Exon pular é atualmente uma opção terapêutica mais promissora para a distrofia muscular de Duchenne (DMD). Para alargar a aplicabilidade para pacientes com DMD e para optimizar a estabilidade / função das proteínas distrofina truncados resultantes, um multi-exão abordagem pular utilizando oligonucleótidos anti-sentido de cocktail foi desenvolvido e demonstramos salvamento distrofina sistémico num modelo de cão.
Distrofia muscular de Duchenne (DMD) é uma das doenças genéticas letais mais comuns em todo o mundo, causadas por mutações no gene da distrofina (DMD). Exon pular emprega DNA curta moléculas / RNA-like chamados oligonucleotídeos antisense (AONs) que restaurar o quadro de leitura e produzem proteínas mais curtas, mas funcionais. No entanto, a terapia salto de exon enfrenta dois grandes obstáculos: aplicabilidade limitada (até apenas 13% dos pacientes podem ser tratados com uma única droga AON), e função incerta de proteínas truncadas. Estas questões foram abordadas com uma abordagem cocktail AON. Enquanto que cerca de 70% dos pacientes com DMD podem ser tratados por uma única exon (todos os exões combinados), pode-se potencialmente o tratamento de mais do que 90% dos pacientes com DMD se exão múltiplos saltando o uso de drogas anti-sentido cocktail pode ser realizado. A distrofia muscular de canino (CXMD) modelo de cão ligada ao X, cujo fenótipo é mais semelhante aos pacientes de DMD humanos, foi utilizado para testar a effic sistémicaACY e segurança dos skipping multi-exão de exons 6 e 8. modelo de cão O CXMD abriga uma mutação de recomposição no intrão 6, levando a uma falta do exão 7 em mRNA de distrofina. Para restaurar o quadro de leitura CXMD requer pular multi-exão de exons 6 e 8; portanto, CXMD é um bom modelo animal de médio porte para testar a eficácia e segurança de salto multi-exão. No estudo atual, um coquetel de morpholinos antisense alvo exão 6 e exon 8 foi projetado e restaurado a expressão de distrofina nos músculos esqueléticos wide-body. Os métodos para a transfecção / injecção de oligos cocktail e avaliação da eficácia e segurança de skipping de multi-exão no modelo de cão CXMD são apresentados.
Distrofia muscular de Duchenne (DMD) é uma doença muscular recessiva ligada ao X caracterizada por fraqueza muscular progressiva, descrita pela primeira vez pelo Dr. Guillaume-Benjamin-Amand Duchenne (de Boulogne) 1. DMD é uma doença genética comum que afeta cerca de 1 em cada 3.500 meninos em todo o mundo, com cerca de 20.000 crianças afetadas nascidas a cada ano 2,3. O desenvolvimento motor é atrasada e distúrbios da marcha são vistos na primeira infância 4, seguido por dependência de cadeira de rodas por volta dos primeiros anos da adolescência. A morte geralmente ocorre entre as idades de 20 e 30, devido a insuficiência respiratória ou cardíaca 5-8. Atualmente, não há cura para a DMD. O tratamento com glicocorticóides pode retardar a progressão da degeneração muscular em algum grau, mas está associada a efeitos colaterais significativos, incluindo a obesidade e diabetes mellitus 2,7,8. DMD resulta de mutações no gene da distrofina (DMD), levando a uma perda de protei distrofina funcionaln. DMD é um gene extremamente grande com mais de 2 milhões de pares de bases e 79 exões 9,10. Deleção, absurdo, e duplicação mutações que conduzem a mutações fora do quadro são a causa mais comum do fenótipo DMD. As regiões de exões 3 – 9 exões e 45 – 55 são denominados "pontos quentes" de mutação como a maioria dos pacientes têm mutações de deleção dentro destas porções do gene, conduzindo a distrofina não funcional em pacientes com DMD 3,9,11-16. distrofina funções dentro do complexo da glicoproteína distrofina (DGC), que tem um papel importante na estabilização da membrana muscular. A N- e C-terminais são os domínios mais importantes para a função, enquanto que o domínio da haste central desempenha um papel menos importante 3,9,17. A observância de um fenótipo leve associado com distrofia muscular de Becker (BMD), que em sua maioria resulta de mutações em-frame dentro do gene DMD, inspirou a aplicação do exão pular para o tratamento da DMD. pacientes BMD têm um reduzido, mas functional, a proteína distrofina que mantém ambos os terminais 3,6,18. Exon skipping, em teoria, pode restaurar a grelha de leitura, resultando em proteínas funcionais distrofina encurtados-but-semelhantes aos observados na DMO 3,19.
Vários tipos de oligonucleótidos anti-sentido (AONs) foram testadas em ensaios clínicos, incluindo fosforotioatos 2'-metilados (2'OMePS) e oligómeros fosforodiamidato morfolino (PMOs). Ignorando exons 51 e 53 usando estes AONs foi examinado e enquanto os resultados são promissores,-exão única skipping tem aplicabilidade limitada, uma vez que é de 3, 19, 20,21, 22-26 específicos de mutação. Perguntas também permanecem sobre a estabilidade das proteínas encurtadas distrofina resultantes produzidos a partir de um único salto de exon 22,23. Além disso, alguns pacientes necessitam de mais do que um único exão deve ser omitido, a fim de restaurar a grelha de leitura 3. Embora tecnicamente mais difícil, multi-exon skipping é um método quepoderia resolver esses problemas 3,19. Multi-exon skipping foi anteriormente demonstrada em cães distrófica e linhas de células humanas in vitro. Além disso, mdx52 modelos de ratinho e de cão canino ligados ao X distrofia muscular (CXMD) foram utilizados para estudos in vivo em 22, 24-27. Canine distrofia muscular ligada ao X Japan (CXMD J) beagles foram usados aqui, como o quadro de leitura CXMD J pode ser restaurado por skipping multi-exão de exons 6 e 8, ou exons adicionais (por exemplo, exons 3-9) (Figura 1). Baseado no Beagle CXMD compartilha o mesmo padrão de mutação como o modelo Golden Retriever distrofia muscular (GRMD), mas beagles são menores e mais barato de manter devido ao seu tamanho corporal, proporcionando assim um modelo útil para DMD 28,29. Cães CXMD imitar mais de perto o fenótipo DMD humana do que modelos animais menores, como roedores, e são mais confiáveis para as avaliações toxicológicas 3,22,30,31 </saté> (Figura 2). cães CXMD apresentar deterioração progressiva do músculo, distúrbios da marcha, e problemas respiratórios e cardíacos semelhantes aos observados em DMD. Comparado com saltar-exão única, multi-exon skipping é aplicável a uma proporção muito maior de pacientes. Entre os três tipos de mutação mais comum (deleções, absurdo, e duplicações), 80-98% dos pacientes poderiam ser tratados através de multi-salto de exon 14,32,33, enquanto que 45% de todos os pacientes com DMD pode se beneficiar de especificamente pular exons 45 – 55 3,19,22,34.
Com o desenvolvimento de morfolinos modificados, a eficiência de cocktails AON a facilitar exon melhorou. Arginina-ricos PMOs peptídeo conjugado de penetração celulares (PPMOs), e in vivo-morpholinos (vPMOs) são produtos químicos AON que melhoraram significativamente a capacidade e estabilidade 3,35-38 de penetração celular. Subsistem as preocupações de longo prazo toxicidade AON; no entanto, progressos significativostem sido feito. Modificações químicas feitas morpholinos diminuir consideravelmente efeitos fora do alvo e estudos pré-clínicos têm relatado nenhum efeito tóxico significativas 3,22,39,40. Um desafio restante para pular de multi-exão é o requisito de corrente para cada um dos AON para ser testado quanto à toxicidade sozinho, como uma única droga, em vez de juntos como um cocktail 3,19,22,41,42. Em estudos envolvendo DMD single e multi-salto de exon voltado para o coração, tem havido pouca melhoria no tecido cardíaco distrófica. A eficácia de morfolinos no coração é pensado para ser baixa devido à capacidade de penetração celular pobre. PPMOs péptido conjugado melhorou a capacidade de AONs para penetrar nas células cardíacas, aumento da quantidade de proteína distrofina funcional resgatado no coração 3,19,38.
Aqui, a nossa abordagem cocktail AON é discutido em detalhe, incluindo a concepção de sequências de AON usando software ESEfinder 43. PROTOCols para experiências do cão com skipping multi-exão também são descritas. Beagles CXMD J foram utilizados para exons 6 e 8 experiências pular. Multi-exão pular no modelo de cão CXMD mostra resultados promissores, mas os desafios permanecem que precisam ser superados antes que eles são clinicamente aplicável.
Exon skipping é uma técnica terapêutica promissora para o tratamento da DMD. Tanto in vitro e in vivo demonstraram que a multi-exon skipping é viável. Aqui, é discutida a utilização do modelo de cão CXMD. Em primeiro lugar, AONs foram projetados usando os-ESE de resgate programas e ESEfinder para direcionar exons distrofina 6 – 8. A química 2'OMePS AON foi usado para CXMD transfecção de mioblastos ea espinha dorsal química morfolino AON foi escolhido para os experimentos in vivo. vPMOs são mais eficientes do que os PMOs não modificados, mas devido à sua toxicidade mais elevada que eles não são adequados para injecções sistémicas. extracção de ARN, a RT-PCR, e sequenciação de ADNc foram realizadas sobre os mioblastos CXMD. Cães injetados com o coquetel de PMO foram clinicamente classificados para avaliar qualquer melhoria nos sintomas clínicos. Após os cães foram humanamente eutanasiados, amostras do músculo foram tomadas e preparados para crio-seccionamento. A meia-vida da proteína distrofina induzida por AONs acredita-se ser cerca de 1-2 meses. cães adultos jovens foram utilizados neste estudo, embora estas experiências podem ser feitas com cães neonatais e cães idosos (> 5 anos). Secções musculares preparados foram usados para avaliar a histopatologia e avaliar salvamento proteína distrofina através de transferência de Western e imuno-histoquímica 48.
É importante assegurar que o volume da solução de PMO está correcta antes de injecções; não fazê-lo terão efeitos significativos sobre os resultados. Durante injecções intramusculares, uma pressão suficiente é necessária para inserir as fibras musculares. Monitoramento da saúde e da inspeção do local da cirurgia cão são importantes para a solução de problemas. Para monitorar a saúde animal, exames de sangue semanais e pesagem deve ser realizada. Após a eutanásia do animal e a preparação de amostras de músculo, um passo crítico para garantir sensibilidade na detecção de proteína distrofina consiste em utilizar tanto o gel Tris-acetato e método de transferência semi-secodurante o procedimento de transferência Western.
Tal como mostrado nos resultados representativos, mioblastos tratados com Ex6A, Ex6B, Ex8A, e o cocktail (contendo Ex6A, Ex6B, Ex8A, e Ex8B) produzido em grelha produtos DMD. Desde Ex8B produzidos sem produtos Exon-ignorado, não foi utilizado na subsequente in vivo. sequenciamento de cDNA mostrou que exons 6-9 skipping ocorreu e imunocitoquímica com DYS-2 coloração mostrou restaurado expressão de distrofina em amostras tratadas. cães tratados com AON mostrou um aumento significativo em fibras distrofina-positiva. Isto indica que os exões 6-8 foram sendo ignorados e uma proteína encurtado foi produzido. A quantidade de fibras distrofina-positivas aumentou quando foi utilizado um cocktail de AONs e foi proporcional à dose AON. Imunotransfer�cias mostraram aumento da expressão de distrofina em cães tratados com morfolino sistémicos. músculo esquelético tinham níveis variáveis de fibras de distrofina; No entanto, o tecido do coração tratado com morfolino mostrou poucamelhoria na expressão de distrofina. Desde distrofina tem um elevado peso molecular (427 kDa), a detecção de pequenas quantidades de distrofina pode ser difícil. Para obter os melhores resultados, foram usadas em gel Tris-acetato e o método de transferência semi-seca. Coloração HE mostrou melhorou histopatologia nos cães tratados com morfolino. fibras centralmente nucleadas (CNFs) são um sinal de músculo saudável e representam ciclos de degeneração e regeneração muscular. CXMD cães tratados com morfolino mostrou uma diminuição na percentagem de CNFs em comparação com os cães CXMD não tratados. classificação clínica revelou uma melhoria nos sintomas, tais como o aumento da capacidade de andar e correr, nos animais tratados com morfolino. A dureza dos músculos se acredita reflectir a atrofia muscular, assim, foi incluído no sistema de classificação 59. A dureza dos músculos da coxa (hind-membro) foi avaliada; No entanto, foram excluídos músculo sartório cranianos porque eles tendem a apresentar hipertrofia em vez de atrofia em CXMD. cães tratados mostrared pontuação de classificação mais baixos e tinha vezes mais rápido no teste de corrida de 15 m. Melhoradas vezes no 15 m de teste são indicativos de melhora da função muscular 40. escores mais altos de classificação globais indicam problemas de saúde e aumento da atrofia muscular.
Embora estes resultados são promissores, multi-exon skipping ainda apresenta muitos desafios que precisam ser superados antes que a técnica tem aplicabilidade clínica. tecido cardíaco ainda exibe absorção reduzida de AONs, provavelmente devido à diferença no tráfico de celular entre o tecido cardíaco e esquelético. Nenhuns efeitos tóxicos foram observados em animais sob os regimes de dosagem actuais; no entanto, mais trabalho precisa ser feito para avaliar a toxicidade de longo prazo antes do uso de cocktails AON pode passar para ensaios clínicos. É difícil conseguir a aprovação de drogas cocktail AON porque as agências reguladoras definir cada sequência de AON como uma droga única. Isto significa que cada sequência em um cocktail teriam de ser testados individualmente para safety, exigindo mais tempo e mais dinheiro. Uma outra barreira para a utilização de skipping de multi-exão num ambiente clínico é uma grande quantidade de produtos de proteína intermediários produzidos com funções desconhecidas. Estas proteínas podem potencialmente levar a efeitos colaterais imprevisíveis, dependendo do indivíduo a mutação 22. Além disso, os padrões de mutação disponíveis dentro de modelos de cão distróficos atuais são limitadas. Existem poucas mutações que ocorrem naturalmente, e nem todas as mutações são úteis para o estudo de multi-exon skipping. O modelo distrófica porco promete ser uma boa alternativa para o futuro DMD salto de exon estudos 33, 34.
Os modelos de cão de DMD têm algumas vantagens sobre outros modelos de DMD. Sendo um maior modelo animal, classificação clínico e ressonância magnética são possíveis, permitindo uma análise mais detalhada. Desde que os cães são animais de grande porte são também mais adequados para estudos toxicológicos e representam mais de perto a doença humana em comparação com o modelo de ratinho. Dog modelos também têm sequências de genes de DMD que são mais semelhantes aos seres humanos 23, 34, 45.
Embora tecnicamente desafiador, a abordagem skipping multi-exão poderia vir a beneficiar> 90% dos pacientes com DMD 24. Isso o torna uma alternativa muito melhor para pular-exão única, as-exão único salto só é aplicável a um pequeno subgrupo de pacientes. Além disso, multi-exon skipping nos permitirá selecionar os padrões de exclusão que otimizam a funcionalidade das proteínas distrofina encurtada. Por exemplo, a exclusão de DMD exons 45 – 55 está associada a sintomas excepcionalmente leves ou assintomáticos 14,19,60-63. O salto multi-exão de exons 45 – 55 já foi demonstrado em um modelo de rato com DMD com uma deleção do exão 52 (mdx52), usando injeções sistêmicas de vPMOs 22,26. O uso de vPMOs cocktail também foi demonstrada em outras formas de distrofia muscular, taiscomo Fukuyama distrofia muscular congênita (FCMD). FCMD é causada por aprisionamento de exões, em que o splicing de mRNA aberrante é causada pela inserção de retrotransposões. vPMOs foram mostrados para resgatar o padrão de splicing em ambos FCMD um modelo de rato e em linhas de células humanas 64. Próxima geração de químicos AON expositoras maior eficácia e menor toxicidade iria facilitar a tradução efectiva da abordagem de salto multi-exão para a aplicação clínica. Além disso, saltando multi-exão poderia potencialmente ser aplicada a outras doenças genéticas, tais como a dysferlinopathies 24, 65.
The authors have nothing to disclose.
This work was supported by The University of Alberta Faculty of Medicine and Dentistry, The Friends of Garrett Cumming Research Chair Fund, HM Toupin Neurological Science Research Chair Fund, Muscular Dystrophy Canada, Canada Foundation for Innovation (CFI), Alberta Advanced Education and Technology (AET), Canadian Institutes of Health Research (CIHR), Jesse’s Journey – The Foundation for Gene and Cell Therapy, and the Women and Children’s Health Research Institute (WCHRI).
2'OMePS Transfection of Dog Myoblasts | |||
3ml 6 welled plates | IWAKI | 5816-006 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM) | Gibco | 11965-092 | |
fetal bovine serum (FBS) | HyClone | SH30071.01 | |
Penicillin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 U/mL |
Lipofectin | Invitrogen | 18292-011 | Total volume of 100 mL in opti-MEM media at a ratio of 2:1 for lipofectin. 10 mL lipofectin for 5 mg RNA. |
2’OMePS | Eurogentec | Ex6A (GUU GAUUGUCGGACCCAGCUCAGG), Ex6B (ACCUAUGA CUGUGGAUGAGAGCGUU), and Ex8A (CUUCCUGG AUGGCUUCAAUGCUCAC). | |
Horse Serum | Gibco | 16050-114 | 2% |
streptomycin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 ug/mL |
Bovine serum albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A9418 | |
Insulin | |||
Morpholino transfection of dog myoblasts | |||
All material from MePS Transfection of Dog Myoblasts for culturing | |||
Antisense morpholinos | Gene-tools |
Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC |
|
Endo-Porter | Gene-tools | ||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
RNA Extraction and Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) | |||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
Chloroform | Sigma-Aldrich | P3803 | 200 uL |
1.5 ml Tubes | Eppendorf | 22363204 | |
Centrifudge | Beckman-Coulter | ||
75% Ethanol | Sigma-Aldrich | 34852 | |
UV Spectrometer | |||
Forward primer in exon 5 | Invitrogen | CTGACTCTTGGTTTGATTTGGA 1.5 mL 10 mM |
|
Reverse primer in exon 10 | Invitrogen | TGCTTCGGTCTCTGTCAATG 1.5 L 10 mM |
|
dNTPS | Clontech | 3040 | |
One-Step RT-PCR kit | Qiagen | 210210 | |
Thermo-cycler | Scinco | ||
Complementary DNA (cDNA) Sequencing | |||
Gel extraction kit | Qiagen | 28704 | |
Centrifudge | |||
Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit | Applied Biosystems | 4337454 | |
Intramuscular injections or open muscle biopsy | |||
Surgical Tools | Scissors, Scapal, needle, surgical thread | ||
Vet Ointment | |||
Iodophors | webtextiles | 12190-71-5 | |
chlorohexidine | Peridex | 12134 | |
Surgical Drapes | |||
Srubs | |||
Facial Mask | |||
Surgical Gloves | |||
Head Covering | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Antisense morpholinos | Gene-tools | Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC TCAGG), Ex6B(ACCTATGACTGTGGATGAG AGCGTT), Ex8A(CTTCCTGGATGGCTTCAAT GCTCAC) Dilute to a final volume of 100 L in opti-MEM media. 120–200 mg/kg of morpholinos at 32 mg/mL in saline |
|
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
buprenorphine hydrochloride | |||
Tougne Depressor | |||
cephalexin | 15 to 30 mg/kg | ||
cefazolin | 15 to 30 mg/kg | ||
buprenorphine | 0.01 mg/kg | ||
buprenorphine hydrochloride | 0.02 mg/kg | ||
Systemic Injections | |||
Syringe infusion pump | Muromachi | ||
22G Indwelling needles | TERUMO | SG3-2225 | |
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
Saline | Ohtsuka-Pharmaceutical | 28372 | |
Clinical Grading of Dogs | |||
Video Camera | |||
Stop watch | |||
Magnetic resonance imaging (MRI) | |||
3 Tesla MRI l | |||
18 cm diameter/18 cm length human extremity coi | |||
Muscle sampling and preparation (necropsy) | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Tragacanth gum | 10-20 mL | ||
Liqoud Nitrogrn | |||
Cork Discs | Iwai-kagaku | 101412-806 | |
Dry Ice | |||
Tweezers | |||
Poly-l-lysine–coated slides | Fisher | 22-037-216 | |
Cryostat Microsystem | Leica | cm1900 | |
Immunohistochemistry | |||
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
DYS2 | Novocastra | NCL-DYS2 | 1:150 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG1 | Invitrogen | A-21125 | 1:2,500 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG2 | Invitrogen | A-11005 | 1:2,500 dilutions |
DAPI | Invitrogen | D1306 | Contans mounting agent |
Goat Serum | Invitrogen | 10000C | 15% |
PBS | |||
Moisture chamber | Scientific Devise Laboratory | 197-BL | |
Chamber slide | Lab-tek | 154453 | |
Cover Glasses | Fisher | 12-540A | |
Hydrophobic barrier pen | |||
Flpurescent microcope | 594 nm at 20X magnification. | ||
Western Blotting | |||
Distillied Water | |||
Hand Homogenizer | |||
2× Laemmli SDS-loading buffer | 0.1 M Tris–HCl (pH 6.6), 2% (w/v) SDS, 2% (0.28 M) beta-mercaptoethanol, 20% glycerol, 0.01% bromophenol blue | ||
SDS gels | Bio-Rad | 161-1210 | 5% resolving |
SDS gels | Invitrogen | Invitrogen, WG1601BOX | 3-8% |
PVDF membrane | GE | 10600021 | |
Methanol | |||
Transfer buffer (10×) | 250 mM of Tris-Base, 1,920 mM of Glycine | ||
Transfer buffer (1×) | 10% 10× buffer, 20% methanol | ||
0.05% PBS/Tween 20 (PBST) | 2,000 mL 3× 200 mL for washing |
||
PBST/5% milk powder | 100 mL | ||
Protein Assay Kit | BCA | T9650 | |
Tween 20 | Sigma | P5927 | |
Urea | Sigma | U5378 | |
Beta Mercaptoethanol | Millipore | ES-007-E | |
SDS | Sigma | L3771 | |
Tris-Acetate | Sigma | ||
Tris HCL | Sigma | T3253 | |
Glycerol | Sigma | G8773 | |
Loading/sample buffer for Western blotting | NuPage Invitrogen | NP007 | |
NaCl | Sigma | S3014 | |
PMSF | Sigma | P7626 | |
Protease cocktail inhibitor | Roche | 11836153001 | |
Cathode Buffer | .025 M Tris base + 40 mM 6-aminocaproic acid + 20% Methanol | ||
Anode Buffer | 0.03 M Tris Base + 20% Methanol | ||
Concentred Anode Buffer | 0.3 M Tris base + 20 % Methanol | ||
desmin antibody | Abcam | ab8592 | |
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
Image J Software |