Özet

Combinando Duplo Fluorescência<em> In Situ</em> A hibridação com imunomarcação para a detecção da expressão de três genes em secções do cérebro do rato

Published: March 26, 2016
doi:

Özet

Localizing gene expression to specific cell types can be challenging due to the lack of specific antibodies. Here we describe a protocol for simultaneous triple detection of gene expression by combining double fluorescence RNA in situ hybridization with immunostaining.

Abstract

Detecção de expressão de genes em diferentes tipos de células do cérebro, por exemplo, neurónios, astrócitos, oligodendrócitos, microglia e oligodendrócitos precursores, pode ser dificultada pela falta de anticorpos primários ou secundários específicos para a imunocoloração. Descrevemos aqui um protocolo para detectar a expressão de três genes diferentes na mesma secção utilizando cérebro de fluorescência dupla de hibridação in situ com duas sondas específicas para o gene seguido de imunocoloração com um anticorpo de alta especificidade dirigida contra a proteína codificada por um terceiro gene. O gene Aspartoacyclase (ASPA), de mutações que podem conduzir a uma doença da matéria branca humana rara – doença de Canavan – é pensado para ser expresso em oligodendrócitos e a microglia, mas não em neurónios e astrócitos. No entanto, o padrão de expressão precisa de ASPA no cérebro tem ainda de ser estabelecidos. Este protocolo nos permitiu determinar que ASPA é expressa em um subconjunto de oligodendrócitos maduros umND pode ser geralmente aplicado a uma ampla gama de estudos padrão de expressão do gene.

Introduction

As células da glia, que são as células mais abundantes no sistema nervoso central (SNC), compreendem oligodendrócitos (células mielinizantes do sistema nervoso central), oligodendrócitos precursores (PO, também conhecidos como "células") NG2, astrócitos e microglia. Há um interesse crescente nas funções de células gliais e de seus papéis potenciais em doenças neurológicas 1. Por exemplo, a doença de Canavan (CD) é uma doença neurodegenerativa hereditária começando no início da infância com leucodistrofia espongiforme e uma perda progressiva de neurónios, que conduz a morte geralmente antes dos 10 anos de idade 2,3. As mutações no gene Aspartoacyclase (ASPA) que levam à redução da actividade drasticamente ASPA 4 em CD foram identificados. ASPA é uma enzima que catalisa a desacetilação de N-acetilaspartato (NAA), uma molécula altamente concentrada no cérebro, acetato de gerar e aspartato 5-7. Muitos pacientes com DC apresentam níveis mais elevados de NAA devido à falta de ASPA actividade. Alguns estudos especular que o acetato de NAA-derivado pode ser uma importante fonte de ácidos gordos / lípidos no cérebro durante o desenvolvimento e CD podem resultar da diminuição da síntese de mielina durante o desenvolvimento causado pela falha de NAA para ser discriminado 3,5,6.

ASPA é predominantemente encontrado no rim, no fígado e da matéria branca do cérebro, e dado o papel importante da ASPA em CD, a expressão celular desta enzima no cérebro tem sido estudado por vários laboratórios. Ao olhar para a actividade enzimática ASPA no cérebro, estudos anteriores descobriu que o aumento da actividade durante o desenvolvimento cerebral ASPA paralelo ao curso de tempo de 8-10 mielinização. Ao nível celular, ensaios para a actividade enzimática, bem como hibridação in situ (ISH) e imuno-histoquímica (IHC) ASPA análises sugerem que é expresso principalmente em oligodendrócitos no cérebro, mas não em neurónios ou de astrócitos 11-16. Alguns estudos descobriram que ASPA pode tambémser expresso em microglia no sistema nervoso central 12,14. dados até agora sobre a expressão ASPA em PO são limitadas. De acordo com um estudo recente em que transcriptomes de diferentes tipos de células no córtex cerebral do rato, incluindo neurónios, astrócitos, PO, oligodendrócitos recém-formados, oligodendrócitos myelinating, microglia, células endoteliais e pericitos foram analisados ​​por ARN de sequenciação 17, ASPA é expresso exclusivamente em oligodendrócitos , em particular em myelinating oligodendrócitos (http://web.stanford.edu/group/barres_lab/brain_rnaseq.html). Apesar desses estudos sobre padrão de expressão ASPA no cérebro, uma série de incertezas permanecem.

técnicas diferentes podem ser usadas para estudar os padrões de expressão de genes. IHC é um método vulgarmente utilizado para detectar o produto funcional (ou seja, proteína) de um gene de expressão em secções de tecido. Apesar de sua grande utilidade, esta técnica tem limitações como a sua aplicação e especificidade estão sujeitas tO a disponibilidade e a especificidade do anticorpo necessário. Por comparação, a ISH tem a vantagem de ser capaz de revelar a expressão de qualquer gene ao nível do ARNm. No entanto, pode ser tecnicamente difícil de usar várias sondas ao mesmo tempo, a fim de localizar um gene de expressão para tipos de células específicos. Neste artigo, descreve-se um protocolo que combina ARN de dupla fluorescência de hibridação in situ com fluorescência de uma imunomarcação de proteínas. Temos utilizado este conjunto de técnicas para analisar o padrão de expressão da Aspa no cérebro do rato. Este método permite o estudo preciso da expressão génica utilizando microscopia confocal.

Protocol

Declaração de ética: Rato criação e manipulação estão em conformidade com os regulamentos UK Home Office e as orientações do comitê de ética UCL, cumprindo com os Animais (procedimentos científicos) Act de 1986 do Reino Unido e dos seus regulamentos de alteração 2012. Nota: Todas as soluções devem ser feitos com pirocarbonato de dietilo (DEPC) – água tratada para destruir qualquer RNase residual. Para o tratamento DEPC, adicione DEPC (1 ml por litro), agitar vigorosa…

Representative Results

Este artigo descreve um método para a ISH dupla fluorescência seguido por imunomarcação em seções do cérebro do rato. Uma breve descrição deste protocolo é demonstrado na Figura 1. O primeiro passo foi sintetizar sondas específicas para Aspa e MBP (proteína básica da mielina). Para verificar que as sondas foram sintetizadas, uma pequena aliquota de cada reacção foi efectuada num gel de agarose. O modelo linear fraco e uma grande quantidad…

Discussion

Este protocolo fornece um procedimento passo-a-passo para um ARN de dupla hibridização in situ seguindo-se a imunocoloração. Temos utilizado este protocolo para confirmar que Aspa é expresso em oligodendrócitos maduros em várias áreas do cérebro.

Este processo multi-passo tem muitas armadilhas potenciais que podem afectar a sensibilidade e deve ser evitado. Em primeiro lugar, todas as soluções e tampões de armazenamento para a reacção de transcrição precisa …

Açıklamalar

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Work in the authors’ laboratories was supported by the UK Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BB/J006602/1 and BB/L003236/1), the Wellcome Trust (WT100269MA) and the European Research Council (ERC, “Ideas” Programme 293544). SJ was supported by an EMBO long-term fellowship. The authors thank Stephen Grant for his technical assistance.

Materials

QIAprep® Miniprep Qiagen 27104
Deionized formamide Sigma F9037 for ISH blocking buffer
Sodium chloride Sigma S3014
Trizma Base Sigma T1503
Hydrochloric acid VWR International 20252.290
Sodium phosphate monobasic anhydrous Sigma S8282
Sodium phosphate dibasic dihydrate Sigma 30435
Yeast tRNA Roche 10109495001
50x Denhardt's solution Life Technologies 750018
Dextran sulfate Sigma D8906
Aspa cDNA clone Source Bioscience IRAVp968C0654D
SalI New England Biolabs R0138
Sodium acetate Sigma S2889
Equilibrated phenol Sigma P4557
Chloroform Sigma-Aldrich C2432
Isoamyl alcohol Aldrich 496200
Ethanol VWR International 20821.321
T7 RNA polymerase Promega P4074
Transcription buffer Promega P118B
100mM DTT Promega P117B
UTP-DIG NTP mix Roche 11277073910
Rnasin Promega N251B
Paraformaldehyde Sigma P6148
Filter paper Fisher scientific 005479470
Sucrose Sigma 59378
Diethyl pyrocarbonate Sigma D5758
Pentobarbitone Animalcare Ltd BN43054
Dissecting scissors World Precision Instruments 15922
25 gauge needle Terumo 300600
Peristaltic pump Cole-Parmer Instrument Co. Ltd WZ-07522-30
Iris scissors Weiss 103227
No.2 tweezers World Precision Instruments 500230
Coronal Brain Matrix World Precision Instruments RBMS-200C
Razor blade Personna Medical PERS60-0138
OCT medium Tissue tek 4583
Cryostat/microtome Bright
Superfrost plus slides Thermo Scientific J1800AMNZ
Sodium citrate Sigma S4641 for 65°C wash buffer
Formamide Sigma-Aldrich F7503
Tween-20 Sigma-Aldrich P1379
Coverslips VWR International 631-0146
Coplin Jar Smith Scientific Ltd 2959
Blocking reagent Roche 11096176001
Heat-inactivated sheep serum Sigma S2263
Hydrophobic pen Cosmo Bio DAI-PAP-S 1:500
α-FITC POD-conjugated antibody Roche 11426346910
TSA™ Plus Fluorescein System Perkin Elmer NEL741001KT 1:1500
α-DIG AP-conjugated Roche 11093274910
Fast red tablets Roche 11496549001
.22µM filter Millex SLGP033RS
α-Olig2 Rabbit antbody Millipore AB9610
Alexa Fluor® 647-conjugated α-rabbit antibody Life technologies A-31573 1:1000
bisBenzimide H 33258 sigma B2883
Mounting medium Dako S3023
Leica SP2 confocal microscope Leica

Referanslar

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Bu Makaleden Alıntı Yapın
Jolly, S., Fudge, A., Pringle, N., Richardson, W. D., Li, H. Combining Double Fluorescence In Situ Hybridization with Immunolabelling for Detection of the Expression of Three Genes in Mouse Brain Sections. J. Vis. Exp. (109), e53976, doi:10.3791/53976 (2016).

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