Summary

Identificação de células T raras específicas de antígenos de pulmões de camundongos com peptídeos: tetrâmeros do complexo principal de histocompatibilidade

Published: July 19, 2024
doi:

Summary

Fornecemos um protocolo detalhado para isolar e identificar populações raras de células T específicas de antígenos em pulmões de camundongos por meio de enriquecimento de células T baseadas em esferas magnéticas e tetrâmeros peptídicos: complexo principal de histocompatibilidade (MHC).

Abstract

A identificação e caracterização de células T específicas do antígeno durante a saúde e a doença continua sendo a chave para melhorar nossa compreensão da fisiopatologia imunológica. Os desafios técnicos de rastrear populações de células T específicas do antígeno dentro do repertório de células T endógenas foram muito avançados pelo desenvolvimento de reagentes de tetrâmero peptídeo: MHC. Esses multímeros solúveis marcados com fluorescência de moléculas MHC classe I ou classe II complexadas a epítopos de peptídeos antigênicos ligam-se diretamente às células T com especificidade correspondente do receptor de células T (TCR) e podem, portanto, identificar populações de células T específicas do antígeno em seu estado nativo sem a necessidade de uma resposta funcional induzida por ex vivo estimulação. Para populações extremamente raras, as células T ligadas ao tetrâmero podem ser enriquecidas magneticamente para aumentar a sensibilidade e a confiabilidade da detecção.

À medida que a investigação da imunidade das células T residentes no tecido se aprofunda, há uma necessidade premente de identificar células T específicas do antígeno que trafegam e residem em tecidos não linfoides. Neste protocolo, apresentamos um conjunto detalhado de instruções para o isolamento e caracterização de células T específicas do antígeno presentes nos pulmões de camundongos. Isso envolve o isolamento de células T do tecido pulmonar digerido, seguido por uma etapa geral de enriquecimento magnético de células T e coloração de tetrâmero para análise e classificação por citometria de fluxo. As etapas destacadas neste protocolo utilizam técnicas comuns e reagentes prontamente disponíveis, tornando-o acessível para quase qualquer pesquisador envolvido em imunologia de células T de camundongos, e são altamente adaptáveis para uma variedade de análises a jusante de qualquer população de células T específicas de antígeno de baixa frequência que residam nos pulmões.

Introduction

No coração do sistema imunológico adaptativo está a capacidade de uma célula T de reconhecer e responder a um antígeno específico. Quando e onde uma célula T responde ao seu antígeno cognato determina o equilíbrio entre infecção e autoimunidade, homeostase e câncer, saúde e doença1. Segue-se que o estudo de células T em um contexto específico de imunidade deve se concentrar nas células com especificidade para um antígeno relevante de interesse. Entre os avanços tecnológicos que aumentaram muito a capacidade de caracterizar populações de células T específicas do antígeno estão multímeros solúveis marcados com fluorescência (geralmente tetrâmeros) de moléculas de classe I ou classe II do complexo principal de histocompatibilidade (MHC) complexadas a epítopos de peptídeos antigênicos, mais conhecidos como “tetrâmeros peptídeo: MHC” 2 , 3 , 4 , 5. Ao representar os ligantes naturais dos receptores de antígenos de células T (TCRs), os tetrâmeros peptídeo:MHC classe I e classe II fornecem um meio de identificar diretamente as células T CD8+ e CD4+ específicas do antígeno, respectivamente, dentro do repertório endógeno de células T no sistema imunológico sem a necessidade de uma resposta à estimulação do antígeno em um ensaio. Os tetrâmeros representam uma abordagem mais elegante para o estudo de células T específicas do antígeno do que os modelos de transferência adotiva de células T transgênicas TCR6 e têm sido cada vez mais usados para identificar populações de células T estranhas e auto-específicas de antígenos em modelos experimentais de camundongos e doenças humanas 4,5.

Embora os tetrâmeros possam identificar prontamente populações de alta frequência de células T que se expandiram em resposta à estimulação de antígenos, seu uso para células T ingênuas, autoantígenas específicas ou de memória é limitado pelas frequências muito baixas dessas populações7. Nosso grupo e outros desenvolveram e popularizaram estratégias de enriquecimento magnético baseadas em tetrâmeros que aumentam a sensibilidade de detecção para permitir estudos dessas populações de células em tecidos linfóides de camundongos 8,9,10,11.

O surgimento de células T residentes no tecido no campo colocou uma ênfase maior no desenvolvimento de novas maneiras de investigar células T no espaço não linfóide. Como muitas outras superfícies mucosas, as células T nos pulmões encontram uma variedade de antígenos próprios e estranhos derivados do epitélio do hospedeiro, micróbios comensais e infecciosos e entidades ambientais, incluindo alérgenos. A análise transcricional de células T colhidas de tecido não linfóide (NLT) demonstra um fenótipo semelhante à memória que tem destino e função únicos específicos do tecido, muitas vezes direcionados ao tráfego e à homeostase do tecido12. Além disso, as células T de memória residentes no tecido (Trms) tendem a ser mais restritas clonalmente do que aquelas em circulação13. Determinar como e por que os antígenos impulsionam a residência das células T na NLT é fundamental para entender como o sistema imunológico protege contra infecções, mantém a homeostase do tecido e, às vezes, se transforma em autoimunidade. No entanto, parece haver maior atrito entre as células T residentes nos tecidos dos pulmões em comparação com outros NLT14. Consequentemente, a capacidade de identificar e caracterizar células T endógenas do pulmão com uma determinada especificidade de antígeno é limitada por sua raridade inerente.

Ao combinar o uso de técnicas de enriquecimento celular baseadas em esferas magnéticas e coloração de tetrâmero peptídeo: MHC, conseguimos detectar células T auto-específicas expandidas, mas raras, em pulmões de camundongos15,16. Aqui, apresentamos uma descrição detalhada de um protocolo que otimizamos para isolar e caracterizar de forma confiável qualquer população rara de células T específicas do antígeno presente nos pulmões de camundongos (Figura 1). Este protocolo incorpora uma etapa de coloração de anticorpos in vivo para distinguir células T residentes no tecido das células T vasculares17, seguida por dois métodos diferentes para processamento de tecido pulmonar para acomodar a disponibilidade de recursos. Isso é seguido por uma etapa geral de enriquecimento magnético de células T, coloração de tetrâmero e análise por citometria de fluxo. A viabilidade celular e a coloração do tetrâmero são aprimoradas ainda mais neste protocolo pela adição de aminoguanidina, que bloqueia a apoptose induzida por ativação de células T mediada por óxido nítrico sintase induzível (iNOS)18 e Dasatinibe, que limita a regulação negativa do TCR19. As etapas destacadas neste protocolo utilizam técnicas comuns e reagentes prontamente disponíveis, tornando-o acessível para quase todos os pesquisadores envolvidos em imunologia de células T de camundongos e é altamente adaptável para uma variedade de análises posteriores. Embora não seja provável que as células T virgens sejam encontradas nos pulmões, acreditamos que este protocolo será particularmente útil para o estudo de células T autoantígenas específicas e Trms nos pulmões.

Figure 1
Figura 1: Visão geral do fluxo de trabalho do protocolo. Os pulmões são colhidos de camundongos e dissociados em células únicas. As amostras são posteriormente enriquecidas para células T antes da coloração com tetrâmeros peptídicos:MHC e anticorpos marcados com fluorescência para análise de citometria de fluxo. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Protocol

Os procedimentos descritos neste protocolo são aprovados e desenvolvidos de acordo com as diretrizes estabelecidas pelo Comitê Institucional de Cuidados e Uso de Animais (IACUC) do Massachusetts General Hospital, um programa de manejo de animais credenciado pela Associação Americana para o Credenciamento de Cuidados com Animais de Laboratório (AAALAC). Os experimentos foram realizados em camundongos machos e fêmeas de 8 a 12 semanas de idade em um fundo genético C57BL / 6 criados e mantidos no biotério MGH sob co…

Representative Results

A Figura 2 mostra a estratégia de gating representativa usada na identificação de células T CD4+ específicas para antígenos raros nos pulmões com tetrâmeros peptídeo:MHC classe II. O mesmo processo pode ser aplicado para células T CD8+ específicas do antígeno com tetrâmeros peptídeo:MHC classe I (dados não mostrados). Devido ao alto número de células não linfóides nos pulmões, a detecção confiável de células T raras es…

Discussion

Caracterizações anteriores de células T específicas do antígeno dos pulmões se beneficiaram do número robusto de células T específicas do antígeno que se expandem após um evento de priming agudo, como imunização intranasal ou infecção 20,21,22. No entanto, populações de células T mais raras nos pulmões, como células T específicas do autoantígeno ou células T de memória residentes no tecido, são difíceis…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Agradecemos a L. Kuhn pela assistência técnica no processamento de tissue e na produção de tetrâmeros. Este trabalho foi financiado pelos Institutos Nacionais de Saúde (R01 AI107020 e P01 AI165072 para J.J.M., T32 AI007512 para D.S.S.), o Massachusetts Consortium on Pathogen Readiness (J.J.M) e o Comitê Executivo de Pesquisa do Hospital Geral de Massachusetts (J.J.M.).

Materials

100 mm cell strainer Fisher Scientific 22-363-549
10x PBS without Ca++ or Mg++ Corning 46-013-CM
1x PBS without Ca++ or Mg++ Corning 21-031-CV
AccuCheck Counting Beads Invitrogen PCB100
Aminoguanidine Hemisulfate Salt Sigma-Aldrich A7009
CD90.2 microbeads, mouse Miltenyi 130-121-278
Cell separation magnet (MidiMACS Separator) Miltenyi 130-042-302 Holds single LS column
Cell separation magnet (QuadroMACS Separator) Miltenyi 130-090-976 Holds 4 LS columns
Dasatinib Sigma-Aldrich CDS023389
DNase I Roche 10104159001
Eagle’s Ham’s Amino Acids medium Sigma-Aldrich C5572
gentleMACS Miltenyi 130-093-235 Automated tissue dissociator
gentleMACS C Tubes Miltenyi 130-093-237 Automated tissue dissociator tubes
Hank's Balanced Salt Solution with Ca++ or Mg++ Corning 21-020-CM
HEPES Gibco 15630080
Ketamine Vedco NDC 50989-996-06
Liberase TM Roche 5401119001
Pacific Blue anti-mouse CD45 antibody (Clone: 30-F11) Biolegend 103126
Paramagnetic cell separation columns (LS Columns) Miltenyi 130-042-401 Comes with plunger
Purified anti mouse CD16/32 antibody (Clone: 93) Biolegend 101302
RPMI 1640 medium without L-glutamine Corning 15-040-CM
Sodium Chloride 0.9% (Normal Saline) Cytiva Z1376
Xylazine Pivetal NDC 466066-750-02

References

  1. Sun, L., Su, Y., Jiao, A., Wang, X., Zhang, B. T cells in health and disease. Signal Transduct Target Ther. 8 (1), 235 (2023).
  2. Altman, J. D., et al. Phenotypic analysis of antigen-specific T lymphocytes. Science. 274 (5284), 94-96 (1996).
  3. Crawford, F., Kozono, H., White, J., Marrack, P., Kappler, J. Detection of antigen-specific T cells with multivalent soluble class II MHC covalent peptide complexes. Immunity. 8 (6), 675-682 (1998).
  4. Nepom, G. T., et al. HLA class II tetramers: tools for direct analysis of antigen-specific CD4 + T cells. Arthritis Rheum. 46 (1), 5-12 (2002).
  5. Davis, M. M., Altman, J. D., Newell, E. W. Interrogating the repertoire: broadening the scope of peptide-MHC multimer analysis. Nat Rev Immunol. 11 (8), 551-558 (2011).
  6. Moon, J. J., et al. Tracking epitope-specific T cells. Nat Protoc. 4 (4), 565-581 (2009).
  7. Jenkins, M. K., Moon, J. J. The role of naive T cell precursor frequency and recruitment in dictating immune response magnitude. J Immunol. 188 (9), 4135-4140 (2012).
  8. Moon, J. J., et al. Naive CD4(+) T cell frequency varies for different epitopes and predicts repertoire diversity and response magnitude. Immunity. 27 (2), 203-213 (2007).
  9. Obar, J. J., Khanna, K. M., Lefrancois, L. Endogenous naive CD8+ T cell precursor frequency regulates primary and memory responses to infection. Immunity. 28 (6), 859-869 (2008).
  10. Kotturi, M. F., et al. Naive precursor frequencies and MHC binding rather than the degree of epitope diversity shape CD8+ T cell immunodominance. J Immunol. 181 (3), 2124-2133 (2008).
  11. Legoux, F. P., Moon, J. J. Peptide:MHC tetramer-based enrichment of epitope-specific T cells. J Vis Exp. 68, 4420 (2012).
  12. Szabo, P. A., Miron, M., Farber, D. L. Location, location, location: Tissue resident memory T cells in mice and humans. Sci Immunol. 4 (34), eaas9673 (2019).
  13. Poon, M. M. L., et al. Tissue adaptation and clonal segregation of human memory T cells in barrier sites. Nat Immunol. 24 (2), 309-319 (2023).
  14. Wakim, M. Z. M., Zheng, L. M. Tissue resident memory T cells in the respiratory tract. Mucosal Immunol. 15 (3), 379-388 (2022).
  15. Legoux, F. P., et al. CD4+ T cell tolerance to tissue-restricted self antigens is mediated by antigen-specific regulatory T Cells rather than deletion. Immunity. 43 (5), 896-908 (2015).
  16. Shin, D. S., et al. Lung injury induces a polarized immune response by self-antigen-specific CD4(+) Foxp3(+) regulatory T cells. Cell Rep. 42 (8), 112839 (2023).
  17. Anderson, K. G., et al. Intravascular staining for discrimination of vascular and tissue leukocytes. Nat Protoc. 9 (1), 209-222 (2014).
  18. Vig, M., et al. Inducible nitric oxide synthase in T cells regulates T cell death and immune memory. J Clin Invest. 113 (12), 1734-1742 (2004).
  19. Lissina, A., et al. Protein kinase inhibitors substantially improve the physical detection of T-cells with peptide-MHC tetramers. J Immunol Methods. 340 (1), 11-24 (2009).
  20. Hogan, R. J., et al. Protection from respiratory virus infections can be mediated by antigen-specific CD4(+) T cells that persist in the lungs. J Exp Med. 193 (8), 981-986 (2001).
  21. Hogan, R. J., et al. Activated antigen-specific CD8+ T cells persist in the lungs following recovery from respiratory virus infections. J Immunol. 166 (3), 1813-1822 (2001).
  22. Zhao, J., et al. Airway memory CD4(+) T cells mediate protective immunity against emerging respiratory coronaviruses. Immunity. 44 (6), 1379-1391 (2016).
  23. Hondowicz, B. D., et al. Interleukin-2-dependent allergen-specific tissue-resident memory cells drive asthma. Immunity. 44 (1), 155-166 (2016).
  24. Jungblut, M., Oeltze, K., Zehnter, I., Hasselmann, D., Bosio, A. Standardized preparation of single-cell suspensions from mouse lung tissue using the gentleMACS Dissociator. J Vis Exp. 29, 1266 (2009).
  25. Faustino, L. D., et al. Interleukin-33 activates regulatory T cells to suppress innate gammadelta T cell responses in the lung. Nat Immunol. 21 (11), 1371-1383 (2020).
  26. Atif, S. M., Gibbings, S. L., Jakubzick, C. V. Isolation and identification of interstitial macrophages from the lungs using different digestion enzymes and staining strategies. Methods Mol Biol. 1784, 69-76 (2018).
  27. Pape, K. A., Taylor, J. J., Maul, R. W., Gearhart, P. J., Jenkins, M. K. Different B cell populations mediate early and late memory during an endogenous immune response. Science. 331 (6021), 1203-1207 (2011).
  28. Naeher, D., et al. A constant affinity threshold for T cell tolerance. J Exp Med. 204 (11), 2553-2559 (2007).
  29. Moon, J. J., et al. Quantitative impact of thymic selection on Foxp3+ and Foxp3- subsets of self-peptide/MHC class II-specific CD4+ T cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (35), 14602-14607 (2011).
  30. Koehli, S., Naeher, D., Galati-Fournier, V., Zehn, D., Palmer, E. Optimal T-cell receptor affinity for inducing autoimmunity. Proc Natl Acad Sci U S A. 111 (48), 17248-17253 (2014).
  31. Zhang, Z., Legoux, F. P., Vaughan, S. W., Moon, J. J. Opposing peripheral fates of tissue-restricted self antigen-specific conventional and regulatory CD4(+) T cells. Eur J Immunol. 50 (1), 63-72 (2020).

Play Video

Cite This Article
Shin, D. S., Barreto de Albuquerque, J., Moon, J. J. Identification of Rare Antigen-Specific T Cells from Mouse Lungs with Peptide:Major Histocompatibility Complex Tetramers. J. Vis. Exp. (209), e66939, doi:10.3791/66939 (2024).

View Video