הפרוטוקול הנוכחי מתאר הליכים המשמשים לחקר ואפיון אנזימים הקשורים לדופן התא, בעיקר β-1,3-גלוקנה ופרוקסידז, בצמחי חיטה. רמות הפעילות שלהם עולות במהלך אינטראקציה חיטה-RWA והם מעורבים בתגובת ההגנה של הצמח באמצעות חיזוק דופן התא, אשר מרתיע הזנת כנימות.
צמחי חיטה שורצי כנימות חיטה רוסיות (RWA) גורמים לשרשרת של תגובות הגנה, כולל תגובות רגישות יתר (HR) ואינדוקציה של חלבונים הקשורים לפתוגנזה (PR), כגון β-1,3-גלוקנאז ופרוקסידז (POD). מחקר זה נועד לאפיין את התכונות הפיזיקוכימיות של POD ו- β-1,3-גלוקנאז הקשורים לדופן התא ולקבוע את הסינרגיזם שלהם על שינוי דופן התא במהלך אינטראקציה RWASA2-חיטה. זני Tugela-Dn1 הרגישים והעמידים Tugela-Dn5 העמידים הונבטו ונשתלו בתנאי חממה, הופרו 14 יום לאחר השתילה והושקו כל 3 ימים. הצמחים היו שורצים 20 פרטים פרתנוגנטיים של אותו שיבוט RWASA2 בשלב 3 העלים, והעלים נקטפו 1 עד 14 ימים לאחר ההתפשטות. נוזל השטיפה הבין-תאי (IWF) הופק באמצעות סינון ואקום ואוחסן בטמפרטורה של -20°C. שאריות העלים נמעכו לאבקה ושימשו לרכיבי דופן התא. פעילות ה-POD ואפיונו נקבעו באמצעות מצע גואיאקול 5 mM ו-H2O2, תוך ניטור השינוי בספיגה ב-470 ננומטר. פעילות β-1,3-גלוקנאז, pH ותנאים אופטימליים של טמפרטורה הודגמו על ידי מדידת סך כל הסוכרים המפזרים בהידרוליזה עם מגיב DNS באמצעות מצעים β-1,3-גלוקן ו-β-1,3-1,4-גלוקן, מדידת הספיגה ב-540 ננומטר ושימוש בעקומת תקן גלוקוז. ה- pH האופטימלי נקבע בין pH 4 ל -9, טמפרטורה אופטימלית בין 25 ל -50 ° C, ויציבות תרמית בין 30 ° C ל 70 ° C. ספציפיות מצע β-1,3-גלוקנה נקבעה ב 25 ° C ו 40 ° C באמצעות מצעי curdlan ושעורה β-1,3-1,4-גלוקן. בנוסף, אופן הפעולה β-1,3-גלוקנאז נקבע באמצעות למינריביוז ללמינריפנטאוז. תבניות המוצר של הידרוליזה אוליגוסכרידית נותחו באופן איכותי עם כרומטוגרפיה של שכבה דקה (TLC) ונותחו כמותית עם HPLC. השיטה המוצגת במחקר זה מדגימה גישה איתנה להשרצת חיטה עם RWA, מיצוי פרוקסידז ו- β-1,3-גלוקנאז מאזור דופן התא ואפיונם הביוכימי המקיף.
כנימות חיטה רוסיות (RWA) שורצות חיטה ושעורה, וגורמות לאובדן יבול משמעותי או לירידה באיכות התבואה. חיטה מגיבה להתפשטות על ידי גרימת מספר תגובות הגנה, כולל העלאת רמות הפעילות של β-1,3-גלוקן ופרוקסידז בזנים העמידים, בעוד שזנים רגישים מפחיתים את הפעילות של אנזימים אלה בתקופת התפשטות מוקדמת 1,2,3,4. תפקידי המפתח של β-1,3-גלוקנאז ו-POD בצמח החיטה כללו ויסות הצטברות קלוזה בזני הזנים העמידים והחמצן הריאקטיבי (ROS) המרווה בדופן התא ובאזורים אפופלסטיים במהלך התפשטות RWA 1,3,5,6,7. Mafa et al.6 הראו כי היה מתאם חזק בין פעילות POD מוגברת לבין תכולת ליגנין מוגברת בזן החיטה העמיד על נגיעות RWASA2. בנוסף, תכולת ליגנין מוגברת הצביעה על כך שדופן התא של זן החיטה העמיד שורץ חוזקה, מה שהוביל להזנת RWA מופחתת.
רוב קבוצות החוקרים חילצו וחקרו אפופלסטיק β-1,3-גלוקנאז ו-POD במהלך האינטראקציה חיטה/שעורה-RWA; בנוסף, רוב המחקרים הללו טענו כי אנזימים אלה משפיעים על דופן התא של צמח החיטה שורץ RWA מבלי למדוד את נוכחות האנזים באזור דופן התא. רק מחקרים מעטים השתמשו בטכניקות מיקרוסקופיות כדי להראות כי רמות הפעילות של β-1,3-גלוקנאז היו קשורות לוויסות קלוזה 7,8,9 או חילצו רכיבים עיקריים של דופן התא כדי להדגים את המתאם בין פעילויות POD ושינוי דופן התא ב- 6,10 העמיד. היעדר חיטוט הקשר β-1,3-גלוקנאז ו-POD לדופן התא מצביע על הצורך בפיתוח שיטות שיאפשרו לחוקרים למדוד ישירות את האנזימים הקשורים לדופן התא.
השיטה הנוכחית מציעה כי יש צורך בהסרת הנוזל האפופלסטי מרקמת העלה לפני מיצוי האנזימים הקשורים לדופן התא. הליך המיצוי של נוזל אפופלסטי חייב להתבצע פעמיים מרקמת העלה, המשמשת לחילוץ האנזימים הקשורים לדופן התא. תהליך זה מפחית את הזיהום והבלבול של האנזימים האפופלסטיים עם אלה הנמצאים באזורי דופן התא. לכן, במחקר זה, חילצנו POD הקשור לדופן התא, β-1,3-גלוקנאז ו-β-גלוקנאז ספציפיים ל-MLG וביצענו את האפיון הביוכימי שלהם.
חיטה ושעורה הם גידולי דגנים שורצים לעתים קרובות על ידי מיני כנימות, כולל כנימות חיטה רוסיות (Diuraphis noxia)7,24. צמחי חיטה עמידים גורמים להגברת הרגולציה של פעילויות POD ו- β-1,3-גלוקנאז כתגובות הגנה לאורך כל תקופת ההתפשטות לשינוי דופן התא על ידי ויסות הצטברות קלו?…
The authors have nothing to disclose.
M. Mafa קיבל מימון מה-NRF-Thuthuka (מספר סימוכין: TTK2204102938). S.N. Zondo קיבל את מלגת הקרן הלאומית למחקר לתואר שני לתואר שני שלו. המחברים אסירי תודה למועצה למחקר חקלאי – מכון דגנים קטנים (ARC-SG) על אספקת הזרעים ששימשו במחקר זה. כל דעה, ממצאים והמלצות המובעות בחומר זה הן של המחבר/ים, ולפיכך המממנים אינם מקבלים על עצמם כל אחריות בקשר לכך.
10 kDa Centrifuge concentrating membrane device | Sigma-Aldrich | R1NB84206 | For research use only. Not for use in Diagnostic procedures. For concentration and purification of biological solutions. |
2 g Laminaribiose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM2 | High purity laminaribiose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
3 g Laminaritriose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM3 | High purity laminaritriose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
3,5 Dinitro salicylic acid | Sigma-Aldrich | D0550 | Used in colorimetric determination of reducing sugars |
4 g Laminaritetraose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM4 | High purity laminaritetraose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
5 g Laminaripentaose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM5 | High purity laminaripentaose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
95% Absolute ethanol | Sigma-Aldrich | 107017 | Ethanol absolute for analysis |
acetic acid | Sigma-Aldrich | B00063 | Acetc acid glacial 100% for analysis (contains acetic acid) |
Azo-CM-Cellulose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | S-ACMC | The polysaccharide is dyed with Remazolbrilliant Blue R to an extent of approx. one dye molecule per 20 sugar residues. |
Beta glucan (barley) | Megazyme (Wicklow, Ireland) | G6513 | A powdered substrate, less soluble in water. Used in determining β-1,3-glucanase activity. |
Bio-Rad Protein Assay Dye | Bio-Rad Laboratories, South africa | 500-0006 | Colorimetric assay dye, concentrate, for use with Bio-Rad Protein Assay Kits I and II |
Bovine serum albumin (BSA) | Gibco Europe | 810-1018 | For Laboratory use only |
Citrate acid | Sigma-Aldrich | C0759 | For Life Science research only. Not for use in diagnostic procedures. |
CM-curdlan | Megazyme (Wicklow, Ireland) | P-CMCUR | Powdered substrate for determining β-1,3-glucanase activity. Insoluble in water. |
D-Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | For Life Science research only. Not for use in diagnostic procedures. |
Guaiacol | Sigma-Aldrich | G5502 | Oxidation indicator. Used for determining peroxidase activity. |
Hydrogen peroxide | BDH Laboratory Supplies, England | 10366 | Powerful oxidising agent. |
Mikskaar Professional Substarte | Mikskaar (Estonia) | NI | Peat moss-based seedling substrate. |
Multifeed fertiliser (5.2.4 (43)) | Multifeed Classic | B1908248 | A water soluble fertiliser for young developing plants and seedlings with a high phosphorus (P) requirement to ensure optimum root development. |
Naphthol | Merck, Germany | N2780 | Undergoes hydrogenations in the presence of a catalyst. |
Phenol | Sigma-Aldrich | 33517 | Light sensitive. For R&D use only. Not for drug, household, or other uses. SDS available |
Potassium sodium tartrate tetrahydrate (Rochelle salt) | Sigma-Aldrich | S2377 | used in the preparation of 3,5-dinitrosalicylic acid solution used in the determination of the reducing sugar. |
Silica plate (TLC Silica gel 60 F254) | Sigma-Aldrich | 60778-25EA | Silica gel matrix, with fluorescent indicator 254 nm |
Sodium hydroxide | Sigma-Aldrich | S8045 | For R&D use only. Not for drug, household, or other uses. |
Sodium metabisulfite | Sigma-Aldrich | 31448 | Added as an antioxidant during the preparation of 3,5-dinitrosalicylic acid solutions. |
Sodium phosphate dibasic heptahydrate | Sigma-Aldrich | S9390 | Used as a buffer solution in biological research to keep the pH constant. |
Sodium phosphate monobasic heptahydrate | Sigma-Aldrich | 71500 | An inorganic compound, which is soluble in water. Used as a reagent in the development of silicate-based grouts. |
Statistical analysis software | TIBCO Statistica | version 13.1 | |
Sulfuric acid | Merck, Darmstadt, Germany | 30743 | Sulfuric acid 95-97% for analysis of Hg, ACS reagent. |
Tris-HCl | Sigma-Aldrich | 10812846001 | Buffering agent in incubation mixtures. It has also been used as a component of lysis and TE (Tris-EDTA) buffer. For life science research only. Not for use in diagnostic procedures. |
UV–Visible Spectrophotometer | GENESYS 120 | ||
NI = not identified. |
.