Dieser Artikel beschreibt das Verfahren für die Bildung und Visualisierung eines bakteriellen Biofilms in einem 8-well Kammer schieben gewachsen
Die chronische Charakter vieler Erkrankungen ist die Bildung von bakteriellen Biofilmen, die widerspenstigen zu herkömmlichen Antibiotika-Therapie zugeschrieben werden. Biofilme sind Gemeinde-assoziierten Bakterien an der Oberfläche und eingehüllt in eine Matrix. Die Rolle der extrazellulären Matrix ist vielfältig, einschließlich der Förderung der Nährstoff-Akquisition und bietet erheblichen Schutz gegen Umwelteinflüsse (z. B. Host-Immunantwort). In dem Bemühen um ein besseres Verständnis darüber, wie die Bakterien in einem Biofilm auf Belastungen der Umwelt haben wir ein Protokoll verwendet haben, worin wir bakterielle Biofilme, die in einem 8-well Kammer schieben gebildet haben visualisieren reagieren zu erwerben. Die Biofilme wurden mit dem Baclight Live / Dead Fleck gefärbt und mit einem konfokalen Mikroskop, um die relative Biofilm Größe und Struktur unter verschiedenen Inkubationsbedingungen zu charakterisieren. Z-Stapel-Aufnahmen wurden durch konfokale Mikroskopie gesammelt und analysiert COMSTAT. Dieses Protokoll kann verwendet werden, um den Mechanismus und die Kinetik durch die Biofilme zu bilden, zu identifizieren sowie Komponenten, die wichtig für Biofilm-Struktur und Stabilität sind.
Das Verständnis der Mechanismen, durch die Biofilme bilden, sowie die Charakterisierung ihrer Matrix-Komponenten, ist ein Gebiet von großem Interesse. Dieses Protokoll kann verwendet werden, um zu identifizieren Proteine oder andere Bestandteile, um die strukturelle Integrität des Biofilms sowie die Identifizierung und Target-Proteine, die sich auf eine therapeutische Anwendung kann zu verleihen beizutragen.
Die Inkubationszeiten und Verdünnungen in der oben beschriebenen Protokoll sind für eine optimale Bildung von Biofilmen durch nontypeable Haemophilus influenzae (NTHI) gegründet. Einige Vorarbeiten erforderlich sein, um diese Schritte für andere Bakterienarten zu optimieren (dh erste Verdünnung und Inkubationszeit benötigt bis Mitte der log-Phase Wachstum zu erzielen). Die 1:2500 Verdünnung für die erste Aussaat der Kammern wurde gegründet, um sicherzustellen, dass eine robuste Biofilm würde in der Kammer gleitet wie durch diesen Organismus induziert und innerhalb der Inkubationszeiten angegeben entwickeln, ohne den Biofilm überwuchern die Kammer und / oder anstrengende verfügbaren Nährstoffe . Dementsprechend kann die anfängliche Verdünnung und oder Inkubationszeiten müssen für andere Bakterienarten eingestellt werden.
The authors have nothing to disclose.
Die Arbeit wurde von NIDCD / NIH R01DC003915 zu LO Bakaletz finanziert.
Material Name | Tip | Company | Catalogue Number | Comment |
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Chocolate II agar | Fisher | B21267X | ||
8-well chamber slides | Fisher | 12-656-18 | ||
BacLight Live/Dead bacterial viability kit | Fisher | NC9439023 | ||
BHI | Fisher | 211059 | ||
Hemin | Sigma | H5533 | ||
β-NAD | Sigma | N7004 | ||
Permaslip mounting media | Fisher | NC9693613 |