Summary

Activité épileptique de haute qualité à partir de coupes cérébrales aiguës à l’aide d’un système de réseau de microélectrodes haute densité à oxyde métallique, oxyde métallique et semi-conducteur complémentaire

Published: September 27, 2024
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Summary

Ici, nous décrivons un protocole pour l’utilisation de systèmes complémentaires de réseaux de microélectrodes à haute densité d’oxydes métalliques et de semi-conducteurs (CMOS-HD-MEA) pour enregistrer une activité semblable à celle d’une crise à partir de coupes de cerveau ex vivo .

Abstract

Les systèmes CMOS-HD-MEA (complémentaires à micro-réseau de microélectrodes haute densité à oxyde métallique et semi-conducteurs) peuvent enregistrer l’activité neurophysiologique à partir de cultures cellulaires et de coupes de cerveau ex vivo avec des détails électrophysiologiques sans précédent. Les CMOS-HD-MEA ont d’abord été optimisés pour enregistrer l’activité des unités neuronales de haute qualité à partir de cultures cellulaires, mais il a également été démontré qu’ils produisaient des données de qualité à partir de coupes rétiniennes et cérébelleuses aiguës. Les chercheurs ont récemment utilisé CMOS-HD-MEA pour enregistrer les potentiels de champ locaux (LFP) à partir de coupes de cerveau de rongeurs corticaux aigus. L’une des LFP d’intérêt est l’activité semblable à une crise. Bien que de nombreux utilisateurs aient produit des décharges épileptiformes brèves et spontanées à l’aide de CMOS-HD-MEA, peu d’utilisateurs produisent de manière fiable une activité épileptique de qualité. De nombreux facteurs peuvent contribuer à cette difficulté, notamment le bruit électrique, la nature incohérente de la production d’une activité semblable à une crise lors de l’utilisation de chambres d’enregistrement immergées et la limitation du fait que les puces CMOS-MEA 2D n’enregistrent qu’à partir de la surface de la tranche de cerveau. Les techniques détaillées dans ce protocole devraient permettre aux utilisateurs d’induire et d’enregistrer de manière cohérente une activité convulsive de haute qualité à partir de coupes cérébrales aiguës avec un système CMOS-HD-MEA. De plus, ce protocole décrit le bon traitement des puces CMOS-HD-MEA, la gestion des solutions et des tranches de cerveau lors de l’expérimentation, et la maintenance des équipements.

Introduction

Les systèmes de microélectrodes à haute densité (HD-MEA) disponibles dans le commerce, qui comprennent une puce MEA avec des milliers de points d’enregistrement 1,2 et une plate-forme MEA pour amplifier et numériser les données, constituent un outil émergent pour la recherche électrophysiologique. Ces systèmes HD-MEA utilisent la technologie CMOS (Complementary metal-oxide-semiconductor) pour enregistrer des données électrophysiologiques avec une sensibilité élevée à partir de cultures cellulaires et de préparations de coupes de cerveau ex vivo. Ces systèmes MEA offrent une résolution spatiale et temporelle sans précédent à la recherche neurophysiologique grâce à une densité d’électrodes élevée et à des rapports signal/bruit de qualité3. Cette technologie a principalement été utilisée pour étudier les potentiels d’action extracellulaires, mais elle peut également capturer des potentiels de champ local (LFP) de haute qualité à partir de diverses préparations de coupes de cerveau neuronal 4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15 . En raison de la capacité d’enregistrement haute résolution mentionnée ci-dessus des systèmes CMOS-HD-MEA, les utilisateurs peuvent suivre l’activité électrophysiologique avec une grande précision spatiale 16,17,18. Cette capacité est particulièrement pertinente pour le suivi des modèles de propagation des LFPde réseau 5,12,15,19,20,21. Par conséquent, les systèmes CMOS-HD-MEA peuvent fournir une compréhension sans précédent des modèles de propagation de l’activité physiologique et pathologique à partir de diverses cultures cellulaires et préparations de coupes de cerveau. Il convient de noter en particulier que ces capacités des systèmes CMOS-HD-MEA peuvent permettre aux chercheurs de comparer simultanément les modèles de crises de différentes régions du cerveau et d’évaluer comment divers composés antiépileptiques affectent ces modèles. Ce faisant, il fournit une méthode innovante pour étudier l’ictogenèse et la propagation de l’ictal et pour comprendre comment la pharmacologie perturbe l’activité pathologique du réseau 7,10,14. Par conséquent, ces nouvelles capacités des systèmes CMOS-HD-MEA peuvent contribuer de manière significative à la recherche sur les troubles neurologiques, ainsi qu’à la recherche sur la découverte de médicaments 5,7,11,22. Notre objectif est de fournir des détails sur l’utilisation des systèmes CMOS-HD-MEA pour étudier l’activité convulsive.

Lors de l’utilisation de systèmes CMOS-HD-MEA pour étudier les LFP, telles que l’activité épileptiforme dans les tranches cérébrales aiguës, les utilisateurs peuvent être confrontés à de nombreux défis, notamment un bruit électrique débilitant, le maintien de la tranche en bonne santé pendant l’expérimentation et la détection d’un signal de qualité à partir d’une puce CMOS-MEA bidimensionnelle (2D) qui enregistre uniquement à partir de la surface de la tranche de cerveau. Ce protocole décrit les étapes de base pour mettre correctement à la terre la plate-forme MEA et d’autres équipements utilisés dans l’expérimentation, une étape cruciale qui peut nécessiter une personnalisation individuelle pour chaque configuration de laboratoire. De plus, nous discutons des étapes à suivre pour aider à maintenir la tranche de cerveau en bonne santé lors de longs enregistrements dans les chambres immergées utilisées avec les systèmes CMOS-HD-MEA 23,24,25. De plus, contrairement aux méthodes d’enregistrement électrophysiologique plus courantes, qui enregistrent au plus profond de la tranche de cerveau, la plupart des systèmes CMOS-HD-MEA utilisent des puces 2D qui ne pénètrent pas dans la tranche. Par conséquent, ces systèmes nécessitent une couche externe neuronale saine pour produire la majorité des signaux LFP enregistrés. Parmi les autres défis, citons la visualisation de la quantité massive de données générées par des milliers d’électrodes. Pour surmonter ces défis, nous recommandons un protocole simple mais efficace qui augmente la probabilité d’obtenir une activité épileptiforme de réseau de haute qualité qui se propage dans la tranche de cerveau. Nous incluons également une brève description d’une interface utilisateur graphique (GUI) accessible au public que nous avons développée avec les ressources associées pour faciliter la visualisation des données10.

Des publications antérieures ont fourni des protocoles connexes pour l’utilisation des systèmes d’enregistrement MEA 26,27,28,29. Cependant, ce travail vise à aider les expérimentateurs utilisant des systèmes CMOS-HD-MEA avec des puces 2D, en particulier ceux qui cherchent à étudier une activité épileptiforme de haute qualité à partir de coupes de cerveau. De plus, nous comparons deux des manipulations de solutions les plus courantes pour l’induction d’une activité convulsive, à savoir les paradigmes 0 Mg2+ et 4-AP, pour aider les utilisateurs à identifier les milieux convulsivants les plus appropriés pour leur application spécifique. Bien que le protocole soit principalement axé sur la génération d’une activité semblable à celle d’une crise, il peut être modifié pour explorer d’autres phénomènes électrophysiologiques à l’aide de tranches de cerveau.

Protocol

Les procédures impliquant des souris ont été approuvées par le Comité institutionnel de soin et d’utilisation des animaux (IACUC) de l’Université Brigham Young. Des souris C57BL/6 mâles et femelles (n = 8) âgées d’au moins P21 ont été utilisées dans les expériences suivantes. Figure 1 <…

Representative Results

Comme c’est la norme lorsque l’on visualise l’activité de plusieurs canaux 1,4,5,10, nous trouvons utile de générer d’abord un tracé raster des données que nous acquérons avec le CMOS-HD-MEA (figure 4A,C,E). Ce graphique peut créer une vue d’ensemble de l’activité dans tous les …

Discussion

Ce protocole comprend des lignes directrices spécifiques liées à la gestion des tranches de cerveau aiguës qui abordent les problèmes courants rencontrés par les utilisateurs de CMOS-HD-MEA, à savoir le développement du bruit sous la tranche de cerveau et le maintien d’un environnement sain pour la tranche de cerveau. Le développement de bruit sous la tranche se produit lorsque la tranche n’adhère pas correctement au réseau ; Si la tranche de cerveau n’adhère pas adéqu…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Les auteurs remercient les anciens et actuels membres du laboratoire Parrish pour leurs modifications sur ce manuscrit. Nous tenons également à remercier Alessandro Maccione de 3Brain pour ses commentaires sur ce travail. Ce travail a été financé par une bourse de chercheur junior AES/EF et par les collèges des sciences de la vie et des sciences physiques et mathématiques de l’Université Brigham Young.

Materials

2D Workbench Cloudray LM04CLLD26B
4-Aminopyridine Sigma-Aldrich 275875
Accura Chip 3Brain Accura HD-MEA CMOS-HD-MEA chip
Agarose Thermo Fisher Scientific BP160-100
Vibration isolation table Kinetic Systems 91010124
Beaker for the slice holding chamber, 270 mL VWR 10754-772
BioCam 3Brain BioCAM DupleX CMOS-HD-MEA platform
Brainwave Software 3Brain Version 4 CMOS-HD-MEA software
Calcium Chloride Thermo Fisher Scientific BP510-500
Carbogen Airgas X02OX95C2003102
Carbogen Airgas 12005
Carbogen Stones Supelco 59277
Compresstome Precissionary VF-300-0Z
Computer Dell Precission3650
Crocodile Clip Grounding Cables JWQIDI B06WGZG17W
Detergent Metrex 10-4100-0000
D-Glucose Macron Fine Chemicals 4912-12
Dihydrogen Sodium Phosphate Thermo Fisher Scientific BP329-500
DinoCam Dino-Lite AM73915MZTL
Ethanol Thermo Fisher Scientific A407P-4
Forceps Fine Science Tools 11980-13
Hot plate Thermo Fisher Scientific SP88857200
Ice Machine Hoshizaki F801MWH
Inflow and outflow needles Jensen Global JG 18-3.0X
Inline Solution Heater Warner Instruments SH-27B
Isofluorine Dechra 08PB-STE22002-0122
Kim Wipes Thermo Fisher Scientific 06-666
Magnesium Chloride Thermo Fisher Scientific FLM33500
Micropipets Gilson F144069
Mili-Q Water Filter Mili-Q ZR0Q008WW
Paintbrush Daler Rowney AF85 Round: 0
Paper Filter Whatman EW-06648-24
Parafilm American National Can PM996
Perfusion System Multi Channel System PPS2
Pipetor Thermo Fisher Scientific FB14955202
Platinum Harp 3Brain 3Brain
Potassium Chloride Thermo Fisher Scientific P330-3
Razor blade Personna BP9020
Scale Metter Toledo AB204
Scissors Solingen 92008
Slice Holding Chamber Custom Custom Custom 3D Printer Design, available upon request
Sodium Bicarbonate Macron Fine Chemicals 7412-06
Sodium Chloride Thermo Fisher Scientific S271-3
Temperature Control Box Warner Instruments TC344B
Transfer Pipettes Genesee Scientific 30-200
Tubing Tygon B-44-3 TPE
Vibratome VZ-300 Precissionary VF-00-VM-NC
Weigh Boat Electron Microscopy Sciences 70040

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Blotter, M. L., Stubbs, I. W., Norby, J. H., Holmes, M., Kearsley, B., Given, A., Hine, K., Shepherd, M. R., Parrish, R. R. High-Quality Seizure-Like Activity from Acute Brain Slices Using a Complementary Metal-Oxide-Semiconductor High-Density Microelectrode Array System. J. Vis. Exp. (211), e67065, doi:10.3791/67065 (2024).

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