ここでは、高吸水性ポリマーベースの独立栄養系でアーバスキュラー菌根菌を接種および観察するためのシンプルで安価な技術について説明します。
アーバスキュラー菌根(AM)菌類は、植物の根との恒久的な関連と根圏での繁殖のために、操作や観察が困難です。通常、AM菌は、独立栄養宿主を用いたポット培養においてin vivo 条件下で培養するか、またはペトリ皿内のRi Transfer-DNA形質転換根(従属栄養宿主)を用いた in vitro 条件下で培養します。さらに、ポットカルチャーでのAM菌の培養は、不透明で非滅菌の環境で行われます。対照的に、 in vitro 培養では、無菌で透明な環境でAM菌を増殖させます。最近、高吸水性ポリマーベースの独立栄養システム(SAP-AS)が開発され、それぞれの制限(不透明度と従属栄養ホスト、無菌性)を回避しながら、両方の方法の利点を組み合わせることが示されています。ここでは、SAP-ASでのAM菌の簡単な調製、単一胞子接種、および観察のための詳細なプロトコルを紹介します。ペトリ皿を改造することで、現在の in vivo および in vitro 技術では困難または不可能であった高解像度の写真およびビデオ観察が生きた標本で可能になりました。
アーバスキュラー菌根(AM)菌類(Glomeromycotina)は、気管植物による陸生土壌の植民地化に重要な役割を果たした可能性のある古代の植物の根共生生物(~500 Ma 1,2)です。AM菌類と気管植物との間のこの長い共進化は、アーバスキュラー菌根を王国間共生の傑作として位置付けています。AM菌糸は、菌根ネットワーク4を介して新しい宿主に栄養素が持ち越されるなど、宿主が土壌栄養素3を探す能力を大幅に向上させます。菌糸ネットワークは土壌構造を改善し、グロマリンの生産は土壌侵食を減らすことができます5。大気中の炭素の一部が菌類の根の共生生物に移動すると、土壌の炭素隔離が増加します6。全体として、AM菌類は非生物的ストレスと生物的ストレスの両方に対する植物の回復力を向上させるため、農業生態学でかなりの注目を集めています7。実際、AM菌類に優しい農業管理慣行は、作物生産のための化学物質投入物の使用を減らし、土壌有機炭素含有量を改善する可能性を秘めており、これは農家が持続可能な農業慣行への移行と気候変動との闘いに関する国内および国際的なコミットメントを遵守するために管理慣行に統合する必要がある重要な目標です。
しかし、AM菌類は土壌微視的な菌類であり、生物栄養や根圏の分布が偏っているため、その研究は困難です。土壌は、その不透明性、ニッチの巨大な多様性、およびあらゆる規模での多栄養相互作用のために、研究が最も難しいビオトープの1つです。したがって、AM菌の単離、増殖、および特性評価は困難です。20世紀 半ばまでは、胞子果皮を形成するAM菌種のみが特徴づけられていた8。しかし、AM真菌種の大部分は、直径が~20μmから~500μmの範囲の非胞子結実胞子を生成します。土壌湿式ふるい分け技術9 の記載は、これらのAM真菌種を記述する道を開き、それ以来、種の説明の割合が増加しています。それにもかかわらず、AM菌類はDikaryaと比較して小さな種のグループを表しています。
トラップ培養、すなわち、ターフェイスやバーミキュライトなどのオートクレーブ材料と宿主(ネギ、オオバコ)の滅菌種子で満たされたポットのAM真菌胞子を含む胞子または環境土壌サンプルの接種は、制御された条件下でAM菌を増殖させる10番目の方法です。ただし、接種の成功は、染色後に根の断片にアーバスキュールが存在するかどうかを調べるか、サブサンプルまたはポット全体を湿式ふるい分けして胞子を分離することによってのみ評価できます。通常、ポットカルチャーの分析前に少なくとも6〜12週間はシステムを乱さないことをお勧めします。この培養技術は、最も知られているAM真菌種の繁殖に適していますが、真菌共生生物の生観察は不可能であり、特に単一の胞子培養を試みる場合、接種の成功は不確実です。
それどころか、AM菌類の in vitro 増殖は、培地11の透明性のおかげで生きたまま監視することができるが、この培養技術では、無菌環境で機能するためには、形質転換された根の利用可能性と培地中の炭素の存在が必要である。胞子は滅菌する必要があり、従属栄養宿主との関連とともに、既知のAM真菌種のほとんどがこの技術を使用してうまく増殖しません。
したがって、現在の技術を使用したAM菌の増殖は、ほとんどの研究室で確立され、広く使用されていますが、AM菌の研究にはいくつかの制限があります。Paré et al. (2022)12 は、透明な高吸水性ポリマー (SAP) を植物全体と組み合わせて使用し、AM 菌を増殖させる in vivo 技術を開発しました。SAPベースの独立栄養システム(SAP-AS)として設計されたこの技術は、シンプルで安価で、ポットカルチャー(独立栄養宿主との関連、非滅菌条件)と in vitro カルチャー(透明培地、共生発達のライブモニタリング)の利点を兼ね備えています。ここでは、単一胞子接種による培養のセットアップ方法と、SAP-ASを使用してエクストララジカル菌糸体の高倍率観察を行う方法を説明するプロトコルを紹介します。具体的には、2コンパートメントのペトリ皿の改造方法、養液の調製方法、高吸水性樹脂(SAP)の調製方法、苗木の調製方法、SAP-ASの組み立て方法と単一胞子の接種方法、胞子の発芽前処理、共生の進行のライブモニタリングの方法などについて述べています。
接種はプロトコルの最も重要なステップであり、押し出しガラスパスツールピペットは、AM菌の単一胞子を正確に操作しながらその完全性を維持するための優れたツールであることが証明されました。押し出しガラスパスツールピペットは、キャンドルやブンゼンバーナーの炎を使って簡単に成形でき、ピペットで移動する胞子のサイズに合わせて開口部を実体顕微鏡で調整できます。AM真菌胞子のサイズに合わせたツールで胞子を操作し(補足図1)、宿主植物の根が胞子が沈着するNitex膜に到達するのに十分な長さになったときにSAP-ASを接種することが重要です。
SAP-ASは、実験要件に簡単に適応できます。より大きなシャーレは、マルチコンパートメントを使用して、例えば、密接に関連した菌株間または異なる種類のAMF間の相互作用を監視したり、化学的(pH)または生物学的環境(線虫、細菌、真菌の導入)を変更したりするために使用できます。さまざまな菌栄養宿主植物を使用して、AM菌に光合成物を提供することもできます。栄養溶液mMS-1は、BécardとFortin(1988)15 によって記載された最小(M)培地レシピから、炭素源を制限するためのスクロース、ビタミン、およびバクト寒天を差し引いたものに由来しました。ただし、SAP-ASは、実験目的に応じて、さまざまな栄養溶液を補充できます。
SAP-ASでのAM菌の繁殖には、定期的な水やりが必要です。バーミキュライトとSAPの量が限られているため、特に標準的な2コンパートメントのペトリ皿(直径10cm)では、根とAM菌が湿度の変動にさらされます。拡張する能力、つまり SAP グレインの透明性は、時間の経過とともに低下します。実際、栄養溶液からの陽イオンの存在は、アクリレートネットワークの拡大を徐々に制限し、数か月後にSAPの交換が必要になります。さらに、ペトリ皿が光から適切に保護されていないか、水をやりすぎていると、緑藻やカビが時間の経過とともに成長する可能性があります。
現在までに、SAP-ASでは7種類のAM菌の培養に成功していますが、これはポットカルチャーで増殖できるAM菌種の数をはるかに下回っています。しかし、SAP-ASの生物的条件と非生物的条件はどちらもポットカルチャーの条件と非常によく似ており、他のAM真菌種がSAP-ASで繁殖できる可能性があります。SAP-ASでの胞子の直接接種は、根の滲出液および/または細菌の存在により、天然土壌の根圏の環境条件に近い環境条件を提供する可能性があります。これは、発芽胞子の接種よりも好ましいはずです。.さらに、AMF内で胞子の発芽を引き起こす条件はまだ十分に理解されていないため、mMS-1栄養溶液で水和したSAPは、他のAM真菌種の胞子の発芽に適応しない可能性があります。mMS-1栄養溶液で水和したSAPでの胞子発芽を試験し、 R. irregularis inoculumのみを使用して接種ステップで生存可能な胞子を特異的に選択しました。
AM共生の進展の接種とモニタリングは、SAP-ASで簡単に行うことができます。改良された2コンパートメントのペトリ皿は、異なるAM真菌種の培養を可能にします。Paré et al.12 は、6つの属と3つの科から7つの異なるAMF種を繁殖させました。2コンパートメントのペトリ皿の改造は、安価な工具で簡単に行うことができます。SAP-ASの調製・保守に必要な材料(バーミキュライト、SAP、パスツールピペットなど)や試薬(mMS-1)のコストや数量が限られているため、最小限のコストで大量のSAP-ASを管理することができます。また、SAP-ASを積み重ねることができるため、ポットカルチャーと比較してAM菌類培養物のフットプリントが大幅に削減されます。たとえば、50 個の SAP-AS (10 個入り 5 スタック) を 1 m の長さのシェルフに収めることができます (補足図 2)。これらの機能により、SAP-ASは、高校の実験コースや大学の学部レベルでAM共生を教えることに適したシンプルで安価な技術となっています。コロニーを形成したSAPの粒は、新しいSAP-ASまたはポットカルチャーの接種に使用できます。
ペトリ皿の底の後ろにカバースリップの存在は、超ラジカル真菌構造の高解像度の写真とビデオを可能にします。細胞質の流れは、自然条件に非常に近い生活条件下で簡単に研究できます。これは、菌糸体に関連するAM菌類の機能(栄養素、水輸送、土壌構造など)の研究や、菌糸の形態形成の研究にとって非常に重要です。
AMFは、植物の根と根圏内での生物学的サイクルを完了します。土壌微生物の研究は、土壌環境を観察することの固有の困難さのために複雑です。SAP-ASの主な目的は、AM菌の増殖のために根圏にできるだけ近い環境を再現し、AM菌の発達を詳細に観察する能力を維持することです。これは非滅菌状態を意味するため、腐生性微生物の増殖を避けるために、利用可能な炭素の量を制限する必要があります。根圏におけるAM菌の行動に関する知識はまだ非常に限られており、SAP-ASは、エクストララディカル環境で採餌する能力、胞子産生、および根の定着に関して、種間の詳細な比較を行う可能性を提供します。これは、バクテリア、線虫、原生生物、根真菌病原体などの他の土壌種との相互作用を追加することでさらに複雑になる可能性があり、SAP-ASのおかげで土壌微生物叢の相互作用に関する知識を向上させることができます。
The authors have nothing to disclose.
ご提案いただいた2名の匿名のレビュアーに感謝いたします。この研究の資金は、プロジェクトJ-002295(AAFCの生物学的コレクションの管理と強化)の下で、カナダ農業・農業食品省(AAFC)によって提供されました。
100 x 15 mm Stackable Bi-Plate | Kord Valmark | 1204U09 | https://www.thomassci.com/Laboratory-Supplies/Petri-Dishes/_/100-x-15-mm-Stackable-Bi-Plate |
12-well plate | Greiner Bio-one | 665180 | https://shop.gbo.com/en/row/products/bioscience/cell-culture-products/cellstar-cell-culture-multiwell-plates/665180.html |
18 mm round glass coverslips | Fisher Scientific | 12-545-100 | https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-cover-glasses-circles-11/12545100#?keyword=12-545-100 |
20 mL Syringe PP/PE without needle | Millipore Sigma | Z683620-100EA | https://www.sigmaaldrich.com/CA/en/product/aldrich/z683620?utm_source=google&utm_medium= cpc&utm_campaign=20674735406 &utm_content=157607444391&gc lid=Cj0KCQiA5rGuBhCnARIsAN11 vgQOT_WPRg9WFyBEyoO4b0x1 -F7Tks4houU7VTRS5EiYM9l0F-B oL7saAmFoEALw_wcB |
Acupuncture needle | Lierre | A143-LP1-3075 | https://www.lierre.ca/products/lierre-plus-acupuncture-needles-100pcs?gad _source=1&gclid=Cj0KCQiA5rGuBh CnARIsAN11vgTwupmw51UTdR k9cKr4ewi12W3dyVikenzH3sjdUB4 g41G-_KnvppoaAkbTEALw_wcB& utm_campaign=PMax-needles&utm_content=shopify_CA_ 5213169090694_35001500991622 &utm_medium=cpc&utm_source= google&variant=35001500991622 |
Blotting paper | FLINN | FB0678 | https://www.flinnsci.ca/blotting-paper-12-x-19-pkg.-of-10/fb0678/ |
Commercial or scientific blender or kitchen hand blender | kitchenaid | KHBV53DG | https://www.kitchenaid.ca/en_ca/countertop-appliances/hand-blenders/hand-blender-products/p.variable-speed-corded-hand-blender.khbv53dg.html |
Dremel 199 Carving Bit | Dremel | 2615000199 | https://www.dremel.com/ca/en/p/199-2615000199 |
Dry SAP medium granulometry 1–2 mm | HORTA-SORB MD | 00810085242789 | https://www.horticulturalalliance.com/product/horta-sorb-md-granule/ |
Feather Stainless-Steel Blades for Dissecting Knife Handles | Fisher Scientific | 08-916-5B | https://www.fishersci.ca/shop/products/graham-field-stainless-steel-blades-dissecting-knife-handles-8/089165b |
Glass Pasteur pipettes 230 mm | Kimble | RK-25554-14 | https://www.coleparmer.ca/i/dwk-life-sciences-kimble-disposable-pasteur-pipettes-plugged-end-borosilicate-glass-230-mm-1000-cs/2555414 |
Ink | Sheaffer | 94321 | https://www.amazon.com/Sheaffer-Skrip-Bottled-Black-94231/dp/B002IKKKUU |
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Parafilm | Avantor/vwr | 470201-930 | https://www.avantorsciences.com/ca/en/product/8882964/parafilm |
Plantago lanceolata seeds | ecoumene | NA | https://www.ecoumene.com/produit/semences/herbacees/plantain-lanceole-bio/ |
Polyvinyl alcohol-lactic acid-glycerol (PVLG). | NA | NA | https://invam.ku.edu/recipes |
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Silicone sealant | Aqueon | 100165003 | https://www.aqueon.com/products/aquariums/silicone-sealant |
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Vermiculite | PRO-MIX | 4981110 | https://www.canadiantire.ca/fr/pdp/vermiculite-pro-mix-9-l-0597936p.0597936.html |
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