To obtain high-resolution images of fluorescently labeled cells within large tissues, ideally, the biological samples should be imaged without sectioning. 3DISCO is a straightforward tissue clearing procedure based on sequential incubation with organic solvents. Upon clearing, the organs become transparent allowing an end-to-end laser scan of the specimen.
Tissue clearing and subsequent imaging of transparent organs is a powerful method to analyze fluorescently labeled cells and molecules in 3D, in intact organs. Unlike traditional histological methods, where the tissue of interest is sectioned for fluorescent imaging, 3D imaging of cleared tissue allows examination of labeled cells and molecules in the entire specimen. To this end, optically opaque tissues should be rendered transparent by matching the refractory indices throughout the tissue. Subsequently, the tissue can be imaged at once using laser-scanning microscopes to obtain a complete high-resolution 3D image of the specimen. A growing list of tissue clearing protocols including 3DISCO, CLARITY, Sca/e, ClearT2, and SeeDB provide new ways for researchers to image their tissue of interest as a whole. Among them, 3DISCO is a highly reproducible and straightforward method, which can clear different types of tissues and can be utilized with various microscopy techniques. This protocol describes this straightforward procedure and presents its various applications. It also discusses the limitations and possible difficulties and how to overcome them.
生体組織の組織学的検査は、彼らの自然な文脈で分子/細胞の性質を理解する上での基本的なアプローチです。理想的には、臓器全体の高分解能イメージングが最も有益で所望である。光は1散乱に起因する限定された浸透深さを有しているので、固定された器官は、高解像度の顕微鏡イメージングを実行するために切断されなければならない。したがって、組織学的研究のほとんどは、器官のごく一部を表す少数の組織切片上で行われる。いくつかの研究では、 例えば、脳または脊髄におけるニューロンの接続をトレースすることを目指したものが、標的臓器からのすべての組織切片を回収し、3次元再構成のために画像化した。しかし、個々のセクションの組織切片およびその後の画像は、さまざまな制限があります。これらは機械的な歪みに起因する時間がかかり、組織の不完全な3次元再構成につながる、という困難が含まれる得られる画像の位置合わせIES。
最近では、クリアとイメージングそのまま透明器官はこの欠点2,3への重要なソリューションとして開発されました。クリア時には、器官全体がレンダリングされ、透明な撮像光が移動することを可能にエンド·ツー·エンドのような多光子または光シート顕微鏡などの走査型レーザ顕微鏡を用いunsectioned器官の高解像度画像を生成する( 図1)(図2)。種々の研究グループは、異なる目的のために、目的の画像それらの組織にできるようにする新たな組織のクリアプロトコルを開発した。これらは、有機溶媒に2-5、8クリアプロトコルをベース水6,7および電気泳動を含む。これらの中でも、溶媒の3次元イメージングは、臓器をクリアまたは3DISCOは、中枢神経系(CNS)の器官、免疫器官および固形腫瘍を含む種々の生物学的サンプルに容易に適用するプロトコルである。 ADDIT中イオンは、このような光学シート蛍光顕微鏡(LSFM)、多光子共焦点レーザー走査顕微鏡などの異なる顕微鏡技術と組み合わせることができる。 3DISCOは、テトラヒドロフラン(THF)及びジベンジルエーテル(DBE)4として容易に入手可能で安価な試薬を用いてクリアすることに基づいています。プロトコル全体で3〜4時間程度の短い取ることができます。このように、3DISCOは9を完了するのに数週間から数ヶ月かかる場合があり、伝統的な組織学的方法に比べて、堅牢で高速な手法である。
組織決済方法はクリア器官において異なる組織層の屈折率を一致させることにより、撮像光の散乱を低減することを目指し。これにより、撮像光が深部組織に浸透し、標識された細胞/分子を刺激することができる。 17をクリアする組織のこの古い概念はDodtと同僚2による完全なマウスの脳での技術の最初の高度なアプリケーションの後に成長して注目を集めている。それ以来、3DISCO、のSca / E、ClearT2、明快さとSeeDB 3,4,7,18-20など、新しい決済方式の急速に成長しているリストがあります。基本的に、彼らはすべての蛍光標識を保存することによって深部組織イメージングのための透過的な臓器をレンダリングすることを目指しています。その中でも、3DISCOは最も簡単で再現性のある方法の一つとして際立っている。これは、比較的速い他の清算上記の方法(1-5日対成人の脳のための2〜3週間のそれぞれ)21と比較される。それは、すでに成功を収めている完全に脳、脊髄、リンパ節、脾臓、肺、固形腫瘍、膵臓、及び乳腺3,4,9などの異なる器官に適用される。また、独立した研究グループによっていくつかの出版物は、既に撮像結果22,23を取得するには、このメソッドを使用していました。それにもかかわらず、異なる組織のクリア手順は、さまざまな条件のために有利である可能性があります。のSca / EとSeeDBは胚組織6,7で最高適用可能である例えば、彼らは、撮影時の取り扱いが容易になる可能性があり、水ベースのクリア方法、である。対照的に、CLARITYは、複雑で高価な決済方法である。しかし、それは、特に、脳8などの大きな組織において、抗体標識の状況において有利で あり得る。
3DISCOから最高の撮像結果を得るために最も重要なステップは、組織のクリアの前に実施される組織のラベルです。これは、可能な最も強い蛍光シグナルで開始することが必須である。これができるBeは、合成染料、ウイルストランスフェクションまたは抗体標識によってトレースを、蛍光タンパク質の遺伝子組換え発現を含む様々な方法で達成した。これは、任意の決済手続きが組織の蛍光シグナルが減少していることに留意すべきである。蛍光シグナルは、先頭部分に充分な強度がないため、 -それはクリアされた組織のクリアイメージングの前に容易に検出可能ではない、つまり悪い結果をお届けします。
改善を待っている方法をクリアするいくつかの制限があります。重要な制限は、クリアな試薬がクリア臓器の構造を変化させるので、それらは生きている組織上で使用することができないことである。したがって、このような光活性化mEos2 24と同様の実験を固定し、クリアする前に行われるべきです。クリア時には、明るく光安定タンパク質からの蛍光シグナルの超解像が可能となる。また、クリアリングプロトコルが減少するので、蛍光タンパク質の強度、クリア臓器を長期間保存することができません。これは、いくつかの臓器をクリアするのが困難であることに留意することが重要である。解剖器官は血液細胞( 例えば 、脾臓、肝臓)を多量に保持する場合は特に、それらがクリアされ、画像が比較的困難である。このような成人の齧歯類の脳の大きさの組織のための完全な消去を達成することも比較的困難である。このような組織は、他の一方で、蛍光シグナルを減少させる可能性がある、より長いインキュベーション時間を必要とすることができる。また、高解像度で一度にすることができる画像大きい透明な器官顕微鏡検査法の開発は、対処すべき待機中の必要があることである。技術の他の重要な制限は、組織の標識である。遺伝やウイルス発現により強い蛍光シグナルが理想的ですが、必ずしもすべての細胞または分子は、遺伝子またはウイルス標識することができる。一方、厚い組織の抗体の標識は、直接的な手順またはさらにPOはありませんほとんどの場合、ssible。それは、(数週間に数日)の特別透過化プロトコルと長いインキュベーション時間が必要になる場合があります3。それは、組織による脱水、脱脂主にクリアした後に(脊髄組織を測定)、各次元で約20%に縮小していることを心に留めておくことも重要です。この収縮は、レシオメトリック発生し、定量化ステップで修正する必要があります。提示された結果で観察されたように、蛍光標識した構造がクリアされた組織中のタンパク質の完全性の指標である、そのまま残ります。 例えば 、Focusclear-するCLARITY-80%グリセロールで使用されるため、最終的にクリア組織の疎水性の性質のために、さらに抗体で染色することができない、または水を含有する溶液に包埋した。最後に、撮像データの圧倒的な大きさを分析することが課題である。全体マウス脳細胞の解像度で走査した場合、例えば、それが所望の列strをトレースし、定量化することは非常に困難であろうuctures( 例えば 、神経細胞やグリアネットワーク)および自動化された方法で、異なる試料の上に比較する。研究者は、新しい決済方法を見つけることを目的としながら、要約すると、(多様な組織をクリアすることの難しさ、広い面積を高解像度で画像化し、複雑なデータ分析)上記の様々な課題を並行して改善されるべきである。
結論として、3DISCO含む最近開発された組織のクリア技術は、エレガントに無傷の器官の高解像度の3D画像が現在可能であることを実証している。これらの方法を使用して、科学者たちは、無傷の器官において細胞および分子の解剖学的情報を得ることができます。透明な器官でこれらの先駆的な3Dイメージング研究は、複雑な解剖学的およびヒースおよび疾患における組織/器官の分子組織を解読する研究者が増えて鼓舞。
The authors have nothing to disclose.
私たちは、原稿の重要な読書のためでHojer、B.ビンギョル(ジェネンテック)スクリプトナレーションに参加するため、N.ビエン-LYレクチン色素の尾静脈注射で改善された血管系のイメージングの経験を共有するための、そしてM Solloway(ジェネンテックに感謝)膵臓イメージングで使用したマウスについて。 GFP-Mのラインは、J. Sanes(セントルイスのワシントン大学)とR·リットマン(NYU)によるCX3CR1-GFPマウスによって作成されました。仕事はジェネンテック社によってサポートされている
Thy-1 GFP (GFP-M) mouse | can be obtained from Jackson | ||
CX3CR1 GFP mouse | can be obtained from Littman lab at NYU | ||
TgN(hGFAP-ECFP) mouse | can be obtained from Jackson | ||
Paraformaldehyde | Sigma | P6148 | |
Na2HPO4 | Mallinckrodt | 7917-16 | |
NaH2PO4 | (Mallinckrodt, 7892-04) | ||
2-2-2 Tribromoethanol | Sigma | T48402 | |
2-Methyl-2-butanol | Sigma | 152463 | used to prepare Avertin solution |
Saline | Braun | ||
Tetrahydrofuran | Sigma | 186562-12X100ML | |
Dichloromethane | Sigma | 270997-12X100ML | |
Dibenzyl ether | Sigma | Sigma, 108014-1KG | |
Benzyl alcohol | Sigma | 305197-100ML | |
Benzyl benzoate | Sigma | B6630-250ML | |
Lectin FITC | Sigma | L0401-1MG | |
anti-CC10 | Santa Cruz | SC-9772 | 0.388888889 |
Heparin | APP pharmaceuticals | 504001 | used in perfusion |
Glass vials | VWR | 548-0554 | |
Forceps | FST | 11251-10 | |
Mini Rotator | VWR | 100498-878 | |
Aluminum Foil | Fisherbrand | 01-213-104 | |
100mL Media Storage Bottles | Kimax Media Bottles | EW-34523-00 | |
Minipuls evolution perfusion pump with MF4* medium flow pump head | Gilson, Inc | F110701 and F117606 | |
Microscopy slide | VWR | 48311-703 | |
FastWell | Grace Bio-Labs | FW20 | |
Cover slip | Corning | 2940-245 | |
Glass petri dish | Corning Pyrex | 3160-101 | |
Dental cement | Lang Dental | 1223PNK | |
Quantofix Peroxide Test Strips | Sigma | 37206 | |
Amira with RT resolve microscopy module |
Visage Imaging | image analysis software | |
Imaris | Bitplane imaging | image analysis software | |
ImageJ | NIH | freeware |