente los accesos identificados en el ensayo de punto final, se utiliza un protocolo modificado para identificar los factores que intervienen en los primeros pasos de la infección.
Una cepa de Brucella abortus que expresa constitutivamente GFP se utiliza para el ensayo de punto final donde se permite a las bacterias para infectar las células durante dos días. Durante este tiempo, las bacterias entran en las células, el tráfico con el nicho replicativo derivados del ER, y se replican en el espacio peri-nuclear. Los altos niveles de la señal de GFP entonces se pueden utilizar para detectar de forma fiable las células individuales que contienen las bacterias que se replican.
Para estudiar entrada Brucella en un ensayo de alto rendimiento, es importante ser capaz de distinguir entre las bacterias intracelulares y extracelulares. El método que aquí se presenta circumvpadres tinción de anticuerpos diferencial de bacterias intracelulares y extracelulares. Se basa en una cepa Brucella expresar una GFP inducible por tetraciclina en combinación con la expresión constitutiva de dsRed. La presencia de un marcador dsRed constitutiva permite la identificación de todas las bacterias que están presentes en la muestra. expresión de GFP es inducida por la adición de la anhidrotetraciclina análogo de tetraciclina no tóxico (ATC) simultáneamente con la inactivación de bacterias extracelulares por gentamicina (Gm). Mientras que el antibiótico Gm impermeable a las células mata las bacterias extracelulares, el ATC puede entrar en la célula huésped e inducir la expresión de GFP selectivamente en bacterias intracelulares. Esta doble reportero permite la separación sólido de bacterias intracelulares individuales (GFP) y de la señal dsRed de bacterias extracelulares (única señal DSred) mediante microscopía de campo amplio. Con el fin de llegar a la expresión de GFP detectable por intracelular Brucella hemos encontrado que 4 h de inducción por el ATC resulta en una RELIseñal de poder. Regímenes de inducción similares para expresar selectivamente GFP en las bacterias intracelulares se ha utilizado previamente para estudiar Shigella intracelular 12.
Bacterial pathogens have evolved numerous strategies to manipulate eukaryotic host cells to their benefit. Pathogens causing acute infections often show rapid proliferation which is accompanied by significant alarming of the immune system and loss of viability of infected cells. In contrast, Brucella and other pathogens that cause chronic infections manage to establish long-lasting interactions within host cells. Therefore, bacteria need to fine tune host cell functions to their benefit without disrupting cellul…
The authors have nothing to disclose.
This work was supported by grants 51RT 0_126008 and 51RTP0_151029 for the Research and Technology Development (RTD) project InfectX and TargetInfectX, respectively, in the frame of SystemsX.ch, the Swiss Initiative for Systems Biology. We acknowledge grant 310030B_149886 from the Swiss National Science Foundation (SNSF). Work of S.H.L and A.C. was supported by the International PhD Program “Fellowships for Excellence” of the Biozentrum. Simone Muntwiler is acknowledged for technical assistance. We would like to thank Dirk Bumann for providing pNF106 and Jean Celli for pJC43 and pJC44.
Tryptic Soy Agar (TSA) | BD | 236950 | |
Tryptic Soy Broth (TSB) | Fluka | 22092 | |
Kanamycin sulfate | Sigma-Aldrich | 60615 | |
Skim milk | |||
250 ml screw cap bottle | Corning | 8396 | |
DMEM | Sigma-Aldrich | D5796 | |
Fetal Calf Serum (FCS) | Gibco | 10270 | Heat-inactivated |
Trypsin-EDTA (0.5%) | Gibco | 15400-054 | 10x stock solution, dilute 1:10 in PBS |
Scepte 2.0 Cell Counter | Merck Milipore | PHCC20060 | Alternative cell counting devices can be used. |
Greiner CELLSTAR 384-well plate | Sigma-Aldrich | M2062 | |
Peelable aluminum foil | Costar | 6570 | |
Reagent dispenser: "Multidrop 384 Reagent Dispenser" | Thermo Scientific | 5840150 | Alternative reagent dispenser can be used. |
Transfection reagent: "Lipofectamine RNAiMAX | Invitrogen | 13778-150 | |
Automated plate washer: "Plate washer ELx50-16" | BioTek | ELX5016 | This plate washer contains a 16-channel manifold suitable for 384-well plates. It fits into a biosafety cabinet and has a lid covering the plate during washing which reduces the risk of aerosol production. Alternative plate washers with similar features could be used. |
Gentamicin | Sigma-Aldrich | G1397 | |
Anhydrotetracycline hydrochloride | Sigma-Aldrich | 37919 | 100 ug/ml solution in 100% ethanol is kept at -20°C protected from light in aluminum-foil |
PBS | Gibco | 20012 | |
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148 | Dissolve in 0.2 M HEPES buffer, pH 7.4. Store at -20°C and thaw freshly the day before use. Caution, PFA is toxic by inhalation, in contact with skin and if swallowed. |
HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T9284 | |
DAPI | Roche | 10236276001 | |
Scrambled siRNA | Dharmacon | D-001810-10 | |
Kif11 siRNA | Dharmacon | L-003317-00 | |
ARPC3 siRNA | Dharmacon | L-005284-00 | |
Brucella abortus 2308 | |||
pJC43 (apHT::GFP) | Celli et al.12 | ||
pAC042.08 (apht::dsRed, tetO::tetR-GFP) | Construction: pJC44 4 was digested with EcoRI followed by generation of blunt ends with Klenov enzyme and subsequent digestion with SalI. TetR-GFP was amplified from pNF106 using primer prAC090 and prAC092. Following digestion with SalI, the TetR-GFP product was ligated to the digested pJC44 vector. | ||
Primer prAC090 | Sigma-Aldrich | TTTTTGAATTCTGGCAATTCCGACGTCTAAGAAACC | |
Primer prAC092 | Sigma-Aldrich | TTTTTGTCGACTTTGTCCTACTCAGGAGAGCGTTC | |
HeLa CCL-2 | ATCC | CCL-2 | |
ImageXpress Micro | Molecular Devices | IXM IMAGING MSCOPE | Automated cellular imaging microscope equipped with a precision motorized Z-stage. Alternative systems for automated microscopy and alternative components for hard- and software specified below can be employed. |
High-Speed Laser Auto-Focus | Molecular Devices | 1-2300-1037 | |
CFI Super Fluor 10x objective | Nikon | MRF00100 | N.A 0.50, W.D 1.20mm, DIC Prism: 10x, Spring loaded |
Photometrics CoolSNAP HQ Monochrome CCD Camera | Molecular Devices | 1-2300-1060 | 1392 x 1040 imaging pixels, 6.45 x 6.45-µm pixels, 12 bits digitization |
MetaXpress software | Molecular Devices | 9500-0100 | |
LUI-Spectra-X-7 | Lumencor | SPECTRA X V-XXX-YZ | Light engine. The following light sources are used: violet (DAPI), cyan (GFP), green/yellow (RFP) |
Single Band Exciter for DAPI | Semrock | FF01-377/50-25 | |
Single Band Emitter for DAPI | Semrock | FF02-447/60-25 | |
Single Band Dichroic for DAPI | Semrock | FF409-Di03-25×36 | |
Single Band Exciter for GFP | Semrock | FF02-472/30-25 | |
Single Band Emitter for GFP | Semrock | FF01-520/35-25 | |
Single Band Dichroic for GFP | Semrock | FF495-Di03-25×36 | |
Single Band Exciter for RFP | Semrock | FF01-562/40-25 | |
Single Band Emitter for RFP | Semrock | FF01-624/40-25 | |
Single Band Dichroic for RFP | Semrock | FF593-Di03-25×36 |