Qui, descriviamo un protocollo per l’utilizzo di sistemi di array di microelettrodi ad alta densità di semiconduttori a ossido di metallo complementare (CMOS-HD-MEAs) per registrare l’attività simile a un sequestro da fette di cervello ex vivo .
I sistemi di array di microelettrodi ad alta densità (CMOS-HD-MEA) complementari a base di metallo-ossido-semiconduttore possono registrare l’attività neurofisiologica da colture cellulari e fette di cervello ex vivo con un dettaglio elettrofisiologico senza precedenti. I CMOS-HD-MEA sono stati inizialmente ottimizzati per registrare l’attività delle unità neuronali di alta qualità da colture cellulari, ma hanno anche dimostrato di produrre dati di qualità da sezioni acute di retina e cerebellari. I ricercatori hanno recentemente utilizzato CMOS-HD-MEA per registrare i potenziali di campo locale (LFP) da fette di cervello di roditori corticali acuti. Un LFP di interesse è l’attività simile alle convulsioni. Mentre molti utenti hanno prodotto scariche epilettiformi brevi e spontanee utilizzando CMOS-HD-MEA, pochi utenti producono in modo affidabile un’attività simile a una crisi epilettica. Molti fattori possono contribuire a questa difficoltà, tra cui il rumore elettrico, la natura incoerente della produzione di attività simile a una crisi epilettica quando si utilizzano camere di registrazione sommerse e la limitazione che i chip CMOS-MEA 2D registrano solo dalla superficie della fetta cerebrale. Le tecniche descritte in questo protocollo dovrebbero consentire agli utenti di indurre e registrare costantemente un’attività simile a una crisi epilettica di alta qualità da fette cerebrali acute con un sistema CMOS-HD-MEA. Inoltre, questo protocollo delinea il corretto trattamento dei chip CMOS-HD-MEA, la gestione delle soluzioni e delle fette di cervello durante la sperimentazione e la manutenzione delle apparecchiature.
I sistemi HD-MEA (High-Density Microelectrode Array) disponibili in commercio, che includono un chip MEA con migliaia di punti di registrazione 1,2 e una piattaforma MEA per amplificare e digitalizzare i dati, sono uno strumento emergente per la ricerca elettrofisiologica. Questi sistemi HD-MEA utilizzano la tecnologia CMOS (Complementary Metal-Oxide-Semiconductor) per registrare dati elettrofisiologici con elevata sensibilità da colture cellulari e preparazioni di fette di cervello ex vivo. Questi sistemi MEA offrono una risoluzione spaziale e temporale senza precedenti alla ricerca neurofisiologica grazie all’elevata densità di elettrodi e ai rapporti segnale/rumoredi qualità 3. Questa tecnologia è stata utilizzata principalmente per studiare i potenziali d’azione extracellulari, ma può anche catturare potenziali di campo locale (LFP) di alta qualità da varie preparazioni di fette di cervello neuronale 4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15 . Grazie alla già citata capacità di registrazione ad alta risoluzione dei sistemi CMOS-HD-MEA, gli utenti possono monitorare l’attività elettrofisiologica con grande precisione spaziale 16,17,18. Questa capacità è particolarmente rilevante per il monitoraggio dei modelli di propagazione delle LFP di rete 5,12,15,19,20,21. Pertanto, i sistemi CMOS-HD-MEA possono fornire una comprensione senza precedenti dei modelli di propagazione dell’attività fisiologica e patologica da varie colture cellulari e preparazioni di fette di cervello. Di particolare rilievo, queste capacità dei sistemi CMOS-HD-MEA possono consentire ai ricercatori di contrastare i modelli di crisi epilettiche di diverse regioni del cervello contemporaneamente e di valutare come vari composti antiepilettici influenzano questi modelli. In questo modo, fornisce un metodo innovativo per studiare l’ictogenesi e la propagazione ictale e per comprendere come la farmacologia interrompe l’attività patologica della rete 7,10,14. Pertanto, queste nuove capacità dei sistemi CMOS-HD-MEA possono contribuire in modo significativo alla ricerca sui disturbi neurologici, oltre ad aiutare nella ricerca sulla scoperta di farmaci 5,7,11,22. Il nostro obiettivo è fornire dettagli sull’utilizzo dei sistemi CMOS-HD-MEA per studiare l’attività convulsiva.
Quando si utilizzano i sistemi CMOS-HD-MEA per studiare gli LFP, come l’attività epilettiforme nelle fette cerebrali acute, gli utenti possono affrontare molte sfide, tra cui il rumore elettrico debilitante, il mantenimento della salute della fetta durante la sperimentazione e il rilevamento di un segnale di qualità da un chip CMOS-MEA bidimensionale (2D) che registra solo dalla superficie della fetta cerebrale. Questo protocollo descrive i passaggi di base per la corretta messa a terra della piattaforma MEA e di altre apparecchiature utilizzate nella sperimentazione, un passaggio cruciale che può richiedere una personalizzazione individuale per ogni configurazione di laboratorio. Inoltre, discutiamo i passaggi per aiutare a mantenere sana la fetta di cervello durante lunghe registrazioni nelle camere sommerse utilizzate con i sistemi CMOS-HD-MEA 23,24,25. Inoltre, a differenza dei metodi di registrazione elettrofisiologica più comuni, che registrano dalle profondità della fetta cerebrale, la maggior parte dei sistemi CMOS-HD-MEA utilizza chip 2D che non penetrano nella fetta. Pertanto, questi sistemi richiedono uno strato esterno neuronale sano per produrre la maggior parte dei segnali LFP registrati. Altre sfide includono la visualizzazione dell’enorme quantità di dati generati da migliaia di elettrodi. Per superare queste sfide, raccomandiamo un protocollo semplice ma efficace che aumenti la probabilità di ottenere un’attività epilettiforme di rete di alta qualità che si propaga attraverso la fetta di cervello. Includiamo anche una breve descrizione di un’interfaccia utente grafica (GUI) disponibile al pubblico che abbiamo sviluppato con le risorse associate per facilitare la visualizzazione dei dati10.
Pubblicazioni precedenti hanno fornito protocolli correlati per l’uso dei sistemi di registrazione MEA 26,27,28,29. Tuttavia, questo lavoro mira ad assistere gli sperimentatori che utilizzano sistemi CMOS-HD-MEA con chip 2D, in particolare quelli che cercano di studiare l’attività epilettiforme di alta qualità da fette di cervello. Inoltre, confrontiamo due delle più comuni manipolazioni della soluzione per l’induzione di attività convulsive, vale a dire i paradigmi 0 Mg2+ e 4-AP, per aiutare gli utenti a identificare i mezzi convulsivanti più appropriati per la loro specifica applicazione. Sebbene il protocollo sia focalizzato principalmente sulla generazione di attività simile alle convulsioni, può essere modificato per esplorare altri fenomeni elettrofisiologici utilizzando fette di cervello.
Questo protocollo include linee guida specifiche relative alla gestione acuta della fetta cerebrale che affrontano i problemi comuni affrontati dagli utenti di CMOS-HD-MEA, vale a dire lo sviluppo di rumore sotto la fetta cerebrale e il mantenimento di un ambiente sano per la fetta cerebrale. Lo sviluppo di rumore sotto la fetta si verifica quando la fetta non aderisce correttamente all’array; Se la fetta di cervello non aderisce adeguatamente, possono formarsi sacche d’aria sotto la fet…
The authors have nothing to disclose.
Gli autori ringraziano gli ex e gli attuali membri del Parrish lab per le loro modifiche a questo manoscritto. Ringraziamo anche Alessandro Maccione di 3Brain per il suo feedback su questo lavoro. Questo lavoro è stato finanziato da un AES/EF Junior Investigator Award e dal Brigham Young University Colleges of Life Sciences e of Physical and Mathematical Sciences.
2D Workbench | Cloudray | LM04CLLD26B | |
4-Aminopyridine | Sigma-Aldrich | 275875 | |
Accura Chip | 3Brain | Accura HD-MEA | CMOS-HD-MEA chip |
Agarose | Thermo Fisher Scientific | BP160-100 | |
Vibration isolation table | Kinetic Systems | 91010124 | |
Beaker for the slice holding chamber, 270 mL | VWR | 10754-772 | |
BioCam | 3Brain | BioCAM DupleX | CMOS-HD-MEA platform |
Brainwave Software | 3Brain | Version 4 | CMOS-HD-MEA software |
Calcium Chloride | Thermo Fisher Scientific | BP510-500 | |
Carbogen | Airgas | X02OX95C2003102 | |
Carbogen | Airgas | 12005 | |
Carbogen Stones | Supelco | 59277 | |
Compresstome | Precissionary | VF-300-0Z | |
Computer | Dell | Precission3650 | |
Crocodile Clip Grounding Cables | JWQIDI | B06WGZG17W | |
Detergent | Metrex | 10-4100-0000 | |
D-Glucose | Macron Fine Chemicals | 4912-12 | |
Dihydrogen Sodium Phosphate | Thermo Fisher Scientific | BP329-500 | |
DinoCam | Dino-Lite | AM73915MZTL | |
Ethanol | Thermo Fisher Scientific | A407P-4 | |
Forceps | Fine Science Tools | 11980-13 | |
Hot plate | Thermo Fisher Scientific | SP88857200 | |
Ice Machine | Hoshizaki | F801MWH | |
Inflow and outflow needles | Jensen Global | JG 18-3.0X | |
Inline Solution Heater | Warner Instruments | SH-27B | |
Isofluorine | Dechra | 08PB-STE22002-0122 | |
Kim Wipes | Thermo Fisher Scientific | 06-666 | |
Magnesium Chloride | Thermo Fisher Scientific | FLM33500 | |
Micropipets | Gilson | F144069 | |
Mili-Q Water Filter | Mili-Q | ZR0Q008WW | |
Paintbrush | Daler Rowney | AF85 Round: 0 | |
Paper Filter | Whatman | EW-06648-24 | |
Parafilm | American National Can | PM996 | |
Perfusion System | Multi Channel System | PPS2 | |
Pipetor | Thermo Fisher Scientific | FB14955202 | |
Platinum Harp | 3Brain | 3Brain | |
Potassium Chloride | Thermo Fisher Scientific | P330-3 | |
Razor blade | Personna | BP9020 | |
Scale | Metter Toledo | AB204 | |
Scissors | Solingen | 92008 | |
Slice Holding Chamber | Custom | Custom | Custom 3D Printer Design, available upon request |
Sodium Bicarbonate | Macron Fine Chemicals | 7412-06 | |
Sodium Chloride | Thermo Fisher Scientific | S271-3 | |
Temperature Control Box | Warner Instruments | TC344B | |
Transfer Pipettes | Genesee Scientific | 30-200 | |
Tubing | Tygon | B-44-3 TPE | |
Vibratome VZ-300 | Precissionary | VF-00-VM-NC | |
Weigh Boat | Electron Microscopy Sciences | 70040 |