פרוטוקול כללית לחקר פלישה של תאים לארח על ידי פתוגן חיידקי, תוך התמקדות<em> Staphylococcus aureus</em> ותאי האנדותל האדם.
להלן נתאר כיצד אנחנו לומדים את הפלישה לתאי אנדותל אנושיים על ידי Staphylococcus aureus חיידקים פתוגנים. פרוטוקול כללי ניתן ליישם מחקר של הפלישה תא החיידק על ידי כמעט כל culturable. שלבי בו היבטים ספציפיים של הפלישה ניתן ללמוד, כגון תפקידה של התארגנות אקטין או caveolae, יהיו מודגשות. תאים מארח מגדלים צלוחיות וכאשר מוכן לשימוש הן seeded לתוך 24 גם צלחות המכילות coverslips Thermanox. שימוש coverslips מאפשר הסרת הבאים של התאים מבארות כדי להפחית מהפרעות חלבונים בסרום מופקדים על הצדדים של בארות (אשר S. aureus היה לצרף). חיידקים גדלים לצפיפות הנדרשת ושטף כדי להסיר כל החלבונים המופרשים (רעלים למשל). Coverslips בשכבות ומחוברות של בתאי האנדותל מועברים 24 גם צלחות חדשות המכילות בינוני תרבות טרי לפני תוספת של חיידקים. חיידקים ותאים מודגרת אז יחד סכום נדרש זמן של 5% CO 2 ב 37 ° C. עבור ס aureus זה הוא בדרך כלל בין 15-90 דקות. Coverslips Thermanox יוסרו גם כל לטבול לרחוץ PBS להסיר חיידקים פנויות. אם חיידקים הקשורים הכולל (חסיד והפנימו) יש לכמת, coverslips ממוקמות אז גם טרי המכיל טריטון 0.5% X-100 ב PBS. Pipetting עדין מוביל להשלים תמוגה תאים וחיידקים הם המנויים על ידי דילול ציפוי סדרתי על אגר. אם מספר חיידקים פלשו התאים נדרשת, coverslips מתווספים בארות המכיל 500 ברקמת μl תרבות בינוני בתוספת גנטמיצין ו הדגירה נמשך 1 שעה, אשר יהרגו את כל החיידקים חיצוני. Coverslips אז יכול להיות שטף, lysed תאים וחיידקים המנויים על ידי ציפוי על אגר כמתואר לעיל. אם הניסוי דורש ראיה ישירה, coverslips ניתן לתקן ומוכתמת עבור במיקרוסקופ אור פלואורסצנטי או confocal או מוכן במיקרוסקופ אלקטרונים.
Assay אנו מתארים מבוסס על assay ההגנה גנטמיצין, אשר נמצאת בשימוש נרחב כדי ללמוד את הפלישה של תאים לארח על ידי חיידקים. תצפיות של חוסר היכולת של אנטיביוטיקה גנטמיצין אחרים כדי להרוג חיידקים תאיים נוצלו במחקרים מוקדם הפלישה של תאים לארח על ידי חיידקים 4-8. השימוש של 24, 48 או אפילו 96-היטב צלחות מאפשרת את הדור של כמויות גדולות של נתונים כמותיים לשחזור בתקופה קצרה של זמן ובעלות נמוכה יחסית. Assay היא גם מושכת משום שהיא אינה מצריכה ציוד מומחה, זה יכול להיות מותאם לעבודה עם חיידקים ותאים שונים, וניתן להשתמש בו כדי ללמוד את התפקיד של תהליכים בתא שני חיידקים מארח בפלישה 9. ואכן, מאז הניסויים המוקדמים, assay ההגנה גנטמיצין הועסק נרחב כדי למדוד תא הפלישה לארח על ידי מגוון של חיידקים שונים או אפילו שילוב של חיידקים 10,11. בעוד עקרונות הליבה זהים, שינויים קלים רבים בשיטת דווחו. במאמר זה תיארנו גרסה שלנו המצוין בו שינויים עשוי להיות נחוץ עבור חיידקים אחרים או לתאי המארח. בעת תכנון ניסוי כדי למדוד את התא המארח הפלישה שימוש בגישה זו יש מספר נקודות חשובות שיש לשקול:
רגישות חיידקים גנטמיצין. זה אולי נראה מובן מאליו, אבל חשוב לוודא את החיידק הנלמד רגיש גנטמיצין בטמפרטורת הריכוז, על משך הזמן לשמש. במקרה של רגישות, יתכן שניתן יהיה להשתמש באנטיביוטיקה אחרת 5. גישה חלופית ניתן להשתמש אנזימים ממס (lysostaphin, mutanolysin, ליזוזים) 12.
דגירה ו inoculum. כאשר ביצוע assay בפעם הראשונה חשוב לקבוע את הזמנים הדגירה אופטימלית inoculum חיידקי לשמש. לכן, הניסויים הראשוניים צריכה לבחון הן את הידבקות הפלישה לאורך זמן (5 דקות של עד 6 שעות). חשוב גם להעריך כיצד הפלישה מושפע ריבוי של זיהום (משרד הפנים, מספר החיידקים לכל תא). באופן כללי עדיף להשתמש במספר הנמוך ביותר של חיידקים האפשרי זה יצמצם נזק תאים בתרבית. הבדלים חשובים בין זנים עשוי לפספס אם תקופות דגירה ממושכת או inocula גדולים משמשים 9,13.
נזק נייד. חשוב לשטוף את החיידקים לפני השימוש. עם זאת, הנזק התאי אינו מוגבל ייצור הרעלן. פלישה חיידקית, אינדוקציה של אפופטוזיס והפרעה תפקודים תאיים נורמליים יכולים לגרום נזק הסלולר. זה יכול להוביל חדירה של גנטמיצין לתוך התא, להרוג חיידקים הפנימו ולתת את הרושם כי הפלישה לא קרה 14.
תנאי דגירה. הטמפרטורה ועל ההרכב של המדיום התרבות יכולה להיות השפעה משמעותית על הפלישה. למשל, פלישה של תאים על ידי הלה pyogenes סטרפטוקוקוס תלוי בנוכחות של פיברונקטין מסיסים, שהוא בדרך כלל קיים בסרום 15. שיקול נוסף הוא התפתחות חיידקים במדיום תרבות במהלך הניסוי.
תרבות וכימות של חיידקים תוך תאיים. למרות TX-100 לא יכול להרוג חיידקים תאיים, היא עלולה לעכב את הצמיחה שלהם. ככזה, הוא חשוב לבדוק שכפול חיידקים על התקשורת מוצק בנוכחות של חומרי ניקוי. איפה השפיע, יתכן שניתן יהיה להשתמש בריכוז נמוך יותר של חומר ניקוי או להשתמש אלטרנטיבה כגון saponin. היתרון של assay הגנה גנטמיצין על מכתים את סגול קריסטל assay מיקרוסקופיה היא כי פחות עבודה אינטנסיבית, והוא מאפשר איתור בידול של תת אוכלוסיות של חיידקים הפנימו. לדוגמה, ס ' aureus יכול לייצר או סוג המושבה רגילה (NCT) או גרסה מושבה קטנה (SCV) 16, אשר לא יהיה להבחין באמצעות מיקרוסקופ בתאי חיידקים בודדים. היתרון של מכתים את סגול קריסטל assay assay במיקרוסקופ על ההגנה גנטמיצין היא clumping התא ניתן להסביר וכי חיידקים תאיים כי הזן 'קיימא אבל לא culturable "המדינה יזוהו 17.
בחינת התפקיד של תהליכי התא המארח בפלישה חיידקי. מחקרים רבים המועסקים מעכבי תפקוד התא המארח כגון cytochalasin D, אשר מפריעה התארגנות אקטין. מחקרים כאלה יכולים לכלול גם נוגדנים היעד על פני קרום התא קולטנים מציאה siRNA של גנים ספציפיים 18. חשוב וחיוני על מנת להבטיח כי טיפולים אלה אינם משפיעים על כדאיות או עיקול של תאים בתרבית או להיות השפעה רעילה על חיידקים.
העתיד כיוונים:
"> ontent בגלל זה assay מבוצע בדרך כלל רב גם צלחות תרבית תאים, זה אפשרי תיאורטית להתאים אותה פעולה תפוקה גבוהה הקרנה, אשר עשויה לכלול בחינה של ספריות של התא לתפקד מעכבי פוטנציאל, אנטי infectives או אנטיביוטיקה נועדה למקד חיידקים תוך תאיים. לחילופין, גישה כזו יכולה לשמש מסך ספריות מוטציה לזהות גנים המעורבים הידבקות, פלישה או הישרדות תאיים. במקרים מסוימים זה עשוי להיות רצוי לכלול כוחות גזירה (זרימה) במערכת מודל, למשל כאשר הדוגמנות האנדותל, כדי לחקות באופן הדוק יותר בסביבת vivo. מקדמות שוטפות בעיצוב וייצור של תאים זרימה microfluidic התרבות מערכות תא לספק את האפשרות של העסקת assay הגנה גנטמיצין in-host הפתוגן מודלים המשלבים כוחות גזירה.לסיכום, פרוטוקול המתואר כאן מבוסס על גישות דומות בשימוש במשך שנים רבות. זה נרחב החלים על סוגים רבים של תאים בתרבית מינים חיידקים יכולים לייצר כמויות גדולות של נתונים במהירות ובעלות נמוכה יחסית.
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו מומנה על ידי קרן Wellcome (WT 0,795,880).
Material Name | Tip | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
DMEM | Invitrogen | 31885-023 | ||
Brain heart infusion | BioChemika | 53286 | ||
Foetal bovine serum | Invitrogen | 10091-148 | ||
HUVECs | Lonza | CC-2519 | ||
Endothelial basal medium | Lonza | CC-3121 | ||
Bovine brain extract (including heparin) | Lonza | CC-4092 | ||
Human endothelial growth factor | Lonza | CC-4017C | ||
Hydrocortisone | Lonza | CC-4035C | ||
GA-1000 | Lonza | CC-4092C | ||
Gentamicin | Invitrogen | 15710 | ||
Lysostaphin | AMBI | LSPN-50 | ||
Thermanox coverslips | Thermo Fisher | TKT-210-330P | ||
Triton X-100 | Sigma | T8787 | ||
Cytopath | TCS Biosciences | HC8595 | ||
Crystal violet | Sigma | C3886 | ||
Trypsin-EDTA | Sigma | T4049 | ||
T75 flasks | Thermo Fisher | 430641 | ||
Cytochalasin D | Sigma | C2618 | ||
Methyl-B-cyclodextrin | Sigma | 332615 |