Pendant la réplication, les brins complémentaires de l’ADN double brin sont synthétisés à des rythmes différents. La réplication commence d’abord sur le brin principal. La réplication commence plus tard, se produit plus lentement et se déroule de manière discontinue sur le brin en retard.
Il existe plusieurs différences majeures entre la synthèse du brin principal et la synthèse du brin retardé. 1) La synthèse du brin principal se produit dans le sens de l’ouverture de la fourche de réplication, tandis que la synthèse du brin retard se produit dans le sens opposé. 2) Pour la synthèse du brin principal, une seule amorce est nécessaire, tandis que plusieurs amorces d’ARN sont nécessaires pour la synthèse du brin en retard. 3) Après la synthèse initiale de l’amorce, le brin principal n’a besoin que d’ADN polymérase pour que la réplication se poursuive, alors que le brin retardé nécessite plusieurs enzymes, y compris l’ADN polymérase I, la RNase H et la ligase. 4) Le brin principal est synthétisé sous la forme d’un morceau continu, tandis que le brin retardé est synthétisé sous la forme d’une série de morceaux plus courts appelés fragments d’Okazaki. Ainsi, la synthèse des brins en retard est un processus en plusieurs étapes impliquant une coordination sophistiquée entre différentes molécules.
En raison des différentes tailles de génome des procaryotes et des eucaryotes, le processus de synthèse des brins en retard diffère entre eux. La différence la plus importante est la longueur des fragments d’Okazaki. La longueur moyenne des fragments d’Okazaki est d’environ 1000 à 2000 nucléotides chez les procaryotes, mais seulement de 100 à 200 nucléotides chez les eucaryotes.