Summary

Hochwertige anfallsähnliche Aktivität aus akuten Hirnschnitten unter Verwendung eines komplementären Metalloxid-Halbleiter-Mikroelektrodenarray-Systems mit hoher Dichte

Published: September 27, 2024
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Summary

Hier skizzieren wir ein Protokoll für die Verwendung komplementärer Metalloxid-Halbleiter-Mikroelektroden-Array-Systeme mit hoher Dichte (CMOS-HD-MEAs) zur Aufzeichnung anfallsähnlicher Aktivität aus ex vivo Hirnschnitten.

Abstract

Komplementäre Metall-Oxid-Halbleiter-High-Density-Mikroelektroden-Array-Systeme (CMOS-HD-MEA) können die neurophysiologische Aktivität von Zellkulturen und Ex-vivo-Hirnschnitten in bisher unerreichter elektrophysiologischer Detailgenauigkeit aufzeichnen. CMOS-HD-MEAs wurden zunächst optimiert, um die Aktivität hochwertiger neuronaler Einheiten aus Zellkulturen aufzuzeichnen, es wurde aber auch gezeigt, dass sie qualitativ hochwertige Daten aus akuten Netzhaut- und Kleinhirnschnitten liefern. Forscher haben kürzlich CMOS-HD-MEAs verwendet, um lokale Feldpotentiale (LFPs) von akuten, kortikalen Nagetier-Hirnschnitten aufzuzeichnen. Ein LFP von Interesse ist die anfallsähnliche Aktivität. Während viele Anwender kurze, spontane epileptiforme Entladungen mit CMOS-HD-MEAs erzeugt haben, erzeugen nur wenige Anwender zuverlässig eine qualitativ hochwertige anfallsähnliche Aktivität. Viele Faktoren können zu dieser Schwierigkeit beitragen, darunter elektrisches Rauschen, die inkonsistente Art der Erzeugung anfallsähnlicher Aktivität bei der Verwendung von untergetauchten Aufnahmekammern und die Einschränkung, dass 2D-CMOS-MEA-Chips nur von der Oberfläche der Gehirnscheibe aufzeichnen. Die in diesem Protokoll beschriebenen Techniken sollten es den Benutzern ermöglichen, mit einem CMOS-HD-MEA-System konsistent eine qualitativ hochwertige anfallsähnliche Aktivität aus akuten Hirnschnitten zu induzieren und aufzuzeichnen. Darüber hinaus beschreibt dieses Protokoll die richtige Behandlung von CMOS-HD-MEA-Chips, das Management von Lösungen und Gehirnschnitten während des Experimentierens sowie die Wartung der Geräte.

Introduction

Kommerziell erhältliche HD-MEA-Systeme (High-Density Microelectrode Array), die einen MEA-Chip mit Tausenden von Aufzeichnungspunkten 1,2 und eine MEA-Plattform zur Verstärkung und Digitalisierung der Daten umfassen, sind ein aufstrebendes Werkzeug für die elektrophysiologische Forschung. Diese HD-MEA-Systeme verwenden die komplementäre Metalloxid-Halbleiter-Technologie (CMOS), um elektrophysiologische Daten aus Zellkulturen und ex vivo Hirnschnittpräparaten mit hoher Empfindlichkeit aufzuzeichnen. Diese MEA-Systeme bieten eine beispiellose räumliche und zeitliche Auflösung für die neurophysiologische Forschung durch eine hohe Elektrodendichte und hochwertige Signal-Rausch-Verhältnisse3. Diese Technologie wurde hauptsächlich zur Untersuchung extrazellulärer Aktionspotentiale eingesetzt, kann aber auch hochwertige lokale Feldpotentiale (LFPs) aus verschiedenen neuronalen Hirnschnittpräparaten erfassen 4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15 . Durch die oben erwähnte hochauflösende Aufzeichnungsfähigkeit der CMOS-HD-MEA-Systeme können Anwender die elektrophysiologische Aktivität mit hoher räumlicher Genauigkeit verfolgen 16,17,18. Diese Fähigkeit ist besonders relevant für die Verfolgung von Ausbreitungsmustern der Netzwerk-LFPs 5,12,15,19,20,21. Daher können CMOS-HD-MEA-Systeme ein noch nie dagewesenes Verständnis der Ausbreitungsmuster physiologischer und pathologischer Aktivität aus verschiedenen Zellkultur- und Hirnschnittpräparaten liefern. Besonders hervorzuheben ist, dass diese Fähigkeiten von CMOS-HD-MEA-Systemen es Forschern ermöglichen können, Anfallsmuster verschiedener Gehirnregionen gleichzeitig zu vergleichen und zu testen, wie verschiedene antiepileptische Verbindungen diese Muster beeinflussen. Auf diese Weise bietet es eine innovative Methode zur Untersuchung der Iktogenese und der iktalen Ausbreitung und zum Verständnis, wie die Pharmakologie die Aktivität pathologischer Netzwerke stört 7,10,14. Daher können diese neuartigen Fähigkeiten von CMOS-HD-MEA-Systemen erheblich zur Erforschung neurologischer Erkrankungen beitragen und die Wirkstoffforschung unterstützen 5,7,11,22. Unser Ziel ist es, Details zur Verwendung von CMOS-HD-MEA-Systemen zur Untersuchung anfallsähnlicher Aktivität bereitzustellen.

Bei der Verwendung von CMOS-HD-MEA-Systemen zur Untersuchung von LFPs, wie z. B. der epileptiformen Aktivität in akuten Hirnschnitten, können Benutzer mit vielen Herausforderungen konfrontiert werden, darunter schwächendes elektrisches Rauschen, die Aufrechterhaltung der Gesundheit des Schnitts während des Experimentierens und die Erkennung eines Qualitätssignals von einem zweidimensionalen (2D) CMOS-MEA-Chip, der nur von der Oberfläche des Gehirnschnitts aufzeichnet. Dieses Protokoll beschreibt grundlegende Schritte für die ordnungsgemäße Erdung der MEA-Plattform und anderer Geräte, die für Experimente verwendet werden, ein entscheidender Schritt, der möglicherweise eine individuelle Anpassung für jede Laboreinrichtung erfordert. Darüber hinaus diskutieren wir Schritte, die dazu beitragen, den Gehirnschnitt während langer Aufzeichnungen in den getauchten Kammern, die mit CMOS-HD-MEA-Systemen verwendet werden, gesund zu halten 23,24,25. Darüber hinaus verwenden die meisten CMOS-HD-MEA-Systeme im Gegensatz zu den gängigeren elektrophysiologischen Aufzeichnungsmethoden, die aus den Tiefen des Hirnschnitts aufzeichnen, 2D-Chips, die nicht in den Schnitt eindringen. Daher benötigen diese Systeme eine gesunde neuronale äußere Schicht, um den Großteil der aufgezeichneten LFP-Signale zu erzeugen. Eine weitere Herausforderung ist die Visualisierung der riesigen Datenmengen, die von Tausenden von Elektroden erzeugt werden. Um diese Herausforderungen zu meistern, empfehlen wir ein einfaches, aber effektives Protokoll, das die Wahrscheinlichkeit erhöht, eine qualitativ hochwertige epileptiforme Netzwerkaktivität zu erreichen, die sich über den Gehirnschnitt ausbreitet. Wir enthalten auch eine kurze Beschreibung einer öffentlich zugänglichen grafischen Benutzeroberfläche (GUI), die wir mit den zugehörigen Ressourcen entwickelt haben, um die Datenvisualisierungzu unterstützen 10.

Frühere Veröffentlichungen haben verwandte Protokolle für die Verwendung von MEA-Aufzeichnungssystemen bereitgestellt 26,27,28,29. Diese Arbeit zielt jedoch darauf ab, Experimentatoren zu unterstützen, die CMOS-HD-MEA-Systeme mit 2D-Chips verwenden, insbesondere diejenigen, die qualitativ hochwertige epileptiforme Aktivität aus Hirnschnitten untersuchen möchten. Darüber hinaus vergleichen wir zwei der gebräuchlichsten Lösungsmanipulationen zur Induktion anfallsähnlicher Aktivität, nämlich das 0 Mg2+ und das 4-AP-Paradigma, um den Anwendern zu helfen, die am besten geeigneten Krampfmedien für ihre spezifische Anwendung zu identifizieren. Obwohl sich das Protokoll in erster Linie auf die Erzeugung von anfallsähnlicher Aktivität konzentriert, kann es modifiziert werden, um andere elektrophysiologische Phänomene mit Hilfe von Hirnschnitten zu untersuchen.

Protocol

Verfahren mit Mäusen wurden vom Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) an der Brigham-Young-Universität genehmigt. In den folgenden Experimenten wurden männliche und weibliche (n = 8) C57BL/6-Mäuse im Alter von mindestens P21 verwendet. Abbildung 1: Schematische Darstellung von CM…

Representative Results

Wie es bei der Visualisierung von Aktivitäten aus vielen Kanälen 1,4,5,10 üblich ist, finden wir es vorteilhaft, zunächst ein Rasterdiagramm der Daten zu erstellen, die wir mit dem CMOS-HD-MEA erfassen (Abbildung 4A,C,E). Dieses Diagramm kann eine Vogelperspektive der Aktivität in allen Aufzei…

Discussion

Dieses Protokoll enthält spezifische Richtlinien für das Management von akuten Hirnschnitten, die sich mit häufigen Problemen befassen, mit denen CMOS-HD-MEA-Benutzer konfrontiert sind, nämlich die Geräuschentwicklung unter dem Hirnschnitt und die Aufrechterhaltung einer gesunden Umgebung für den Hirnschnitt. Die Rauschentwicklung unter dem Slice tritt auf, wenn der Slice nicht ordnungsgemäß am Array befestigt ist. Wird die Hirnscheibe nicht ausreichend verklebt, können sich unt…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Die Autoren danken ehemaligen und aktuellen Mitgliedern des Parrish-Labors für ihre Bearbeitung dieses Manuskripts. Wir möchten uns auch bei Alessandro Maccione von 3Brain für sein Feedback zu dieser Arbeit bedanken. Diese Arbeit wurde durch einen AES/EF Junior Investigator Award und durch die Brigham Young University Colleges of Life Sciences und of Physical and Mathematical Sciences finanziert.

Materials

2D Workbench Cloudray LM04CLLD26B
4-Aminopyridine Sigma-Aldrich 275875
Accura Chip 3Brain Accura HD-MEA CMOS-HD-MEA chip
Agarose Thermo Fisher Scientific BP160-100
Vibration isolation table Kinetic Systems 91010124
Beaker for the slice holding chamber, 270 mL VWR 10754-772
BioCam 3Brain BioCAM DupleX CMOS-HD-MEA platform
Brainwave Software 3Brain Version 4 CMOS-HD-MEA software
Calcium Chloride Thermo Fisher Scientific BP510-500
Carbogen Airgas X02OX95C2003102
Carbogen Airgas 12005
Carbogen Stones Supelco 59277
Compresstome Precissionary VF-300-0Z
Computer Dell Precission3650
Crocodile Clip Grounding Cables JWQIDI B06WGZG17W
Detergent Metrex 10-4100-0000
D-Glucose Macron Fine Chemicals 4912-12
Dihydrogen Sodium Phosphate Thermo Fisher Scientific BP329-500
DinoCam Dino-Lite AM73915MZTL
Ethanol Thermo Fisher Scientific A407P-4
Forceps Fine Science Tools 11980-13
Hot plate Thermo Fisher Scientific SP88857200
Ice Machine Hoshizaki F801MWH
Inflow and outflow needles Jensen Global JG 18-3.0X
Inline Solution Heater Warner Instruments SH-27B
Isofluorine Dechra 08PB-STE22002-0122
Kim Wipes Thermo Fisher Scientific 06-666
Magnesium Chloride Thermo Fisher Scientific FLM33500
Micropipets Gilson F144069
Mili-Q Water Filter Mili-Q ZR0Q008WW
Paintbrush Daler Rowney AF85 Round: 0
Paper Filter Whatman EW-06648-24
Parafilm American National Can PM996
Perfusion System Multi Channel System PPS2
Pipetor Thermo Fisher Scientific FB14955202
Platinum Harp 3Brain 3Brain
Potassium Chloride Thermo Fisher Scientific P330-3
Razor blade Personna BP9020
Scale Metter Toledo AB204
Scissors Solingen 92008
Slice Holding Chamber Custom Custom Custom 3D Printer Design, available upon request
Sodium Bicarbonate Macron Fine Chemicals 7412-06
Sodium Chloride Thermo Fisher Scientific S271-3
Temperature Control Box Warner Instruments TC344B
Transfer Pipettes Genesee Scientific 30-200
Tubing Tygon B-44-3 TPE
Vibratome VZ-300 Precissionary VF-00-VM-NC
Weigh Boat Electron Microscopy Sciences 70040

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Blotter, M. L., Stubbs, I. W., Norby, J. H., Holmes, M., Kearsley, B., Given, A., Hine, K., Shepherd, M. R., Parrish, R. R. High-Quality Seizure-Like Activity from Acute Brain Slices Using a Complementary Metal-Oxide-Semiconductor High-Density Microelectrode Array System. J. Vis. Exp. (211), e67065, doi:10.3791/67065 (2024).

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