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8.3:

RNA Stability

JoVE Core
Moleküler Biyoloji
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JoVE Core Moleküler Biyoloji
RNA Stability

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RNAは,DNAと比較して構造的および化学的に 安定性がはるかに低い可動性の比較的短命な分子です。RNAでは、5炭素糖リボースは 2番目の炭素にヒドロキシル基を持ち、デオキシリボースは1つの水素を持ちます。ヒドロキシル基の水素は、塩基性溶液で除去されやすくなっています。これが発生すると、残っている負に帯電した酸素が リン酸糖骨格を破壊します。さらに、RNAは通常一本鎖であるため、DNAの二重らせんよりも 構造的に不安定です。RNA分子はDNA分子よりもはるかに短いため、末端で分解されやすくなります。外的要因もRNAの安定性に影響します。例えば、RNaseと呼ばれる細胞質内の 特定のエキソヌクレアーゼは、翻訳されていないRNAを分解します。RNA結合タンパク質として知られる他のタンパク質は、特定のRNAヌクレオチド配列を認識して 結合することにより安定性に影響します。3プライム非翻訳領域、つまり3プライムUTRにある AUリッチ要素は,通常はAUUUAの繰り返しを含むmRNA転写産物のなかで,異なるクラスのRNA結合タンパク質を引き付けます。これらのタンパク質の中には、mRNAの安定性を高め、3プライムUTRに結合しているタンパク質の翻訳を増加させるものと 転写物を不安定化してより迅速に分解するものがあります。したがって、RNA分子が翻訳に 利用できる時間は可変で 複数の要因に依存します。

8.3:

RNA Stability

DNAは化石の中にも含まれていますが、RNAは実験室の環境下でも完全な状態を保つことができません。RNAとDNAの安定性と寿命の違いは、両者の構造上の違いによるものです。DNAは二本鎖であるため、本質的により安定です。一方、RNAの一本鎖構造は安定性に劣りますが、柔軟性に富み、弱い内部結合を形成できます。さらに、細胞内のほとんどのRNAは比較的短いですが、DNAは2億5000万ヌクレオチドにもなります。RNAは、リボース糖の2番目の炭素に水酸基があるため、糖-リン酸骨格が壊れる可能性が高くなります。

細胞は、RNAの不安定さを利用して、その寿命と利用可能性の両方を調整できます。安定性の高いmRNAは、安定性の低いmRNAの転写産物よりも長い期間、翻訳に利用できます。RNAの安定性の制御には、細胞内のRNA結合タンパク質(RBP)が重要な役割を果たしています。RBPは、mRNAの3’非翻訳領域(UTR)にある特定の配列(AUUUA)に結合できます。興味深いことに、AUUUAのリピートの数により、特定の方法でRBPを呼び出すようです。リピートの数が少ないと、安定化するRBPが結合し、リピートの数が多いと、不安定化するRBPが結合するのです。すべての細胞には、RNAを分解するRNaseと呼ばれる酵素があります。通常、5’capとpolyA tailテールは、細胞が転写産物を必要としなくなるまで、真核生物のmRNAを分解から保護します。

エピトランスクリプトミクスの新しい研究は、制御するmRNAの修飾を定義することを目的としています。最近、科学者たちは、mRNAの安定性におけるメチル化の重要な役割を発見しました。アデノシン残基のメチル化(m6A)は、mRNAの翻訳と分解を増加させるようです。m6Aは、ストレス応答、核輸出、mRNAの成熟にも関与しています。また、修飾されたウラシル残基である擬ウリジンの存在も、RNAの制御に重要な役割を果たしているようです。

Önerilen Okuma

Zhao, Boxuan Simen, Ian A. Roundtree, and Chuan He. “Post-Transcriptional Gene Regulation by MRNA Modifications.” Nature Reviews. Molecular Cell Biology 18, no. 1 (January 2017): 31–42. [Source]

Agris, Paul F. “The Importance of Being Modified: An Unrealized Code to RNA Structure and Function.” RNA 21, no. 4 (April 2015): 552–54. [Source]